它支持各种各样的数据类型，包括基于芯片测序、二代测序数据和基因组注释数据等。整合基因组浏览器（IGV，Integrative Genomics Viewer）进行可视化浏览，它支持各种各式的数据类型，包括基于芯片测序、二代测序数据和基因。IGV具有以下特点：

　　(1) 能在不同尺度下显示单个或多个Reads在参考基因组上的位置，包括Reads在各个染色体上的分布情况和在注释的外显子、内含子、剪接接合区、基因间区的分布情况等；

　　(2) 能在不同尺度下显示不同区域的Reads丰度，以反映不同区域的转录水平；

　　(3) 能显示基因及其剪接异构体的注释信息；

　　(4) 能显示其他注释信息；

　　(5) 既可以从远程服务器端下载各种注释信息，又可以从本地加载注释信息。

　　安装可参考：http://www.wtoutiao.com/p/x2dFKv.html

IGV软件的更多相关文章

  1. 可视化工具之 IGV 使用方法

    整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据类型,包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释. IGV这个工具很牛,发了NB: ...

  2. IGV解读

    复制于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/5603481.html 整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据 ...

  3. RNA-seq 数据文件处理

    http://www.fungenomics.com/article/30 [专题]基因组学技术专题(二)-- 为什么说FPKM/RPKM是错的 下载数据 wget是linux下一个从网络上自动下载文 ...

  4. mac osx App store 安装软件 发生错误

    app store 安装软件时发生错误 解决办法: 1. 进入如下目录: sh-3.2# cd Library/Application\ Support/App\ Store/ sh-3.2# pwd ...

  5. PSI-BLAST|PHI-BLAST|UniProt|IGV|Galaxy|clustalx

    生物信息学软件: NCBI:BLAST,设定k-mer 默认是全局比对,Blastn是局部比对. PSI-BLAST最灵敏的BLAST,选中部分矩阵后在数据库中查找相应蛋白. PHI-BLAST找氨基 ...

  6. DBImport V3.7版本发布及软件稳定性（自动退出问题）解决过程分享

    DBImport V3.7介绍: 1:先上图,再介绍亮点功能: 主要的升级功能为: 1:增加(Truncate Table)清表再插入功能: 清掉再插,可以保证两个库的数据一致,自己很喜欢这个功能. ...

  7. nw.js桌面软件开发系列 第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞

    第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞 当我们谈论桌面软件开发技术的时候,你会想到什么?如果不对技术本身进行更为深入的探讨,在我的世界里,有这么多技术概念可以被罗列出来(请原谅我本质上是一个Win ...

  8. 标准产品+定制开发:专注打造企业OA、智慧政务云平台——山东森普软件，交付率最高的技术型软件公司

    一.公司简介山东森普信息技术有限公司(以下简称森普软件)是一家专门致力于移动互联网产品.企业管理软件定制开发的技术型企业.公司总部设在全国五大软件园之一的济南齐鲁软件园.森普SimPro是由Simpl ...

  9. JAVA程序员常用软件整理下载

    ********为了大家学习方便,特意整理软件下载如下:*************Java类软件:-------------------------------JDK7.0:http://pan.ba ...

随机推荐

  1. jQuery知识点总结（第二天）

    今天继续从我的笔记上面搬运.我们不产生知识,只是知识的搬运工. 内容过滤选择器: ○ 内容选择过滤器                                       $("div ...

  2. 用css3实现各种图标效果（1）

    公共样式 应该说现在绝大多数公司的项目前端都是一团乱,不仅仅是js写的没有任何框架而言,css同样也是如此,导致项目如果要升级或者说有新的变更维护起来就特别困难. 最近领导决定花大时间整理一下css样 ...

  3. 高性能JavaScript笔记三（编程实践）

    避免双重求值 有四个标准函数可以允许你传入代码的字符串,然后它才你动态执行.它们分别是:eval.Function.setTimeout.setInterval 事实上当你在javascript代码中 ...

  4. iOS - 沙盒中，如何判断存在文件、目录

    在iOS开发中,在沙盒中创建沙盒一些存储各个功能的文件目录或者文件. 使用: [NSFileManager defaultManager] 1.判断目录,用她可以. 2.判断文件,用她可以. 3.创建 ...

  5. Mobius 反演

    上次看莫比乌斯繁衍反演是一个月前,讲道理没怎么看懂.. 然后出去跪了二十天, 然后今天又开始看发现其实并不难理解   开个这个仅记录一下写过的题. HAOI 2011 B   这应该是莫比乌斯反演的模 ...

  6. SSH项目与SSM项目的进入首页的方法

    SSH项目中: jsp页面一般都是存放在WEB-INF下面的目录下,这样我们就不能直接访问到这些jsp页面了,保证了页面的安全性. 在struts的管理中,是利用action来实现页面的跳转,进入in ...

  7. IOS 学习笔记之UI

    自定义控件,实现部分 - (id)initWithFrame:(CGRect)frame descriptionText:(NSArray *)inText/*需要输入两个字符串*/ { self = ...

  8. eclipse的一些常见操作

    调整字体大小:Window-Preferences-General-Appearance-Colors and Fonts-Basic-Text Font

  9. asp.net中的窗口弹出实现，包括分支窗口 . ASP.NET返回上一页面实现方法总结 .

    返回上一页的这个东东在我们做项目的时候一般是用于填写完表单后确认的时候,有对原来输入的数据进行修改或者更新时用的,或者是因为网站为了方便浏览者而有心添加的一个东东,一般这种功能的实现在ASP.NET中 ...

  10. NumberFormat类

    NumberFormat表示数字的格式化类,即可以按照本地的风格习惯进行数字的显示. NumberFormat是一个抽象类,和MessageFormat类一样,都是Format类的子类,本类在使用时可 ...