利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式,需要用到“-Oz”和“index”命令,具体如下:

/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz
/bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz

bcftools将vcf生成bgzip和index格式的更多相关文章

  1. Android使用DOM生成和输出XML格式数据

    Android使用DOM生成和输出XML格式数据 本文主要简单解说怎样使用DOM生成和输出XML数据. 1. 生成和输出XML数据 代码及凝视例如以下: try { DocumentBuilderFa ...

  2. 根据日志来源的不同生成不同的index索引

    使用filebeat收集系统日志,不同应用的日志,然后把这些日志传输给Logstash,再然后交由elasticsearch处理,那么如何区分不同的日志来源呢? filebeat.yml配置文件中不启 ...

  3. [shiro学习笔记]第四节 使用源代码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源代码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源代码 shiro官网: http://shiro.ap ...

  4. [shiro学习笔记]第四节 使用源码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本号为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源码 shiro官网: http://shiro.apa ...

  5. bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集

    做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...

  6. ExtJs动态生成treepanel的Json格式

    在节点中加上"checked"属性,会自动生成checkbox. 获取选中节点 var nodeArray = ""; var nodesObj = mytre ...

  7. mysql格式化整数类型时间生成年月日时分秒格式(long或string接收)

    数据库格式: 数据库mysql语句: FROM_UNIXTIME( s.timemodified, '%Y-%m-%d %h:%i:%s' ) 生成结果: 测试sql为: SELECT *, FROM ...

  8. bcftools合并vcf文件

    见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...

  9. PHP生成和获取XML格式数据

    在做数据接口时,我们通常要获取第三方数据接口或者给第三方提供数据接口,而这些数据格式通常是以XML或者JSON格式传输,本文将介绍如何使用PHP生成XML格式数据供第三方调用以及如何获取第三方提供的X ...

随机推荐

  1. npm安裝、卸載、刪除、撤銷發佈包、更新版本信息

    利用npm安裝包: 全局安裝:npm install -g 模塊安裝 局部安裝(可以使用repuire(‘模塊名’)引用):npm install 模塊名稱 如果權限不夠,就是用管理員方式安裝. 本地 ...

  2. 生存模型(Survival Model)介绍

    https://www.cnblogs.com/BinbinChen/p/3416972.html 生存分析,维基上的解释是: 生存分析(Survival analysis)是指根据试验或调查得到的数 ...

  3. vhdl 边沿

    rising_eage falling_eage clock'event and clock='1' 两种方式

  4. PCIE

    ---恢复内容开始--- 高速差分总线.串行总线 每一条PCIe链路中只能连接两个设备这两个设备互为是数据发送端和数据接收端.PCIe链路可以由多条Lane组成,目前PCIe链路×1.×2.×4.×8 ...

  5. openwrt-scripts/config/mconf: Syntax error: “(” unexpected错误解决

    scripts/config/mconf: Syntax error: “(” unexpected错误解决 从其他地方复制而来的openwrt SDK,放在本地执行make menuconfig时出 ...

  6. MyBatis实操进阶版(一)

    MyBatis实操进阶版(一) 目前而言,持久层框架中,在业务实现灵活性上,无可出MyBatis之右者.具体原因,后续将逐步展开 ResultMap元素的设置 配置文件中,ResultMap元素的作用 ...

  7. Typecho——数据库无法连接问题

    报错 对不起,无法连接数据库,请先检查数据库配置再继续进行安装 解决方案 创建数据库 reate database databaseName; 远程权限 开启远程权限 GRANT ALL PRIVIL ...

  8. Android 永久保存简单数据

    转载: http://blog.csdn.net/xzlawin/article/details/45959033 方法1: 存数据: SharedPreferences userInfo = thi ...

  9. SQLSERVER 维护计划无法删除

    数据对网站运营或者企业运营是至关重要的,所以,我们在使用数据库的时候,为了保证数据的安全可靠性,都会做数据库备份,很显然,这个备份,我们不可能每天都去手动备份,SQLServer 数据库就可以提供数据 ...

  10. Matplotlib学习---用mplot3d画莫比乌斯环(Mobius strip)

    mplot3d是matplotlib里用于绘制3D图形的一个模块.关于mplot3d 绘图模块的介绍请见:https://blog.csdn.net/dahunihao/article/details ...