python处理nii格式文件
网上已经有很多代码了,但是注释的都不全,看起来很费解,我自己加了一些注释,重新发出来,尽可能的通俗易懂
读取前需要先安装库
pip install nibabel
pip install matplotlib
from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D
from nibabel import nifti1
import nibabel as nib
from matplotlib import pylab as plt
import matplotlib
# matplotlib.use('TkAgg')
# 文件名,nii或nii.gz
example_filename = 'xxxx'
img = nib.load(example_filename)
# 打印文件信息
print(img)
print(img.dataobj.shape)
#shape不一定只有三个参数,打印出来看一下
width, height, queue = img.dataobj.shape
# 显示3D图像
OrthoSlicer3D(img.dataobj).show()
# 计算看需要多少个位置来放切片图
x = int((queue/10) ** 0.5) + 1
num = 1
# 按照10的步长,切片,显示2D图像
for i in range(0, queue, 10):
img_arr = img.dataobj[:, :, i]
plt.subplot(x, x, num)
plt.imshow(img_arr, cmap='gray')
num += 1
plt.show()
其他操作,后续再补充
python处理nii格式文件的更多相关文章
- python 生成json格式文件,并存储到手机上
上代码 #!/usr/bin/env python # -*- encoding: utf-8 -*- import json import os import random "" ...
- 用python将SQL格式文件改成自己想要的格式
INSERT INTO TTT (NSAME, ID, AGE) VALUES ('AAA', '201023210816', '22'); 将上面的SQL格式改成以下的格式 AAA|20102321 ...
- 如何用python读写CSV 格式文件
工作中经常会碰到读写CSV文件的情况.记录下,方便自己以后查询并与大家一起分享: 写CSV文件方法一: import csv #导入CSV with open("D:\eg ...
- 纯Python给ulaw wav文件加头
最近在处理wav相关文件,碰见一工具产生的ualw文件不带header,顺手用python给wav格式文件加头处理,让普通播放器也能播放. (原文:http://www.cnblogs.com/ryh ...
- 针对格式文件,Python读取一定大小的文件内容
由数据库导出的数据是格式化数据,如下所示,每两个<REC>之间的数据是一个记录的所有字段数据,如<TITLE>.<ABSTRACT>.<SUBJECT_COD ...
- 如何用python在Windows系统下,生成UNIX格式文件
平时测试工作中,少不了制造测试数据.最近一个项目,我就需要制造一批可在UNIX下正确读取的文件.为确保这批文件能从FTP下载成功,开发叮嘱我:“文件中凡是遇到换行,换行符必须是UNIX下的LF,而不是 ...
- Python处理json格式的数据文件(一些坑、一些疑惑)
这里主要说最近遇到的一个问题,不过目前只是换了一种思路先解决了,脑子里仍然有疑惑,只能怪自己太菜. 最近要把以前爬的数据用一下了,先简单的过滤一下,以前用scrapy存数据的时候为了省事也为了用一下它 ...
- Python数据写入csv格式文件
(只是传递,基础知识也是根基) Python读取数据,并存入Excel打开的CSV格式文件内! 这里需要用到bs4,csv,codecs,os模块. 废话不多说,直接写代码!该重要的内容都已经注释了, ...
- python读取与写入csv,txt格式文件
python读取与写入csv,txt格式文件 在数据分析中经常需要从csv格式的文件中存取数据以及将数据写书到csv文件中.将csv文件中的数据直接读取为dict类型和DataFrame是非常方便也很 ...
随机推荐
- pyCharm中设置查看运行过程中的变量实时情况
1.点击运行栏的这个灰色向下剪头: 2.单击“Edit Configurations”, 3.在出现的窗口上,勾选上:“Show command line afterwards” 或 “run wit ...
- Java并发基础类AbstractQueuedSynchronizer的实现原理简介
1.引子 Lock接口的主要实现类ReentrantLock 内部主要是利用一个Sync类型的成员变量sync来委托Lock锁接口的实现,而Sync继承于AbstractQueuedSynchroni ...
- IDEA--安装
1:下载IDEA 官网:http://www.jetbrains.com/idea/download/#section=windows(选择下载.zip) 2:解压 3:破解: 1)在C:\Windo ...
- HTTP协议(二):作用
前言 上一节我们简单介绍了一下TCP/IP协议族的基本情况,知道了四大层的职责,也了解到我们这一族的家族成员以及他们的能力. 无良作者把我这个主角变成了配角,让我很不爽,好在我打了作者一顿,没错,这次 ...
- 19 01 12 javascript 定时器 封闭函数
定时器 定时器在javascript中的作用1.制作动画2.异步操作3.函数缓冲与节流 定时器: setTimeout 只执行一次的定时器 clearTimeout 关闭只执行一次的定时器 setIn ...
- Microsoft SQL server Management Studio工具报错“应用程序的组件中发生了无法处理的异常”
解决办法 打开目录: C:\Documents and Settings\Administrator\Application Data\Microsoft\Microsoft SQL Server\1 ...
- Img转base64
function getBase64Image(img) { var canvas = document.createElement("canvas"); canvas.width ...
- 吴裕雄--天生自然TensorFlow2教程:Broadcasting
Broadcasting可以理解成把维度分成大维度和小维度,小维度较为具体,大维度更加抽象.也就是小维度针对某个示例,然后让这个示例通用语大维度. import tensorflow as tf x ...
- Ajax请求文件下载操作失败的原因和解决办法
使用Poi做excel表格导出功能,第一个想到的就是用Ajax来发送请求,但是Ajax和后台代码都执行了,就是无法下载文件. 前台代码 function exportExl(){ var form = ...
- Odd sum (对本菜鸡来说是个极坑题)
https://codeforces.com/problemset/problem/797/B time limit per test 1 second memory limit per test 2 ...