nvGraph-NVIDIA图形库

数据分析是高性能计算的不断增长的应用。许多高级数据分析问题可以称为图形问题。反过来,当今许多常见的图形问题也可以称为稀疏线性代数。这是nvGraph的动机,它利用GPU的线性代数功能来处理大型图形分析。

https://github.com/rapidsai/nvgraph

该存储库包含NVIDIA CUDA Toolkit中的旧版nvGraph。目的是为CUDA Toolkit停止发布nvGraph的用户提供一种继续使用nvGraph的方法。尽管仍然接受错误报告,但并未积极开发该产品。如果发现并可以重现nvGRAPH中的错误,请在GitHub上报告问题

最近,NVIDIA开始开发cuGraph,它是图形分析的集合,可处理在GPU数据框中找到的作为RAPIDS一部分的数据。现在,大多数nvGraph算法也已成为cuGraph的一部分。此外,cuGraph的目标是提供数据科学家熟悉的类似于NetworkX的API,因此现在可以更轻松地构建GPU加速的工作流程。有关更多项目详细信息,请参见Rapids.ai

获取nvGrpah

先决条件

编译器要求:

  • gcc 版本5.4+
  • nvcc 版本9.2
  • cmake 版本3.12

CUDA要求:

  • CUDA 9.2+
  • NVIDIA驱动程序396.44+
  • Pascal架构或更高

可以从https://developer.nvidia.com/cuda-downloads获得CUDA 。编译器要求:

使用脚本

从源代码安装nvGraph很容易。为方便起见,build.sh提供了一个脚本。运行如下所示的脚本以下载源代码,构建并安装该库。请注意,该库将安装在中设置的位置$CUDA_ROOT(例如export CUDA_ROOT=/usr/local/cuda)。这些说明已在Ubuntu 18.04上进行了测试。

git clone https://github.com/rapidsai/nvgraph.git

cd nvgraph

export CUDA_ROOT=/usr/local/cuda

./build.sh  # build the nvGraph library and install it to $CUDA_ROOT (you may need to add the sudo prefix)

从源手动构建

以下说明适用于nvGraph开发的开发人员和贡献者。这些说明已在Linux Ubuntu 18.04上进行了测试。使用这些说明从源代码构建nvGraph并为它的发展做出贡献。其它操作系统可能兼容,但目前尚未测试。

nvGraph软件包是一个C / C ++ CUDA库。需要安装才能使nvGraph正常运行。

以下说明在Linux系统上测试。

生成并安装C / C ++ CUDA组件

要从源代码安装nvGraph,确保满足依赖性并遵循以下步骤:

1.克隆存储库和子模块

# Set the localtion to nvGraph in an environment variable NVGRAPH_HOME

export NVGRAPH_HOME=$(pwd)/nvgraph

# Download the nvGraph repo

git clone https://github.com/rapidsai/nvgraph.git $NVGRAPH_HOME

# Next load all the submodules

cd $NVGRAPH_HOME

git submodule update --init –recursive

2. 生成并安装libnvgraph_rapids.so。CMake依赖nvcc可执行文件的路径中,或在中定义$CUDACXX。

该项目使用cmake构建C / C ++库。要配置cmake,运行:

cd $NVGRAPH_HOME

cd cpp  # enter nvgraph's cpp directory

mkdir build         # create build directory

cd build            # enter the build directory

cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$CONDA_PREFIX

# now build the code

make -j            # "-j" starts multiple threads

make install       # install the libraries

The default installation locations are $CMAKE_INSTALL_PREFIX/lib and $CMAKE_INSTALL_PREFIX/include/nvgraph respectively.

C ++独立测试

# Run the tests

cd $NVGRAPH_HOME

cd cpp/build

gtests/NVGRAPH_TEST # this is an executable file#这是一个可执行文件

这些测试验证了库是否正确构建,以及图形结构是否按预期工作。目前不维护算法测试套件。大多数图形分析功能都是在cuGraph中开发和测试的。

文献资料

可以在CUDA工具包文档中找到C API文档。

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