推荐R语言界的国内大佬于淼写的代谢组学workflow，包含了大部分代谢组学（以及暴露组）的数据分析方法。

Meta-Workflow

主要内容包括：

  • Sample collection
  • Pretreatment
  • Principles of metabolomics data analysis
  • Software selection
  • Batch correction
  • Annotation
  • Omics analysis
  • Exposome

顺便附上大佬的博客：

https://yufree.cn/

科学网：

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=430956&do=blog&view=me&from=space&page=1

Metabolomics Workfolw的更多相关文章

  1. Integrated Metabolomics and Lipidomics Analyses Reveal Metabolic Reprogramming in Human Glioma with IDH1 Mutation (文献分享一组-黄旭蕾)

    题目:Integrated Metabolomics and Lipidomics Analyses Reveal Metabolic Reprogramming in Human Glioma wi ...

  2. 【代谢组学】Metabolomics资源推送

    入门课程 伯明翰大学: Metabolomics: Understanding Metabolism in the 21st Century 数据处理 阿拉巴马大学伯明翰分校5年(2013-2018) ...

  3. 数据挖掘 workfolw 总结

    个人将数据挖掘的流程简单表示为“ 数据 → 特征 → 模型 ”.   首先,明确问题的性质和任务(分类.回归.聚类.推荐.排序.关联分析.异常检测等): 其次,理解数据(含义.类型.值的范围),并通过 ...

  4. Integration of Metabolomics and Transcriptomics To Reveal Metabolic Characteristics and Key Targets Associated with Cisplatin Resistance in Nonsmall Cell Lung Cancer（解读人：林山云）

    期刊名:J. Proteome Res 发表时间:(2019年8月) IF:3.78 单位: 上海第九人民医院药学系,上海交通大学药学院 上海交通大学药物与生物化学系   物种:人源A549细胞系 技 ...

  5. 环境与工具2：建立高效的mac环境

    你的工作与生活离不开电脑,电脑是一个工具,也是一个环境.环境是不是绿水青山,是不是得心应手,这是很重要的事情.小程平时使用macbook来学习跟娱乐,最近重装了系统,很多环境与工具都需要重新组建. 那 ...

  6. 数据仓库 - 2.数据仓库设计思路及ETL设计思路

    一.数据仓库构建思想 构造数据仓库有两种方式:一是自上而下,一是自下而上. Bill Inmon先生推崇“自上而下”的方式,即一个企业建立唯一的数据中心,就像一个数据的仓库,其中数据是经过整合.经过清 ...

  7. 转录组分析综述A survey of best practices for RNA-seq data analysis

    转录组分析综述 转录组 文献解读 Trinity cufflinks 转录组研究综述文章解读 今天介绍下小编最近阅读的关于RNA-seq分析的文章,文章发在Genome Biology 上的A sur ...

  8. 2008 SCI 影响因子(Impact Factor)

    2008 SCI 影响因子(Impact Factor) Excel download 期刊名缩写 影响因子 ISSN号 CA-CANCER J CLIN 74.575 0007-9235 NEW E ...

  9. Oozie wordcount实战

    一.定义 基本概念 Action: An execution/computation task (Map-Reduce job, Pig job, a shell command). It can a ...

随机推荐

  1. FastAPI 学习之路（二十八）使用密码和 Bearer 的简单 OAuth2

    OAuth2 规定在使用(我们打算用的)「password 流程」时,客户端/用户必须将 username 和 password 字段作为表单数据发送.我们看下在我们应该去如何实现呢. 我们写一个登录 ...

  2. 2021.9.7考试总结[NOIP模拟49]

    T1 Reverse $BFS$暴力$O(n^2)$ 过程中重复枚举了很多点,考虑用链表记录当前点后面可到达的第一个未更新点. 搜索时枚举翻转子串的左端点,之后便可以算出翻转后$1$的位置. $cod ...

  3. openmp学习心得（一）

    主要在vs2015下使用OMP,写一些自己omp的学习心得: 一.在VS2015下OpenMP的使用: 1.VS2015也仅仅支持OpenMP2.0版本,VS对OpenMP的支持并不太好. 2.在VS ...

  4. 关于STM32 (Cortex-M3) 中NVIC的分析

    一.STM32 (Cortex-M3) 中的优先级概念 STM32(Cortex-M3)中有两个优先级的概念:抢占式优先级和响应优先级,也把响应优先级称作"亚优先级"或" ...

  5. Huffman算法

    一.Huffman算法介绍 霍夫曼编码(英语:Huffman Coding),又译为哈夫曼编码.赫夫曼编码,是一种用于无损数据压缩的熵编码(权编码)算法.在计算机数据处理中,霍夫曼编码使用变长编码表对 ...

  6. Celery Task（定时任务）及参数

    celery beat 是一个调度器:它以常规的时间间隔开启任务,任务将会在集群中的可用节点上运行. 默认情况下,入口项是从 beat_schedule 设置中获取,但是自定义的存储也可以使用,例如在 ...

  7. [转]浅谈电路设计中应用DDR3处理缓存问题

    本文转自:浅谈电路设计中应用DDR3处理缓存问题_若海人生的专栏-CSDN博客 DDR系列SDRAM存储芯片的高速率.高集成度和低成本使其理所当然成为存储芯片中的一霸.在PC和消费电子领域自是如此,它 ...

  8. vm workstation pro 安装centos7

    workstation pro 下载地址 划到页面下方点击下载 安装教程 激活码 16版本 ZF3R0-FHED2-M80TY-8QYGC-NPKYF 15版本 FG78K-0UZ15-085TQ-T ...

  9. 怎么将本地已有的一个项目上传到新建的git仓库的方法

    将本地已有的一个非git项目上传到新建的git仓库的方法一共有两种. 一. 克隆+拷贝 第一种方法比较简单,直接用把远程仓库拉到本地,然后再把自己本地的项目拷贝到仓库中去.然后push到远程仓库上去即 ...

  10. jsonpath语法的基本使用

    jsonpath的安装及使用方式: pip安装: Python3.7\Scripts> pip install jsonpath jsonpath的使用: obj = json.load(ope ...