Problem

Figure 2. The Hamming distance between these two strings is 7. Mismatched symbols are colored red.

Given two strings ss and tt of equal length, the Hamming distance between ss and tt, denoted dH(s,t)dH(s,t), is the number of corresponding symbols that differ in ss and tt. See Figure 2.

Given: Two DNA strings ss and tt of equal length (not exceeding 1 kbp).

Return: The Hamming distance dH(s,t)dH(s,t).

Sample Dataset

GAGCCTACTAACGGGAT
CATCGTAATGACGGCCT

Sample Output

7

代码:
###Counting Point Mutations ###
def CPM(s, t):
l = min(len(s), len(t))
result = 0
for i in range(0, l):
if s[i] <> t[i]:
result += 1
print result if __name__ == "__main__":
fh = open ("C:\\Users\\hyl\\Desktop\\rosalind_hamm.txt")
s = fh.readline()
for line in fh:
t = line
CPM(s, t)

6.Counting Point Mutations的更多相关文章

  1. 06 Counting Point Mutations

    Problem Figure 2. The Hamming distance between these two strings is 7. Mismatched symbols are colore ...

  2. 萌新笔记——Cardinality Estimation算法学习(二)(Linear Counting算法、最大似然估计(MLE))

    在上篇,我了解了基数的基本概念,现在进入Linear Counting算法的学习. 理解颇浅,还请大神指点! http://blog.codinglabs.org/articles/algorithm ...

  3. POJ_2386 Lake Counting (dfs 错了一个负号找了一上午)

    来之不易的2017第一发ac http://poj.org/problem?id=2386 Lake Counting Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536 ...

  4. ZOJ3944 People Counting ZOJ3939 The Lucky Week (模拟)

    ZOJ3944 People Counting ZOJ3939 The Lucky Week 1.PeopleConting 题意:照片上有很多个人,用矩阵里的字符表示.一个人如下: .O. /|\ ...

  5. find out the neighbouring max D_value by counting sort in stack

    #include <stdio.h> #include <malloc.h> #define MAX_STACK 10 ; // define the node of stac ...

  6. 1004. Counting Leaves (30)

    1004. Counting Leaves (30)   A family hierarchy is usually presented by a pedigree tree. Your job is ...

  7. 1.Counting DNA Nucleotides

    Problem A string is simply an ordered collection of symbols selected from some alphabet and formed i ...

  8. vuex2.0.0爬坑记录 -- mutations的第一个参数state不能解构

    今天在学习vuex的过程中,遇到了一个很困扰人的问题,最终利用vuex的状态快照工具logger解决了问题. 问题是这样的,我在子组件中使用了mapState()函数来将状态映射至子组件中,使子组件能 ...

  9. uva 11401 Triangle Counting

    // uva 11401 Triangle Counting // // 题目大意: // // 求n范围内,任意选三个不同的数,能组成三角形的个数 // // 解题方法: // // 我们设三角巷的 ...

随机推荐

  1. C++11 变长模版和完美转发实例代码

    C++11 变长模版和完美转发实例代码 #include <memory>#include <iostream>#include <vector>#include ...

  2. C# MD5加密

    public static string Encrypt(string txt) { System.Security.Cryptography.MD5CryptoServiceProvider md5 ...

  3. IHttpHandler给图片加水印

    /// <summary> /// WaterMarkHandlher 的摘要说明 /// </summary> public class WaterMarkHandlher ...

  4. Android中的布局动画

    简介 布局动画是给布局的动画,会影响到布局中子对象 使用方法 给布局添加动画效果: 先找到要设置的layout的id,然后创建布局动画,创建一个LayoutAnimationController,并把 ...

  5. 对于Python中self的看法

    首先看一段Java代码 public class Test { public String name; public int age; public String gender; public Str ...

  6. web学习之开发环境的搭建

    开发工具 myeclipse2014: tomcat7.0 jdk7.0 1:新建一个web projcat 2:找到web root目录下的index.jsp 这是项目首页 3:访问web项目 ht ...

  7. JSP内置对象---用户登录页面(get和post)

    Login.jsp 页面: <%@ page language="java" import="java.util.*" contentType=" ...

  8. android-oldman之TitleBar

    随着大众口味的不断提高,对app要的开发的要求也不断提高,开发人员们要在app上展示的东西安也越来越多,android早期的一些控件慢慢的不不能满足开发的要求了,比如TitleBar的应用的就没有原来 ...

  9. redis清空缓存

    进入redis命令行 首先启动redis服务 redis-server /home/redis/redis_7901.conf redis-cli -p 7901(指定进入端口号为7901的redis ...

  10. spring boot 跨域访问处理

    问题场景:由于项目中使用到跨域访问,今天也得到高人指点,所以写出来分享给大家.可能是考虑到前后端分离,前端后端服务器不在一台机器上,出现这种跨域访问的情况.正常情况下本地访问是没有问题,但是遇到这种非 ...