SimpleITK 和 Nibabel 区别在于:(nii图像可以看成2维,也可以看成三维)

SimpleITK读取数据是(X,Y,Z)显示,Nibabel读取图像是(Z,Y,X)显示,也就是Nibabel加载的图像会旋转90°,其中X表示通道数,即切片层数。详情

import SimpleITK as sitk
import skimage.io as io def read_img(path):
img = sitk.ReadImage(path)
data = sitk.GetArrayFromImage(img)
return data
#显示一个系列图
def show_img(data):
for i in range(data.shape[0]):
io.imshow(data[i,:,:], cmap = 'gray')
print(i)
io.show()
#单张显示
def show_img(ori_img):
io.imshow(ori_img[60], cmap = 'gray')
io.show()
path = 'F:/BaiduNetdiskDownload/COVID-19CTSeg/data/volume-0.nii'
data = read_img(path)
show_img(data)
import nibabel as nib
import matplotlib.pyplot as plt def read_data(path):
image_data = nib.load(path).get_data()
return image_data
# 单张显示
def show_img(ori_img):
plt.imshow(ori_img[:,:,60], cmap = 'gray')
plt.show() path = 'F:/BaiduNetdiskDownload/COVID-19CTSeg/data/volume-0.nii'
data = read_data(path)
show_img(data)

SimpleITK图像:

Nibabel图像:
 

SimpleITK 和 Nibabel 读取医学图像 nii 数据(2D显示)的更多相关文章

  1. excel to datatable (c#用NPOI将excel文件内容读取到datatable数据表中)

    将excel文件内容读取到datatable数据表中,支持97-2003和2007两种版本的excel 1.第一种是根据excel文件路径读取excel并返回datatable /// <sum ...

  2. 解剖SQLSERVER 第五篇 OrcaMDF里读取Bits类型数据(译)

    解剖SQLSERVER 第五篇  OrcaMDF里读取Bits类型数据(译) http://improve.dk/reading-bits-in-orcamdf/ Bits类型的存储跟SQLSERVE ...

  3. 从多个XML文档中读取数据用于显示webapi帮助文档

    前言: 你先得知道HelpPageConfig文件,不知道说明你现在不需要这个,所以下文就不用看了,等知道了再看也不急.当然如果你很知道这个,下文也不用看了,因为你会了. 方法一: new XmlDo ...

  4. Java读取Execl表格数据

    在前面提到用java代码新建一个Execl 表格并添加数据到表格中, 这次写了一个读取Execl表格数据并添加导数据库中的案列 给定对方一个Execl模板表格,如果导入的Execl表格和预订的表格不相 ...

  5. 上传读取Excel文件数据

    /// <summary> /// 上传读取Excel文件数据 /// 来自http://www.cnblogs.com/cielwater /// </summary> // ...

  6. JAVA TcpServer端使用Scanner读取不到数据的解决办法

    在使用JAVA进行Socket通信时,在Server端使用Scanner的nextLine()方法读取数据时,一直读取不到数据是因为Scanner是一个扫描器,它扫描数据都是去内存中一块缓冲区中进行扫 ...

  7. 我写的一个ExcelHelper通用类,可用于读取或生成数据

    读取或生成EXCEL数据的方法有很多,一般常见的有: 1.通过OFFICE EXCEL组件,优点:读取与生成EXCEL文件方便,缺点:服务器上必须安装OFFICE软件,且进程无法及时释放 2.通过第三 ...

  8. VC6.0读取Excel文件数据

    啰嗦一下:本人所在公司从事碟式斯特林太阳能发电设备的研发与销售.单台设备图如下: 工作原理如下:整个设备大致可分为五个部分, 1.服务器,负责气象.发电等数据存取,电.网连接等处理: 2.气象站,通过 ...

  9. 转: 从Mysql某一表中随机读取n条数据的SQL查询语句

    若要在i ≤ R ≤ j 这个范围得到一个随机整数R ,需要用到表达式 FLOOR(i + RAND() * (j – i + 1)).例如, 若要在7 到 12 的范围(包括7和12)内得到一个随机 ...

随机推荐

  1. [红日安全]Web安全Day8 - XXE实战攻防

    本文由红日安全成员: ruanruan 编写,如有不当,还望斧正. 大家好,我们是红日安全-Web安全攻防小组.此项目是关于Web安全的系列文章分享,还包含一个HTB靶场供大家练习,我们给这个项目起了 ...

  2. css 进度条的文字根据进度渐变

    需求 1.进度条里面的文字需要根据进度的长度而变化 原理 用两个一模一样的样式的 div 重叠起来 效果 字体开始为 蓝色,跟随进度条变为 白色 在线预览: https://jsfiddle.net/ ...

  3. Eclipse+Mysql实现多条件查询

    最近做一个项目的时候,就需要用到多条件查询,但是一直不完美,所有有bug,不过今天经高人提醒,做出了个小例子,在这里简单跟大家分享一下: 不说多了,直接放关键sql代码: 已知条件:菜名,菜品,价格区 ...

  4. DirectX11--深入理解Effects11、使用着色器反射机制(Shader Reflection)实现一个复杂Effects框架

    前言 如果之前你是跟随本教程系列学习的话,应该能够初步了解Effects11(现FX11)的实现机制,并且可以编写一个简易的特效管理框架,但是随着特效种类的增多,要管理的着色器.资源等也随之变多.如果 ...

  5. VS2017配置opencv-4.2.0详细步骤

    VS2017配置opencv-4.2.0详细步骤   1.下载opencv的安装包并解压.下载网址https://sourceforge.net/projects/opencvlibrary/ 图1 ...

  6. OpenGL 实现视频编辑中的转场效果

    转场介绍 转场效果是什么? 转场效果,简单来说就是两段视频之间的衔接过渡效果. 现在拍摄 vlog 的玩家越来越多,要是视频没有一两个炫酷的转场效果,都不好意思拿出来炫酷了. 那么如何在视频编辑软件中 ...

  7. scrapycrawl 爬取笔趣阁小说

    前言 第一次发到博客上..不太会排版见谅 最近在看一些爬虫教学的视频,有感而发,大学的时候看盗版小说网站觉得很能赚钱,心想自己也要搞个,正好想爬点小说能不能试试做个网站(网站搭建啥的都不会...) 站 ...

  8. 01-初识InfluxDB

    初识InfluxDB 1. InfluxDB介绍 时间序列数据库,简称时序数据库,Time Series Database,一个全新的领域,最大的特点就是每个条数据都带有Time列. 时序数据库到底能 ...

  9. ggplot2(11) 总结回顾&案例练习

    从2020年2月20到2月27日,3月13日到2020年3月16日,学习了ggplot2:数据分析与图形艺术(哈德利·威克姆 著 统计之都 译),历时12天.另外,3月6日到3月9日参加了美赛,也用到 ...

  10. CSRF攻击原理及预防手段

      CSRF全程 Cross Site Request Forgery, 跨站域请求伪造.这种攻击方式相对于XSS,SQL注入等攻击方式比较晚被发现,今天就来讲解下这种攻击方式以及避免方式. 攻击过程 ...