SimpleITK 和 Nibabel 读取医学图像 nii 数据(2D显示)
SimpleITK 和 Nibabel 区别在于:(nii图像可以看成2维,也可以看成三维)
SimpleITK读取数据是(X,Y,Z)显示,Nibabel读取图像是(Z,Y,X)显示,也就是Nibabel加载的图像会旋转90°,其中X表示通道数,即切片层数。详情
import SimpleITK as sitk
import skimage.io as io def read_img(path):
img = sitk.ReadImage(path)
data = sitk.GetArrayFromImage(img)
return data
#显示一个系列图
def show_img(data):
for i in range(data.shape[0]):
io.imshow(data[i,:,:], cmap = 'gray')
print(i)
io.show()
#单张显示
def show_img(ori_img):
io.imshow(ori_img[60], cmap = 'gray')
io.show()
path = 'F:/BaiduNetdiskDownload/COVID-19CTSeg/data/volume-0.nii'
data = read_img(path)
show_img(data)
import nibabel as nib
import matplotlib.pyplot as plt def read_data(path):
image_data = nib.load(path).get_data()
return image_data
# 单张显示
def show_img(ori_img):
plt.imshow(ori_img[:,:,60], cmap = 'gray')
plt.show() path = 'F:/BaiduNetdiskDownload/COVID-19CTSeg/data/volume-0.nii'
data = read_data(path)
show_img(data)
SimpleITK图像:
Nibabel图像:
SimpleITK 和 Nibabel 读取医学图像 nii 数据(2D显示)的更多相关文章
- excel to datatable (c#用NPOI将excel文件内容读取到datatable数据表中)
将excel文件内容读取到datatable数据表中,支持97-2003和2007两种版本的excel 1.第一种是根据excel文件路径读取excel并返回datatable /// <sum ...
- 解剖SQLSERVER 第五篇 OrcaMDF里读取Bits类型数据(译)
解剖SQLSERVER 第五篇 OrcaMDF里读取Bits类型数据(译) http://improve.dk/reading-bits-in-orcamdf/ Bits类型的存储跟SQLSERVE ...
- 从多个XML文档中读取数据用于显示webapi帮助文档
前言: 你先得知道HelpPageConfig文件,不知道说明你现在不需要这个,所以下文就不用看了,等知道了再看也不急.当然如果你很知道这个,下文也不用看了,因为你会了. 方法一: new XmlDo ...
- Java读取Execl表格数据
在前面提到用java代码新建一个Execl 表格并添加数据到表格中, 这次写了一个读取Execl表格数据并添加导数据库中的案列 给定对方一个Execl模板表格,如果导入的Execl表格和预订的表格不相 ...
- 上传读取Excel文件数据
/// <summary> /// 上传读取Excel文件数据 /// 来自http://www.cnblogs.com/cielwater /// </summary> // ...
- JAVA TcpServer端使用Scanner读取不到数据的解决办法
在使用JAVA进行Socket通信时,在Server端使用Scanner的nextLine()方法读取数据时,一直读取不到数据是因为Scanner是一个扫描器,它扫描数据都是去内存中一块缓冲区中进行扫 ...
- 我写的一个ExcelHelper通用类,可用于读取或生成数据
读取或生成EXCEL数据的方法有很多,一般常见的有: 1.通过OFFICE EXCEL组件,优点:读取与生成EXCEL文件方便,缺点:服务器上必须安装OFFICE软件,且进程无法及时释放 2.通过第三 ...
- VC6.0读取Excel文件数据
啰嗦一下:本人所在公司从事碟式斯特林太阳能发电设备的研发与销售.单台设备图如下: 工作原理如下:整个设备大致可分为五个部分, 1.服务器,负责气象.发电等数据存取,电.网连接等处理: 2.气象站,通过 ...
- 转: 从Mysql某一表中随机读取n条数据的SQL查询语句
若要在i ≤ R ≤ j 这个范围得到一个随机整数R ,需要用到表达式 FLOOR(i + RAND() * (j – i + 1)).例如, 若要在7 到 12 的范围(包括7和12)内得到一个随机 ...
随机推荐
- iOS内存区域分布
概览 1,RAM ROM 2,内存的几大区域 3,案例解释 RAM ROM RAM:运行内存,不能掉电存储. ROM:存储性内存,可以掉电存储,例如内存卡.Flash. 内存的几大区域 为了合理的分配 ...
- 神奇的background——绘制图形
相信大家在平时工作中少不了会被要求在某些元添加一些特殊的背景图片,这时候通常就拿起ps就是切切切.不说这种方式麻烦,有ui给你切好的情况已经不错,没有的就有自己动手.还可能有需要切一整张超大图的情况. ...
- Cisco asa组建IPSEC for ikev1
IPSec的实现主要由两个阶段来完成:--第一阶段,双方协商安全连接,建立一个已通过身份鉴别和安全保护的通道.--第二阶段,安全协议用于保护数据的和信息的交换. IPSec有两个安全协议:AH和ESP ...
- nodeJS中定时任务cron的使用
cron模块可以帮助我们在node中定时执行任务.如果你的定时需求是简单的setInterval()与setTimeout()计时器所无法满足的比较复杂的定时规则,推荐使用cron来配置. 安装cro ...
- Ubuntu 18 安装 cuda 10
1.把预先下好的cuda放到某个目录,如Download. 2.Crtl + Alt + F3 进入tty,使用tty登录. 关闭用户图形界面,sudo systemctl set-default m ...
- Linux学习第六天
学习Linux环境下的挂载命令. 什么是挂载命令? 1.Windows下,mount挂载,就是给磁盘分区提供一个盘符(C,D,E,...).比如插入U盘后系统自动分配给了它I:盘符其实就是挂载,退优盘 ...
- React && ReactDOM
如果你是 React 的初学者,一定会对 React 和 ReactDOM 感到迷惑.为什么要分成两个包呢?害得我还要引入两次,说好的减轻开发人员负担呢,这丫的在搞什么飞机.带着这个疑问,我们一起来康 ...
- C++ 人脸识别系统的浅理解
机器学习 机器学习的目的是把数据转换成信息. 机器学习通过从数据里提取规则或模式来把数据转成信息. 人脸识别 人脸识别通过级联分类器对特征的分级筛选来确定是否是人脸. 每个节点的正确识别率很高,但正确 ...
- 最详细的 Spring Boot 多模块开发与排坑指南
创建项目 创建一个 SpringBoot 项目非常的简单,简单到这里根本不用再提.你可以在使用 IDEA 新建项目时直接选择 Spring Initlalize 创建一个 Spring Boot 项目 ...
- ES6编译问题SyntaxError: Unexpected token import
遇到SyntaxError: Unexpected token import 如何解决 ??? 究其原因是node es6问题这还不够,因为我们没有去配置babel,所以我们需要在.babelrc去做 ...