医学图像分割-在3DSlicer中使用英伟达的AI辅助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自动切割医学图像教程
前期准备
下载3DSlicer并安装:
3DSlicer官网(http://www.slicer.org)或者直接下载(https://download.slicer.org),需要注意目前该插件只支持最新的3DSlicer Preview版本(4.11.x)
官网下载速度慢,直接百度网盘:
链接:https://pan.baidu.com/s/1WqaIQEWaMXgHVp4QkxwlFQ
提取码:cms1
安装插件(扩展工具)
如图:
点击【Install Slicer Extensions】按钮进入安装插件页
在右上角搜索我们需要的插件,然后安装,安装完成点击【Restart】按钮重启3DSlicer,插件安装完毕
图像切割
如图:按步骤导入我们要处理的医学图像(此处我们以分割单个nii格式图像为例)
点击【Segment Editor】按钮,进入图像分割页
然后找到【Effects】栏,选择【Nvidia AIAA】,如图:然后在【Auto-segmentation】栏的Model栏选择【segmentation_ct_liver_and_tumor】,在点击【start】按钮开始自动切割
切割结果如图:
需要注意:在【Nvidia AIAA Server】栏,默认使用3DSlicer远程服务器,有时候会连接不上,你可以设置自己的服务器,参见我其他教程。
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