SimpleITK 和 Nibabel 区别在于:(nii图像可以看成2维,也可以看成三维)

SimpleITK读取数据是(X,Y,Z)显示,Nibabel读取图像是(Z,Y,X)显示,也就是Nibabel加载的图像会旋转90°,其中X表示通道数,即切片层数。详情

import SimpleITK as sitk
import skimage.io as io def read_img(path):
img = sitk.ReadImage(path)
data = sitk.GetArrayFromImage(img)
return data
#显示一个系列图
def show_img(data):
for i in range(data.shape[0]):
io.imshow(data[i,:,:], cmap = 'gray')
print(i)
io.show()
#单张显示
def show_img(ori_img):
io.imshow(ori_img[60], cmap = 'gray')
io.show()
path = 'F:/BaiduNetdiskDownload/COVID-19CTSeg/data/volume-0.nii'
data = read_img(path)
show_img(data)
import nibabel as nib
import matplotlib.pyplot as plt def read_data(path):
image_data = nib.load(path).get_data()
return image_data
# 单张显示
def show_img(ori_img):
plt.imshow(ori_img[:,:,60], cmap = 'gray')
plt.show() path = 'F:/BaiduNetdiskDownload/COVID-19CTSeg/data/volume-0.nii'
data = read_data(path)
show_img(data)

SimpleITK图像:

Nibabel图像:
 

SimpleITK 和 Nibabel 读取医学图像 nii 数据(2D显示)的更多相关文章

  1. excel to datatable (c#用NPOI将excel文件内容读取到datatable数据表中)

    将excel文件内容读取到datatable数据表中,支持97-2003和2007两种版本的excel 1.第一种是根据excel文件路径读取excel并返回datatable /// <sum ...

  2. 解剖SQLSERVER 第五篇 OrcaMDF里读取Bits类型数据(译)

    解剖SQLSERVER 第五篇  OrcaMDF里读取Bits类型数据(译) http://improve.dk/reading-bits-in-orcamdf/ Bits类型的存储跟SQLSERVE ...

  3. 从多个XML文档中读取数据用于显示webapi帮助文档

    前言: 你先得知道HelpPageConfig文件,不知道说明你现在不需要这个,所以下文就不用看了,等知道了再看也不急.当然如果你很知道这个,下文也不用看了,因为你会了. 方法一: new XmlDo ...

  4. Java读取Execl表格数据

    在前面提到用java代码新建一个Execl 表格并添加数据到表格中, 这次写了一个读取Execl表格数据并添加导数据库中的案列 给定对方一个Execl模板表格,如果导入的Execl表格和预订的表格不相 ...

  5. 上传读取Excel文件数据

    /// <summary> /// 上传读取Excel文件数据 /// 来自http://www.cnblogs.com/cielwater /// </summary> // ...

  6. JAVA TcpServer端使用Scanner读取不到数据的解决办法

    在使用JAVA进行Socket通信时,在Server端使用Scanner的nextLine()方法读取数据时,一直读取不到数据是因为Scanner是一个扫描器,它扫描数据都是去内存中一块缓冲区中进行扫 ...

  7. 我写的一个ExcelHelper通用类,可用于读取或生成数据

    读取或生成EXCEL数据的方法有很多,一般常见的有: 1.通过OFFICE EXCEL组件,优点:读取与生成EXCEL文件方便,缺点:服务器上必须安装OFFICE软件,且进程无法及时释放 2.通过第三 ...

  8. VC6.0读取Excel文件数据

    啰嗦一下:本人所在公司从事碟式斯特林太阳能发电设备的研发与销售.单台设备图如下: 工作原理如下:整个设备大致可分为五个部分, 1.服务器,负责气象.发电等数据存取,电.网连接等处理: 2.气象站,通过 ...

  9. 转: 从Mysql某一表中随机读取n条数据的SQL查询语句

    若要在i ≤ R ≤ j 这个范围得到一个随机整数R ,需要用到表达式 FLOOR(i + RAND() * (j – i + 1)).例如, 若要在7 到 12 的范围(包括7和12)内得到一个随机 ...

随机推荐

  1. localstorage二次封装-模块模式

    var db = function () { // 本地存储前缀,减少命名冲突 var prefix = 'ydb'; return { setPrefix: function (_prefix) { ...

  2. 基于Vue的机器学习平台前端

    项目演示地址:http://vidanao.com/ml>注意1:前端兼容性不太好,360浏览器比较兼容; >注意2:此vidanao.com也是我的个人博文主页,但目前还没部署 源码地址 ...

  3. nginx如何连接多个服务?

    记录一下: 刚开始用nginx部署,在项目文件内touch了一个nginx.conf配置文件,然后将这个conf文件软链接到nginx的工作目录中 sudo ln -s /home/ubuntu/xx ...

  4. PYTHON程序设计实验

    Python程序设计实验报告一: 熟悉IDLE和在线编程平台 安徽工程大学 Python程序设计实验报告 班级 物流191 姓名 邹缕学号 3190505117成绩 ▁▁▁ 日期 2020.3.5 指 ...

  5. linux构建DHCP服务器

    1.DHCP(Dynamic Host Configuration Protocol,动态主机配置协议)是一个局域网的网络协议,使用UDP协议工作,主要用途:给内部网络或网络服务供应商自动分配IP地址 ...

  6. Educational Codeforces Round 83 (Rated for Div. 2)A--C

    题意:给出一个边数为n的等边多边形,问是否可以变成m的等边多边形.条件是同一个中心,共用原顶点. 解析:直接n%m==0即可,这样就是平分了.签到题没得说了. #include<iostream ...

  7. 误删除所有redo日志的一组成员的处理过程

    系统中共有3个日志文件组,每个组中各有一个日志文件成员.往系统中添加一个日志文件组,组中日志文件成员数量是2.SQL> alter database add logfile group 4 (' ...

  8. abp(net core)+easyui+efcore实现仓储管理系统——入库管理之四(四十)

    abp(net core)+easyui+efcore实现仓储管理系统目录 abp(net core)+easyui+efcore实现仓储管理系统——ABP总体介绍(一) abp(net core)+ ...

  9. 【python】提取sql语句中的表名

    前言 最近刚学python,写一个小工具时需要提取sql语句中表名,查询一番后找到一篇文章挺不错的,mark一下 PS.那篇文章是转载的,且没有标注转载自哪里 正文 import ply.lex as ...

  10. 用 SendGrid 发送免费电子邮件

    1. 概述 SendGrid 免费账号可以限额发送 100/天封邮件,虽然比 Mailgun 的每月 10000 封的免费额度少,但胜成注册无需绑定信息卡. 集成 SendGrid 有 SMTP 和 ...