RepeatMasker
1、简介
2、本地安装
RepeatMasker的更多相关文章
- RepeatMasker使用中的问题
RepeatMasker在运行时会先产生如下一个中间文件夹如RM_23346.WedAug301137422017,最后生成结果文件,例如.out,.masked,.tbl等 软件特性:软件运行很慢, ...
- RepBaseRepeatMaskerEdition下载 | RepeatMasker
开源的生物信息世界居然有这么个需要注册才能下载的工具,开源世界不是怎么方便怎么来吗? 这个注册真的麻烦,这里上传了一个可以使用的版本. RepBaseRepeatMaskerEdition-20170 ...
- RepeatMasker使用
RM是library-based,通过相似性比对来识别重复序列,可以屏蔽序列中转座子重复序列和低复杂度序列(默认将其替换成N).使用数据库Dfam和Repbase. The Dfam database ...
- 生信 - 从repeatmasker传送门过来的 blast
以前有的是非完整时间写的博客,抽时间需要统一整理一下. 今天在重新装repeatmasker. 整个过程是这样的,有关联的事情有两个. 1. 装repeatmasker需要各种Prerequisite ...
- 【基因组注释】RepeatMasker和RepeatModeler安装、配置与运行避坑
目录 1.conda安装 2.配置RepBase 3.RepeatMasker避坑 4.RepeatProteinMask避坑 5.RepeatModeler避坑 6.自定义重复序列库 后记 1.co ...
- 生物信息大数据&数据库(NCBI、EBI、UCSC、TCGA)
想系统的学习生信数据库可以先看一下北大的公开课,有一章专门讲的数据库与软件: -生物信息学:导论与方法 北大\ 生物信息数据库及软件资源 一个优秀的生信开发者能够解决如下问题: 如何鉴定一个重要的且没 ...
- GATK使用说明-GRCh38(Genome Reference Consortium)(二)
Reference Genome Components 1. GRCh38 is special because it has alternate contigs that represent pop ...
- maker 2008年发表在genome Res
http://gmod.org/wiki/MAKER_Tutorial 简单好用 identify repeats, to align ESTs and proteins to the genome, ...
- perl5
1.perl包加入环境 export PERL5LIB=/export/personal1/wanglh/.software/perl/lib:$PERL5LIB
随机推荐
- (转)使用Flexible实现手淘H5页面的终端适配
原文链接 曾几何时为了兼容IE低版本浏览器而头痛,以为到Mobile时代可以跟这些麻烦说拜拜.可没想到到了移动时代,为了处理各终端的适配而乱了手脚.对于混迹各社区的偶,时常发现大家拿手机淘宝的H5页面 ...
- linux 下的常用操作命令
一,Linux的介绍 略. 二,文件类的常用命令 三,权限类的常用命令
- redis的5种类型和所用命令
数据操作 redis是key-value的数据,所以每个数据都是一个键值对 键的类型是字符串 值的类型分为五种: 字符串string 哈希hash 列表list 集合set 有序集合zset 数据操作 ...
- Faster RCNN原理分析(二):Region Proposal Networks详解
Faster RCNN原理分析(二):Region Proposal Networks详解 http://lib.csdn.net/article/deeplearning/61641 0814: A ...
- 《GPU高性能编程CUDA实战》第四章 简单的线程块并行
▶ 本章介绍了线程块并行,并给出两个例子:长向量加法和绘制julia集. ● 长向量加法,中规中矩的GPU加法,包含申请内存和显存,赋值,显存传入,计算,显存传出,处理结果,清理内存和显存.用到了 t ...
- tensorflow 入门
1. tensorflow 官方文档中文版(下载) 2. tensorflow mac安装参考 http://www.tuicool.com/articles/Fni2Yr 3. 源码例子目录 l ...
- springboot retry
try/catch,while 循环或者定时任务 这样看起来 好 low sping boot retry , 这样代码更简洁 eg: @Retryable(value= {RemoteAcce ...
- leetcode1011
class Solution: def shipWithinDays(self, weights: 'List[int]', D: int) -> int: left = max(weights ...
- JS 时间函数 / 格式化时间戳
处理时间主要使用时间对象 Date , 其提供两个静态方法 Date.now() //获得当前时间戳 Date.parse() //将字符串转化成时间戳 创建对象 new Date(); // 返回当 ...
- wget 递归下载整个网站(网站扒皮必备)
有时间看到别人网站的页面比较漂亮,就想给扒皮下来,学习学习.分享一个我常用网站扒皮命令wget 这个命令可以以递归的方式下载整站,并可以将下载的页面中的链接转换为本地链接. wget加上参数之后,即可 ...