#!/usr/bin/perl
#perl search.pl --infile Targets.Lung.Carcinoma.genelist.txt --homogene Homo_sapiens.gene_info --outfile Targets.Lung.Carcinoma.geneID.txt
use warnings;
use strict;
use Getopt::Long;

my ($infile,$homogene,$outfile);
GetOptions('infile=s'=>\$infile,'homogene=s'=>\$homogene,'outfile=s'=>\$outfile,"help|h" =>\&USAGE,)or USAGE();

sub USAGE {
my $usage=<<"USAGE";
USAGE:
$0
--infile input filefiel

--homogene Homo_sapiens.gene_info

--outfile output file

USAGE
print $usage;
exit;
}

perl usage()和getopt的更多相关文章

  1. 在 Perl 中使用 Getopt::Long 模块来接收用户命令行参数

    我们在linux常常用到一个程序需要加入参数,现在了解一下 perl 中的有关控制参数的模块 Getopt::Long ,比直接使用 @ARGV 的数组强大多了.我想大家知道在 Linux 中有的参数 ...

  2. 在Perl中使用Getopt::Long模块来接收用户命令行参数

    我们在linux常常用到一个程序需要加入参数,现在了解一下perl中的有关控制参数的函数.getopt.在linux有的参数有二种形式.一种是–help,另一种是-h.也就是-和–的分别.–表示完整参 ...

  3. [Perl] Getopt 函数来接收用户参数的使用

    我们在linux常常用到一个程序需要加入参数,现在了解一下perl中的有关控制参数的函数.getopt.在linux有的参数有二种形式.一种是–help,另一种是-h.也就是-和–的分别.–表示完整参 ...

  4. 生物信息 perl 脚本实战

    索引 1.统计fasta.fa和fastq文件的长度,统计fastq的reads个数,单个reads长度,reads总长度:统计fasta文件中contig的个数,列出名称,单条的长度,以及总长度. ...

  5. 读写生信流程必备的 Perl 语法

    最早就是写Perl的,后来来到公司转Python,现在又要负责流程了,开始重拾Perl,当然是借鉴别人现有的语法,我再重新组合. 基本语法就不介绍了,参照我之前文章 Perl   模块 use str ...

  6. Perl常用语法

    本文主要为了方便阅读.编写perl脚本而记录的常用的命令.语法. 一.条件判断语法 注意,数字 0, 字符串 '0' . "" , 空 list () , 和 undef 为 fa ...

  7. Perl按行分割文件

    Perl按行分割文件 将一个文件按照行数,均等的分割成多个小文件,例如,一个550行的文件,分割为每个文件有100行,则将分割为6个小文件 运行结果 参考代码(split_file.pl) #!/us ...

  8. c语言基础之getopt()

    getopt() #include <unistd.h> int getopt(int argc, char * const argv[], const char *optstring); ...

  9. GO语言的开源库

    Indexes and search engines These sites provide indexes and search engines for Go packages: godoc.org ...

随机推荐

  1. pandas使用drop_duplicates去除DataFrame重复项

    DataFrame中存在重复的行或者几行中某几列的值重复,这时候需要去掉重复行,示例如下: data.drop_duplicates(subset=['A','B'],keep='first',inp ...

  2. JS的增删改查

    1.查 <script type="text/javascript"> /** * 查找 已经在html代码中存在的元素 */ /** * document.getEl ...

  3. mvc actionresult返回各种文件

    public ActionResult ReviewFile(string folderName, string fileBasename, string extendName) { //以后根据后缀 ...

  4. 20155305乔磊2016-2017-2《Java程序设计》第五周学习总结

    20155305乔磊2016-2017-2<Java程序设计>第五周学习总结 教材学习内容总结 try.catch 1.求平均数程序示例 import java.util.Scanner; ...

  5. 隐马尔科夫模型(HMM)学习笔记二

    这里接着学习笔记一中的问题2,说实话问题2中的Baum-Welch算法编程时矩阵转换有点烧脑,开始编写一直不对(编程还不熟练hh),后面在纸上仔细推了一遍,由特例慢慢改写才运行成功,所以代码里面好多处 ...

  6. Python zip() 处理多于两个序列的参数, 存储结对的值

    zip() 可以接受多于两个的序列的参数.这时候所生成的结果元组中元素个数跟输入序列个数一样 >>> a = [1, 2, 3] >>> b = [10, 11, ...

  7. 让360双核浏览器默认极速模式,避免采用IE模式无法正常访问html5网页的解决办法

    让360双核浏览器默认极速模式,避免采用IE模式无法正常访问html5网页的解决办法 用Meta标签代码让360双核浏览器默认极速模式不是兼容模式<meta name="rendere ...

  8. 50道JavaScript基础面试题(附答案)

    https://segmentfault.com/a/1190000015288700 1 介绍JavaScript的基本数据类型 Number.String .Boolean .Null.Undef ...

  9. 在 Linux 中使用超级用户权限

    在你想要使用超级权限临时运行一条命令时,sudo 命令非常方便,但是当它不能如你期望的工作时,你也会遇到一些麻烦.比如说你想在某些日志文件结尾添加一些重要的信息,你可能会尝试这样做: $ echo & ...

  10. Python入门之获取当前所在目录的方法详解

    #本文给大家讲解的是使用python获取当前所在目录的方法以及相关示例,非常的清晰简单,有需要的小伙伴可以参考下 sys.path 模块搜索路径的字符串列表.由环境变量PYTHONPATH初始化得到. ...