使用Dockerfile安装R语言镜像
Dockerfile:
FROM centos7
WORKDIR /opt/mids/
COPY Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh .
RUN sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b -p /opt/mids/R && \
/opt/mids/R/bin/conda init
RUN /opt/mids/R/bin/conda clean -y -a && \
rm -f Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
ENV PATH=/opt/mids/R/bin:$PATH \
LANG=en_US.UTF-8
RUN conda install -y R && \
conda install -y r-rjson && \
conda install -y r-rserve && \
conda install -y r-ggplot2 && \
conda install -y r-stringi && \
conda install -y r-rjava && \
conda install -y r-matrix && \
conda install -y r-forecast
RUN conda clean -y -a
COPY Rserve.r /opt/mids/R/bin/
VOLUME /opt/mids/R
其中,LANG=en_US.UTF-8解决R脚本中有中文导致编码异常问题。
进入R异常:
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
Error: package or namespace load failed for 'utils':
.onLoad failed in loadNamespace() for 'utils', details:
call: system(paste(which, shQuote(names[i])), intern = TRUE, ignore.stderr = TRUE)
error: error in running command
Error: package or namespace load failed for 'stats':
.onLoad failed in loadNamespace() for 'utils', details:
call: system(paste(which, shQuote(names[i])), intern = TRUE, ignore.stderr = TRUE)
error: error in running command
During startup - Warning messages:
1: package 'utils' in options("defaultPackages") was not found
2: package 'stats' in options("defaultPackages") was not found
解决方案:
You're missing "which" I think.
In this code chunk system(paste(which, shQuote(names[i])), intern = TRUE, ignore.stderr = TRUE)
, which
is an object from Sys.which
and its value is the string "/usr/bin/which".
You should try installing which
.
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