search tools：blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn

1.blastn: 核酸序列vs核酸库

$blastn -query file-in  -db database  -out file_out  -evalue 0.00001 -max_target_seqs 5  -num_threads 4  -outfmt format "7 qacc sacc evalue length pident"

-evalue :设置E值阀值 

-max_targe_seqs :Maximum number of aligned sequences to keep. -max_target_seqs <Integer, >=1>

-num_threads 4: 线程数

-output：输出格式，7代表一种格式，后面是内容。7 = tabular with comment lines

2.blastp:

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