MeteoInfoLab脚本示例:创建netCDF文件(合并文件)
在MeteoInfoLab中增加了创建netCDF文件并写入数据的功能,这里利用合并多个netCDF文件为一个新的netCDF文件为例。
1、创建一个可写入的netCDF文件对象(下面用ncfile表示),用addfile函数,第一个参数是文件名,第二次参数'c'表示创建新的netCDF文件。
ncfile = addfile(outfn, 'c')
2、添加维(Dimensions),用ncfile的adddim函数,两个参数分别是维名称和维长度。
stn = 26564
stdim = ncfile.adddim('station', stn)
3、添加全局属性,用ncfile的addgroupattr函数,两个参数分别是属性名称和属性值。
ncfile.addgroupattr('Conventions', 'Unidata Observation Dataset v1.0')
4、添加变量,用ncfile的addvar函数,三个参数分别是变量名称、变量数据类型和变量维列表。并给变量添加一些属性用变量对象的addattr函数。
var = ncfile.addvar('streamflow', 'float', [tdim, stdim])
var.addattr('long_name', 'River Flow')
var.addattr('units', 'meter^3 / sec')
5、创建netCDF文件,上面的步骤都是对netCDF文件的设置,完成之后需要create函数表示设置已完成,可以开始写数据了。
ncfile.create()
6、写数据,用ncfile的write函数,参数分别是变量和要写入的数组,origin是各维起点的列表,可以控制写入某个变量的部分数据。如果要写入的数组的维数和变量的维数不一致,需要用reshape函数来确保二者有相同的维数。
ncfile.write(variables[3], flow, origin=origin)
7、关闭netCDF文件,数据写完之后需要关闭netCDF文件。
ncfile.flush()
ncfile.close()
示例脚本程序(合并4个不同时次的netCDF文件为一个新的netCDF文件):
datadir = 'D:/Temp/nc'
outfn = os.path.join(datadir, 'join_file.nc')
#New netCDF file
ncfile = addfile(outfn, 'c')
#Add dimensions
stn = 26564
recdim = ncfile.adddim('recNum', stn)
stdim = ncfile.adddim('station', stn)
iddim = ncfile.adddim('id_len', 11)
tdim = ncfile.adddim('time', 4)
#Add global attributes
ncfile.addgroupattr('Conventions', 'Unidata Observation Dataset v1.0')
ncfile.addgroupattr('cdm_datatype', 'Station')
ncfile.addgroupattr('geospatial_lat_max', '90.0')
ncfile.addgroupattr('geospatial_lat_min', '-90.0')
ncfile.addgroupattr('geospatial_lon_max', '180.0')
ncfile.addgroupattr('geospatial_lon_min', '-180.0')
ncfile.addgroupattr('stationDimension', 'station')
ncfile.addgroupattr('missing_value', -8.9999998E15)
ncfile.addgroupattr('stream_order_output', 1)
#Add variables
variables = []
var = ncfile.addvar('latitude', 'float', [stdim]) #Latitude
var.addattr('long_name', 'station latitude')
var.addattr('units', 'degrees_north')
variables.append(var)
var = ncfile.addvar('longitude', 'float', [stdim]) #Longitude
var.addattr('long_name', 'station longitude')
var.addattr('units', 'degrees_east')
variables.append(var)
var = ncfile.addvar('altitude', 'float', [stdim]) #Altitude
var.addattr('long_name', 'station altitude')
var.addattr('units', 'meters')
variables.append(var)
var = ncfile.addvar('streamflow', 'float', [tdim, stdim]) #Stream flow - Add time dimension
var.addattr('long_name', 'River Flow')
var.addattr('units', 'meter^3 / sec')
variables.append(var)
tvar = ncfile.addvar('time', 'int', [tdim])
tvar.addattr('long_name', 'time')
tvar.addattr('units', 'hours since 1900-01-01 00:00:0.0')
#Creat netCDF file
ncfile.create()
#Write data
stime = datetime.datetime(2015,8,2,0)
etime = datetime.datetime(2015,8,2,3)
st = datetime.datetime(1900,1,1)
fi = 0
while stime <= etime:
print stime
fn = os.path.join(datadir, stime.strftime('%Y%m%d%H') + '00.CHRTOUT_DOMAIN2')
if os.path.exists(fn):
print '\t' + fn
f = addfile(fn)
hours = (stime - st).total_seconds() // 3600
origin = [fi]
ncfile.write(tvar, array([hours]), origin=origin)
if fi == 0:
lat = f['latitude'][:]
ncfile.write(variables[0], lat)
lon = f['longitude'][:]
ncfile.write(variables[1], lon)
alt = f['altitude'][:]
ncfile.write(variables[2], alt)
flow = f['streamflow'][:]
origin = [fi, 0]
shape = [1, stn]
flow = flow.array.reshape(shape)
ncfile.write(variables[3], flow, origin=origin)
fi += 1
stime = stime + datetime.timedelta(hours=1) #close netCDF file
ncfile.flush()
ncfile.close() print 'Finished!'
对合并后的文件绘图:
f = addfile('D:/Temp/nc/join_file.nc')
lon = f['longitude'][:]
lat = f['latitude'][:]
var = f['streamflow']
flow = var[1,:]
axesm()
mlayer = shaperead('D:/Temp/Map/bou2_4p.shp')
geoshow(mlayer)
levs = arange(0, 0.1, 0.005)
layer = scatterm(lon, lat, flow, levs, edge=False)
colorbar(layer)
t = f.gettime(1)
title('River Flow (' + t.strftime('%Y-%m-%d %Hh)'))
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