DNA序列

  题目大意:给你m串字符串,要你找最长的相同的连续字串

  这题暴力kmp即可,注意要按字典序排序,同时,是len<3才输出no significant commonalities

  

 #include <iostream>
#include <functional>
#include <algorithm>
#include <string.h>
#define MAX 60 using namespace std; typedef char* _String;
typedef int Position;
static char str[][],ans[];
static int _next[]; bool KmpSearch(_String, _String, const int);
void Get_Next(_String, const int);
void Search(const int); int main(void)//暴力枚举第一行
{
int case_sum, m;
//freopen("in.txt", "r", stdin);
scanf("%d", &case_sum); while (case_sum--)
{
scanf("%d", &m);
getchar(); for (int i = ; i < m; i++)
scanf("%s", str[i]);
Search(m);
}
return EXIT_SUCCESS;
} void Search(const int m)
{
int len, ans_len = -, pos, if_match;
char tmp; for (len = ; len <= MAX; len++)
{
for (pos = ; pos + len <= MAX; pos++)
{
if_match = ;
Get_Next(&str[][pos], len);
for (int i = ; i < m; i++)
if_match += KmpSearch(str[i], &str[][pos], len);
if (if_match == m - && len >= ans_len)
{
if (len == ans_len)
{
tmp = str[][pos + len];
str[][pos + len] = '\0';
if (strcmp(&str[][pos], ans) < )
strcpy(ans, &str[][pos]);
str[][pos + len] = tmp;
}
else if (len > ans_len)
{
ans_len = len;
tmp = str[][pos + len];
str[][pos + len] = '\0';
strcpy(ans, &str[][pos]);
str[][pos + len] = tmp;
}
}
}
}
if (ans_len < )
printf("no significant commonalities\n");
else
printf("%s\n", ans);
} bool KmpSearch(_String str_m, _String text, const int t_len)
{
Position i = , j = ; while (i < MAX && j < t_len)
{
if (j == - || str_m[i] == text[j])
{
i++;
j++;
}
else j = _next[j];
}
if (j == t_len)
return true;
else
return false;
} void Get_Next(_String text, const int t_len)
{
Position i = , k = -;
_next[] = -; while (i < t_len)
{
if (k == - || text[i] == text[k])
{
i++;
k++;
_next[i] = text[i] != text[k] ? k : _next[k];
}
else k = _next[k];
}
}

  

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