真核转录组(denovo/resequencing)及案例分析
参考:
Paper这个东西是多么的诱人,可以毕业,可以评职称,可以拿绩效。
现在的文章都是有套路的,也不能说是水文,但大多是一个模式下的产物,真正有价值的好文其实是少之又少的。
大部分的Paper都是八股文,只需要填词就好了。
Transcriptome analysis of leaves, roots and flowers of Panax notoginseng identifies genes involved in ginsenoside and alkaloid biosynthesis - BMC Genomics201516:265 DOI: 10.1186/s12864-015-1477-5
转录组测序研究人参的皂苷和生物碱合成的基因
普及词汇:Transcriptome(转录组),Panax notoginseng(三七、田七、人参),ginsenoside (人参皂苷),alkaloid(生物碱)
triterpene saponins(皂苷)、
研究方法及结果:转录组分析了三个组织(叶、根、花),组装后有107,340 unigenes,9,908 unigenes were assigned to 135 KEGG pathways,270 unigenes were identified to be involved in triterpene saponin biosynthesis。
深度剖析:本文做了什么呢?没有处理,直接取了三种组织的样品,做转录组测序分析,组装,得到unigenes;然后就是与已知的数据库(KEGG)比对,搜索出了一大堆的注释信息,挑出注释到关键代谢通路上的unigenes;最后做一个验证。
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