进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:

[00] Query id

[01] Subject id

[02] % identity

[03] alignment length

[04] mismatches

[05] gap openings

[06] q. start

[07] q. end

[08] s. start

[09] s. end

[10] e-value

[11] bit score

the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章

  1. blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

    之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...

  2. 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb

    参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...

  3. 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较

    1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...

  4. Blast本地化

    转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...

  5. Linux下BLAST的使用---转载

    1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...

  6. blast+学习之search tools

    search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...

  7. [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console

    Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...

  8. 27、BLASTN的参数

    转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...

  9. RTP Tools

    RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...

随机推荐

  1. poj 2186 Popular Cows

    Popular Cows Time Limit: 2000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 29908   Accepted: 12131 De ...

  2. Android爬坑之旅:软键盘挡住输入框问题的终极解决方案

    前言 开发做得久了,总免不了会遇到各种坑.而在Android开发的路上,『软键盘挡住了输入框』这个坑,可谓是一个旷日持久的巨坑--来来来,我们慢慢看. 入门篇 Base 最基本的情况,如图所示:在页面 ...

  3. fancybox的配置项

    Fancybox的API和配置选项说明 属性名 默认值 简要说明 padding 10 浏览框内边距,和css中的padding一个意思 margin 20 浏览框外边距,和css中的margin一个 ...

  4. zkw费用流+当前弧优化

    zkw费用流+当前弧优化 var o,v:..] of boolean; f,s,d,dis:..] of longint; next,p,c,w:..] of longint; i,j,k,l,y, ...

  5. C语言:void指针

    使用前必须进行强制类型转换 #include <stdio.h> void test(const void *p); int main(){ ; int *p = &i; puts ...

  6. C语言操作文件

    #include <stdio.h> struct stu{ ]; int num; int age; ]; }boya[],boyb[]; struct stu *pa,*pb; mai ...

  7. SpringMVC的Controller中使用线程安全的初始化

    因为SpringMVC的Controller默认是单例, 在这种情况下, Controller中使用的私有变量必须也是单例, 例如各种service, 否则会有多线程访问数据互相修改的问题. 对于需要 ...

  8. Tomcat 增加静态文件目录, 外部目录

    很简单, 随手记下: conf目录下的server.xml, 在对应的里面增加一行: <Context docBase="/home/tomcat/archives/adserver& ...

  9. Linux shell中的符号

    .单小括号 () ①命令组.括号中的命令将会新开一个子shell顺序执行,所以括号中的变量不能够被脚本余下的部分使用. 括号中多个命令之间用分号隔开,最后一个命令可以没有分号,各命令和括号之间不必有空 ...

  10. 如果动态设置json对象的key

    项目中要求动态设置json的key属性,如果按照一般的json设置方法是不行的.假如你把一个key设置为一个变量的话,那么最后js解析出来的就是key为这个变量名而不是这个变量的值. 解决:通过使用 ...