conda 添加bioconda源,创建/删除/重命名环境
1.conda安装
在https://repo.continuum.io/miniconda/选择conda版本
wget "https://repo.continuum.io/archive/Miniconda2-4.5.12-Linux-x86_64.sh" bash Miniconda2-4.5.12-Linux-x86_64.sh source ~/.bashrc
2.添加镜像源
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels defaults
conda config --add channels r
conda config --add channels bioconda
3.添加国内镜像源
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --set show_channel_urls yes
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/ # bioconda
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --set show_channel_urls yes conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
4.创建新环境
conda create -n py python=3.5
5.删除新环境
conda remove -n py --all
6.重命名环境
conda create -n py3.5 --clone py conda remove -n py3.5 --all conda info -e
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