Prim算法、Kruskal算法和最小生成树 | Minimum Spanning Tree
graph to tree非常有趣!
距离的度量会极大地影响后续的分析,欧式距离会放大差异,相关性会缩小差异,导致某些细胞群分不开。
先直观看一下,第一个是Prim,第二个是Kruskal。但是肯定都是有局限性的!我也在尝试新的方法,提升表现。
先看看算法的差异:
参考:
算法,代码的文章一大堆,但能从高处俯瞰的极少。
这两个算法都没有数据的偏向性,对数据没有假设。
我们的单细胞的数据特征明显,存在cell hub。
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