在运行如下程序时出现“Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space”报错:

java  -jar picard.jar SortVcf \
I=hg19.sites.vcf \
O=hg19.sites.sorted.vcf \
SEQUENCE_DICTIONARY=hg19.dict

  出现这种报错说明内存不足。因此我们可以加上“-Xmx”参数

java  -Xmx60g -jar picard.jar SortVcf \
I=hg19.sites.vcf \
O=hg19.sites.sorted.vcf \
SEQUENCE_DICTIONARY=hg19.dict

  

Linux运行Java出现“Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space”报错的更多相关文章

  1. idea中使用scala运行spark出现Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: scala/collection/GenTraversableOnce$class

    idea中使用scala运行spark出现: Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: scala/co ...

  2. Java FAQ -- "Exception in thread 'main' java.lang.UnsupportedClassVersionError:"

    OS:Ubuntu 最近重新学习Java,写了一段很小的程序,如下: public class Hello{ public static void main(String args[]){ Syste ...

  3. 【JAVA】Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError

    java新手经常会遇到这个问题. 环境变量配置正确,eclipse下可以正常编译运行,命令行下可以使用javac生成.class文件,但是在当前目录运行的时候提示: 分析报错,可以发现系统从Pack文 ...

  4. Java 控制台执行带自定义包定义的类,出现“Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: ConnectSQLServer (wrong name: sine/ConnectSQLServer)”

    1.先说明一下代码实现:自定义package sine, 源代码保存路径为:E:\JSP\HibernateDemo\HibernateDemoProject\src\sine\ConnectSQLS ...

  5. Java常见异常:Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError

    在某一路径下执行编译好的class文件出错. 异常如下: E:\liwy>java Test98 Exception in thread "main" java.lang.N ...

  6. Exception in thread "main" java.lang.NoSuchMethodError: org.testng.TestNG.configure(Lorg/testng/CommandLineArgs;)V

    TestNG运行时报以下错误: Exception in thread "main" java.lang.NoSuchMethodError: org.testng.TestNG. ...

  7. xml出现Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException

    运行代码出现Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException 可以看下这个链接:https://ask.csdn. ...

  8. 编译运行java程序出现Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedClassVersionError: M : Unsupported major.minor version 51.0

    用javac编译了一个M.java文件, 然后用java M执行,可是出现了下面这个错误. Exception in thread "main" java.lang.Unsuppo ...

  9. 在dos中运行java程序,若出现Exception in thread “main" java.lang.NoClassDefFoundError

    在dos中运行java程序,若出现Exception in thread “main" java.lang.NoClassDefFoundError,可以检查一下几项: 环境变量配置: 注意 ...

随机推荐

  1. Python运算符-4

    #and or not #优先级,()> not > and > or print(2 > 1 and 1 < 4) print(2 > 1 and 1 < ...

  2. Pair_Work Project

    结对项目小记 ——by    12061227 康    12061179 宇帆 结对编程就是一种敏捷软件开发的方法,两个人在一个计算机上共同工作.一个人输入,而另一个人检查他输入的每一行代码.输入代 ...

  3. 读书笔记(chapter4)

    进程调度 4.1多任务 1.多任务系统可以划分为:非抢占式多任务和抢占式多任务: (在此模式下,由调度程序来决定什么时候停止一个进程的运行,以便其他进程能够得到执行机会,这个动作叫抢占: 时间片实际上 ...

  4. Linux内核第八节 20135332武西垚

    第一种分类: I/O-bound:频繁进行I/O,并且需要花费很多时间等待I/O完成 CPU-bound:计算密集,需要大量的CPU时间进行运算 第二种分类: 批处理进程:不必与用户交互,常在后台进行 ...

  5. android——error opening trace file: No such file or directory (2)

    1.疑惑: 程序运行起来的时候日志总是显示下面这个错误,但是不影响程序的正常进行,我是用真机来测试的,android4.4.4(API17). 02-11 14:55:03.629 15525-155 ...

  6. React16新特性

    React的16版本采用了MIT开源许可证,新增了一些特性. Error Boundary render方法新增返回类型 Portals 支持自定义DOM属性 setState传入null时不会再触发 ...

  7. Linux添加目录到环境变量以及添加sublime到环境变量

    博主之前有过这种情况,就是在普通用户下su ls等命令还有效,可登陆进root用户之后这些常用的命令竟然失效了. 像这样 这问题其实很简单,但是对于不清楚环境变量的配置的同学来说也的确棘手,我之前就是 ...

  8. Java与JavaScript 完美实现字符串拆分(利用数组存储)与合并的互逆操作

    Java: String typeStr = "1,2"; String[] typeArray = typeStr.split(","); typeStr = ...

  9. Linux shell 菜鸟学习笔记....

    20171123 Linux shell 基础学习笔记1. shell 的开始 一般是 #!/bin/bash 通过 #! 来唯一指定使用的shell路径 其他的 # 都表示注释.2. shell 的 ...

  10. python 时间转换相关

    最近需要操作时间的地方相当的多,包括打点,包括时间转换. 罗列最近遇到的两个需求. 1. 关于上篇文章写的base64上传图片的问题,我使用了打点来计算解码需要多少时间.这个对时间精度要求是比较高的. ...