DNA Sequence

Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K
Total Submissions: 17160   Accepted: 6616

Description

It's well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it's very useful to analyze a segment of DNA Sequence,For example, if a animal's DNA sequence contains segment ATC then it may mean that the animal may have a genetic disease. Until now scientists have found several those segments, the problem is how many kinds of DNA sequences of a species don't contain those segments.

Suppose that DNA sequences of a species is a sequence that consist of A, C, T and G,and the length of sequences is a given integer n.

Input

First line contains two integer m (0 <= m <= 10), n (1 <= n <=2000000000). Here, m is the number of genetic disease segment, and n is the length of sequences.

Next m lines each line contain a DNA genetic disease segment, and length of these segments is not larger than 10.

Output

An integer, the number of DNA sequences, mod 100000.

Sample Input

4 3
AT
AC
AG
AA

Sample Output

36

Source

 
 //2017-08-10
#include <iostream>
#include <cstdio>
#include <cstring>
#include <queue>
#define ll long long using namespace std; const int K = ;
const int N = ;
const int M = ;
const int MOD = ; struct Matrix{
ll a[M*M][M*M];
int r, c;
}mat, tmp; Matrix multi(Matrix x, Matrix y)//矩阵乘法
{
Matrix z;
memset(z.a, , sizeof(z.a));
z.r = x.r, z.c = y.c;
for(int i = ; i < x.r; i++){
for(int k = ; k < x.c; k++)//加速优化
{
if(x.a[i][k] == ) continue;
for(int j = ; j< y.c; j++)
z.a[i][j] = (z.a[i][j] + (x.a[i][k] * y.a[k][j]) % MOD) % MOD;
}
}
return z;
} void Matrix_pow(int n)//矩阵快速幂
{
Matrix tmp;
tmp.c = mat.c;
tmp.r = mat.r;
memset(tmp.a, , sizeof(tmp.a));
for(int i = ; i < tmp.c; i++)
tmp.a[i][i] = ;
while(n){
if(n & )
tmp = multi(tmp, mat);
mat = multi(mat, mat);
n >>= ;
}
int ans = ;
for(int i = ; i < tmp.c; i++)
ans = (ans + tmp.a[][i]) % MOD;
printf("%d\n", ans);
} struct AC_automation
{
//node nodes[N], *root, *superRoot, *cur;
int nex[M*M][], fail[M*M], match[M*M];
int root, CNT;
int newNode(){
for(int i = ; i < K; i++)
nex[CNT][i] = -;
match[CNT++] = ;
return CNT-;
}
int Hash(char ch)
{
if(ch == 'A')return ;
else if(ch == 'C')return ;
else if(ch == 'T')return ;
else if(ch == 'G')return ;
}
void init(){
CNT = ;
root = newNode();
}
void Insert(char s[]){//向字典树中插入一个字符串
int n = strlen(s);
int cur = root;
for(int i = ; i < n; i++){
int p = Hash(s[i]);
if(nex[cur][p] == -)
nex[cur][p] = newNode();
cur = nex[cur][p];
}
match[cur]++;
}
void build(){//构建自动机
queue<int> que;
fail[root] = root;
for(int i = ; i < K; i++){
if(nex[root][i] == -)
nex[root][i] = root;
else{
fail[nex[root][i]] = root;
que.push(nex[root][i]);
}
}
while(!que.empty()){
int cur = que.front();
if(match[fail[cur]])match[cur] = ;
que.pop();
for(int i = ; i < K; i++){
if(nex[cur][i] == -){
nex[cur][i] = nex[fail[cur]][i];
}else{
fail[nex[cur][i]] = nex[fail[cur]][i];
que.push(nex[cur][i]);
}
}
}
}
void to_marix(){
memset(mat.a, , sizeof(mat.a));
mat.r = mat.c = CNT;
for(int i = ; i < CNT; i++){
for(int j = ; j < ; j++)
if(!match[nex[i][j]])
mat.a[i][nex[i][j]]++;
}
// for(int i = 0; i < CNT; i++){
// for(int j = 0; j < CNT; j++)
// cout<<mat.a[i][j]<<" ";
// cout<<endl;
// }
}
}; char str[M];
AC_automation ac; int main()
{
int n, m;
while(scanf("%d%d", &m, &n)!=EOF)
{
ac.init();
for(int i = ; i < m; i++){
scanf("%s", str);
ac.Insert(str);
}
ac.build();
ac.to_marix();
Matrix_pow(n);
} return ;
}

POJ2778(SummerTrainingDay10-B AC自动机+矩阵快速幂)的更多相关文章

  1. [poj2778]DNA Sequence(AC自动机+矩阵快速幂)

    题意:有m种DNA序列是有疾病的,问有多少种长度为n的DNA序列不包含任何一种有疾病的DNA序列.(仅含A,T,C,G四个字符) 解题关键:AC自动机,实际上就是一个状态转移图,注意能少取模就少取模, ...

  2. poj2778 DNA Sequence(AC自动机+矩阵快速幂)

    Description It's well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it's ve ...

  3. POJ2778 DNA Sequence(AC自动机+矩阵快速幂)

    题目给m个病毒串,问不包含病毒串的长度n的DNA片段有几个. 感觉这题好神,看了好久的题解. 所有病毒串构造一个AC自动机,这个AC自动机可以看作一张有向图,图上的每个顶点就是Trie树上的结点,每个 ...

  4. poj2778 ac自动机+矩阵快速幂

    给m个子串,求长度为n的不包含子串的母串数,最直接的应该是暴搜,肯定tle,考虑用ac自动机 将子串建成字典树,通过next表来构造矩阵,然后用矩阵快速幂求长度为n的数量 邻接矩阵https://we ...

  5. poj2778DNA Sequence (AC自动机+矩阵快速幂)

    转载请注明出处: http://www.cnblogs.com/fraud/          ——by fraud DNA Sequence Time Limit: 1000MS   Memory ...

  6. HDU 2243考研路茫茫——单词情结 (AC自动机+矩阵快速幂)

    背单词,始终是复习英语的重要环节.在荒废了3年大学生涯后,Lele也终于要开始背单词了. 一天,Lele在某本单词书上看到了一个根据词根来背单词的方法.比如"ab",放在单词前一般 ...

  7. HDU 2243 考研路茫茫――单词情结 ——(AC自动机+矩阵快速幂)

    和前几天做的AC自动机类似. 思路简单但是代码200余行.. 假设solve_sub(i)表示长度为i的不含危险单词的总数. 最终答案为用总数(26^1+26^2+...+26^n)减去(solve_ ...

  8. POJ - 2778 ~ HDU - 2243 AC自动机+矩阵快速幂

    这两题属于AC自动机的第二种套路通过矩阵快速幂求方案数. 题意:给m个病毒字符串,问长度为n的DNA片段有多少种没有包含病毒串的. 根据AC自动机的tire图,我们可以获得一个可达矩阵. 关于这题的t ...

  9. 考研路茫茫——单词情结 HDU - 2243 AC自动机 && 矩阵快速幂

    背单词,始终是复习英语的重要环节.在荒废了3年大学生涯后,Lele也终于要开始背单词了. 一天,Lele在某本单词书上看到了一个根据词根来背单词的方法.比如"ab",放在单词前一般 ...

随机推荐

  1. 配置kali linux

    在7月底的时候,安全加介绍Fireeye出品的 免费恶意软件分析工具FlareVM,还可进行逆向工程和渗透测试 .今天是看到绿盟科技的一篇介绍Kali Linux配置的文章,这个工具也进入了 渗透测试 ...

  2. [NOI2018]你的名字(后缀自动机+线段树合并)

    看到题目名字去补番是种怎么样的体验 我只会 \(68\) 分,打了个暴力.正解看了一会儿,发现跟 \([HEOI2016/TJOI2016]\) 字符串很像,用线段树合并维护 \(endpos\) 集 ...

  3. npm包发布记录

    下雪了,在家闲着,不如写一个npm 包发布.简单的 npm 包的发布网上有很多教程,我就不记录了.这里记录下,一个复杂的 npm 包发布,复杂指的构建环境复杂. 整个工程使用 rollup 来构建,其 ...

  4. [原创]Base32加密解密工具

    工具: Base32_Decode编译: VS2012  C# (.NET Framework v2.0)组织: K8搞基大队[K8team]作者: K8拉登哥哥博客: http://qqhack8. ...

  5. 详解使用flask_paginate进行分页

    分页技术好处: 1.分页技术是把数据全部查询出来,然后再进行分页 2.分页技术可以,降低带宽使用,提高访问速度 使用flask_paginate进行分页 1.要使用flask_paginate,首先安 ...

  6. 好用的在线工具汇总:Iconfont图标,数据mock,时间函数库,颜色查询 等

    一   时间函数库 ———http://momentjs.com/ 非常全的时间处理函数库,引入使用非常方便. 二   Iconfont———http://www.iconfont.cn/ 各种小图标 ...

  7. Shell常见的快捷键

    Ctrl + a - Jump to the start of the lineCtrl + b - Move back a charCtrl + c - Terminate the command ...

  8. Jquery初体验一

    <!DOCTYPE html> <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml"> <head> <m ...

  9. postgresql主从配置

    master:10.0.1.114 slaver:10.0.1.116 一.yum安装https://blog.csdn.net/weixin_41048363/article/details/803 ...

  10. Flutter踩坑日记:接入现有iOS项目

    之前搞的Flutter版工具链已经弄完了,感兴趣的朋友可以围观下,Android版本dio库(v2.0.14)发送网络请求老是报错,去官方提了issue还没回,于是今天搞一下把Flutter模块接入到 ...