final model for bioinformatics

模拟真实的生物系统，从有机分子到细胞，到组织，到器官，到个体，到家系，到群体。

正确的设计结构，可拓展性，可塑性。

良好的可视化。

面向对象的编程，游戏引擎。

基因结构class

细胞结构class

组织结构class

个体结构class

我们都是被实例出来的某个类地一个对象。

真正的个性化医疗的最终目的不就是把人给数字化吗？只有建立一个这种模型才算是真正的数字化。

数字化的最大好处就是低成本的模拟未来，比如根据你的遗传信息判断你未来患病的可能。

这个模型可以根据我们的数据来不断的重塑。

这个系统必须包括我们现在已经发现的基本事实

  • 元素周期
  • 遗传法则
  • 发育法则
  • 化学法则

基于open chromatin data的motif enrichment

需要整合的数据库：

  • 基因组
  • 表观组
  • 转录组
  • 蛋白组
  • 代谢组

PPI network

TF

各种调控RNA

首先把细胞内这个模型给建好

然后就是细胞间，组织间，个体间

digit-hs.com

最适合独立开发者的五大游戏引擎

final model for bioinformatics的更多相关文章

  1. keras系列︱Sequential与Model模型、keras基本结构功能（一）

    引自:http://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/72857454 中文文档:http://keras-cn.readthedocs.io/ ...

  2. 算法（algorithm）、模型（model）与框架（framework）

    模型对应的数学公式,公式中往往有待学习得到的参数,因此在进行训练或者学习时,首先初始化这部分参数(0 或标准正太分布): 学习之前的初始化:initial model: 学习完成之后的模型:final ...

  3. theano学习

    import numpy import theano.tensor as T from theano import function x = T.dscalar('x') y = T.dscalar( ...

  4. Code First ：使用Entity. Framework编程(7) ----转发 收藏

    第7章 高级概念 The Code First modeling functionality that you have seen so far should be enough to get you ...

  5. r-cnn学习（四）：train_faster_rcnn_alt_opt.py源码学习

    论文看的云里雾里,希望通过阅读其代码来进一步了解. 参考:http://blog.csdn.net/sloanqin/article/details/51525692 首先是./tools/train ...

  6. RankLib参数翻译

    写在前面,metric2t指标详解: NDCG(Normalized discounted cumulative gain)即DCG/IDCGCG(cumulative gain)DCG(Discou ...

  7. （转）Image Segmentation with Tensorflow using CNNs and Conditional Random Fields

    Daniil's blog Machine Learning and Computer Vision artisan. About/ Blog/ Image Segmentation with Ten ...

  8. Theano2.1.3-基础知识之更多的例子

    来自:http://deeplearning.net/software/theano/tutorial/examples.html More Examples 现在,是时候开始系统的熟悉theano的 ...

  9. Theano2.1.7-基础知识之设置的配置和编译模式

    来自:http://deeplearning.net/software/theano/tutorial/modes.html Configuration Settings and Compiling ...

随机推荐

  1. Signalr实时通讯

    我们直接来干货~~~~~~觉得好推荐一下哈  研究不易 参考--https://www.jb51.net/article/133202.htm  这是基本教程 下面是重点: 如果你想允许跨域 具体代码 ...

  2. FB面经Prepare: Bipartite a graph

    input friends relations{{1,2}, {2,3}, {3,4}} 把人分成两拨,每拨人互相不认识, 所以应该是group1{1,3}, group2{2,4} 这道题应该是ho ...

  3. 北京大学Cousera学习笔记--4-计算导论与C语言基础--计算机的基本原理-程序运行的基本原理

    已知:电路能完成计算 怎么计算:设计好很多个原子电路,需要的时候就把他们临时组装在一起--ENIAC 升级:冯诺依曼-EDVAC(现在的计算机都是) 1.通过某种命令来控制计算机.让计算机按照这种命令 ...

  4. caffe程序中出现的db.cpp:#line（行号） unknown database backend问题

    报错原因:lmdb不可用 解决方法:Makefile.config将此处更改 CPU_ONLY := 1 #如果只使用CPU的话就改这个,使用GPU的不需要改 USE_OPENCV := 1 #有安装 ...

  5. IT题库3-线程实现的方式

    1.继承Thread类创建线程 Thread类本质上是实现了Runnable接口的一个实例,代表一个线程的实例.启动线程的唯一方法就是通过Thread类的start()实例方法.start()方法是一 ...

  6. Django session/cookie

    一.cookie  常用方法: 获取:  需要在消息体设置值 1:设置cookie def login(request): if request.method == "POST": ...

  7. Color Schema 配色随笔

    附pdf文件: ColorSchema.pdf

  8. git 本地提交代码到 github 远程库，没有弹框 github login

     git 本地提交代码到 github 远程库,没有弹框 github login:  原因: win10 有个凭据管理器,给保存了历史登陆用户名密码,导致无法切换用户. 解决办法: 删除历史登陆用户 ...

  9. Nginx处理请求的11个阶段（agentzh的Nginx 教程学习记录）

    Nginx 处理请求的过程一共划分为 11 个阶段,按照执行顺序依次是 post-read.server-rewrite.find-config.rewrite.post-rewrite.preacc ...

  10. C++中的纯虚方法

    在学习数据结构中优先级队列时遇到纯虚方法的定义,一时没想起来,便查了一下. 1.纯虚方法解决什么样的问题,为什么要设计出纯虚方法? 考虑下面的需求,基类声明了一个方法,这个方法只针对具体的子类才有意义 ...