利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式,需要用到“-Oz”和“index”命令,具体如下:

/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz
/bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz

bcftools将vcf生成bgzip和index格式的更多相关文章

  1. Android使用DOM生成和输出XML格式数据

    Android使用DOM生成和输出XML格式数据 本文主要简单解说怎样使用DOM生成和输出XML数据. 1. 生成和输出XML数据 代码及凝视例如以下: try { DocumentBuilderFa ...

  2. 根据日志来源的不同生成不同的index索引

    使用filebeat收集系统日志,不同应用的日志,然后把这些日志传输给Logstash,再然后交由elasticsearch处理,那么如何区分不同的日志来源呢? filebeat.yml配置文件中不启 ...

  3. [shiro学习笔记]第四节 使用源代码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源代码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源代码 shiro官网: http://shiro.ap ...

  4. [shiro学习笔记]第四节 使用源码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本号为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源码 shiro官网: http://shiro.apa ...

  5. bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集

    做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...

  6. ExtJs动态生成treepanel的Json格式

    在节点中加上"checked"属性,会自动生成checkbox. 获取选中节点 var nodeArray = ""; var nodesObj = mytre ...

  7. mysql格式化整数类型时间生成年月日时分秒格式(long或string接收)

    数据库格式: 数据库mysql语句: FROM_UNIXTIME( s.timemodified, '%Y-%m-%d %h:%i:%s' ) 生成结果: 测试sql为: SELECT *, FROM ...

  8. bcftools合并vcf文件

    见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...

  9. PHP生成和获取XML格式数据

    在做数据接口时,我们通常要获取第三方数据接口或者给第三方提供数据接口,而这些数据格式通常是以XML或者JSON格式传输,本文将介绍如何使用PHP生成XML格式数据供第三方调用以及如何获取第三方提供的X ...

随机推荐

  1. Django restframework之Token验证的缺陷及jwt的简单使用

    一.主要缺陷: 1.Token验证是放在一张表中,即authtoken_token中,key没有失效时间,永久有效,一旦泄露,后果不可想象,安全性极差. 2.不利于分布式部署或多个系统使用一套验证,a ...

  2. delphi中adoquery控件中某个字段Onvalidate事件的用法?

    procedure TForm2.ADOQuery1TestFieldValidate(Sender: TField);begin// Sender就是当前字段,可以在这里对Sender字段进行各种操 ...

  3. CentOS 7 vi编辑命令

    用vi打开一个yum文件 vi /usr/bin/yum 按 i 键后  进入insert模式,进入insert模式后才能进行修改 修改完成后 按esc键进入command模式, 然后:wq 保存文件 ...

  4. CSS3之box-sizing属性

    box-sizing本身有三个属性:content-box(默认).border-box和padding-box. content-box:border与padding均不算入width中: bord ...

  5. 训练赛-Eyad and Math

    题意:给你四个数,求出a^b是否小于c^d,是的话输出<,否则输出>; 思路:因为数据很大,所以我们需要降低数据的规模,比如用一个log10()函数,这就能解决了,注意,要用scanf输入 ...

  6. 【C/C++】求解线性方程组的雅克比迭代与高斯赛德尔迭代

    雅克比迭代: /* 方程组求解的迭代法: 雅克比迭代 */ #include<bits/stdc++.h> using namespace std; ][]; ]; void swapA( ...

  7. git 命令使用集锦

    使用git mv重命名文件,而不是delete然后再add文件. git format常用命令: git format-patch -4 //从当前分支最新提交点往下共生成4个补丁 git forma ...

  8. 「UVA10766」Organising the Organisation(生成树计数)

    BUPT 2017 Summer Training (for 16) #6C 题意 n个点,完全图减去m条边,求生成树个数. 题解 注意可能会给重边. 然后就是生成树计数了. 代码 #include ...

  9. 【HDU - 4342】History repeat itself(数学)

    BUPT2017 wintertraining(15) #8C 题意 求第n(n<2^32)个非完全平方数m,以及\(\sum_{i=1}^m{\lfloor\sqrt i\rfloor}\) ...

  10. 概率DP自学

    转自https://blog.csdn.net/zy691357966/article/details/46776199 zy691357966的blog 有关概率和期望问题的研究 摘要 在各类信息学 ...