1. If dN/dS = 1, amino-acid substitutions may be largely neutral. However, there is also the
possibility that positive selection just cancels purifying selection, so that some amino-
acid substitutions were driven by natural selection. This situation is thus ambiguous. 2. If dN/dS < 1, purifying selection (selection against deleterious non-synonymous
substitutions) has definitely operated. Some amino-acid substitutions have been may
caused by selection, just not enough to overcome the effects of purifying selection. 3. If dN/dS > 1, selection has caused some amino-acid substitutions. Some substitutions
also have been caused by genetic drift. Purifying selection also likely operates, may
but is not strong enough to overcome the effects of positive selection.

ka/ks的更多相关文章

  1. Ka/ Ks|同义替换的三种路径|kaks_Calculator|

    生命组学 研究old gene 和 young gene CAI选择信号:CGmutation信号 Neutrality plot:CG3与GC1.GC2的关系:平:mutation:正相关:sele ...

  2. Unity3D-RayMarch-几何图元-3添加阴影

    效果图: 在RayMarch渲染算法中计算阴影非常简单,当射线碰撞到物体,从碰撞点逆着光源方向再次执行射线步进算法,如果这一过程中碰撞到了其他物体,则碰撞点被其他物体遮挡,该处具有阴影. shader ...

  3. GenTree:基因进化和功能分析

    欢迎来到"bio生物信息"的世界 GenTree是一个集合多种数据的在线数据库. 总共涉及的基因有63152个,蛋白质编码基因有20300个. 评估基因年龄用的是UCSC数据库的1 ...

  4. GWAS中的名称概念

    基因: 是指决定生物某一遗传性状的染色体DNA片段 基因型: `基因型`又称`遗传型`,是某一生物个体全部基因组合的总称.它反应生物体的遗传构成,即从双亲获得的全部基因的总和.遗传学中具体使用的基因型 ...

  5. The sequence and de novo assembly of the giant panda genome.ppt

    sequencing:使用二代测序原因:高通量,短序列 不用长序列原因: 1.算法错误率高 2.长序列测序将嵌合体基因错误积累.嵌合体基因:通过重组由来源与功能不同的基因序列剪接而形成的杂合基因 se ...

  6. 【豆科基因组】利马豆/洋扁豆Lima bean(Phaseolus lunatus L.)基因组2021NC

    目录 一.来源 二.结果 扁豆的染色体水平高质量组装 扁豆相关农艺性状的QTL定位 直系/旁系同源的演化和物种形成事件 与农艺性状相关基因的直系同源物 群体结构分析揭示扁豆遗传簇 豆荚发育过程中的基因 ...

  7. 【豆科基因组】绿豆Mungbean, Vigna radiata苏绿基因组预印

    目录 一.来源 二.结果 测序组装 组装评价 编码基因预测 基因功能注释 非编码RNA注释 假基因预测 重复序列注释 进化分析和分歧时间估计 全基因组复制 LTR插入时间估计 正选择基因 一.来源 H ...

  8. 【豆科基因组】小豆(红豆)adzuki bean, Vigna angularis基因组2015

    目录 一.来源 研究一:Draft genome sequence of adzuki bean, Vigna angularis 研究二:Genome sequencing of adzuki be ...

  9. 柯尔莫可洛夫-斯米洛夫检验(Kolmogorov–Smirnov test,K-S test)

    柯尔莫哥洛夫-斯米尔诺夫检验(Колмогоров-Смирнов检验)基于累计分布函数,用以检验两个经验分布是否不同或一个经验分布与另一个理想分布是否不同. 在进行cumulative probab ...

随机推荐

  1. GJM : AlloyTouch实战--60行代码搞定QQ看点资料卡

    原文链接:https://github.com/AlloyTeam/AlloyTouch/wiki/kandian 先验货 访问DEMO你也可以点击这里 源代码可以点击这里 如你体验所见,流程的滚动的 ...

  2. centos6.5下使用yum完美搭建LNMP环境(php5.6) 无脑安装

    准备工作 配置防火墙,开启80端口.3306端口删除原有的 iptables , 添加合适的配置 rm -rf /etc/sysconfig/iptables vi /etc/sysconfig/ip ...

  3. 如何在web中实现类似excel的表格控件

    Execl功能非常强大,内置的很多函数或公式可以大大提高对数据的加工处理能力.那么在web中有没有类似的控件呢?经过一番搜寻,发现handsontable具备了基本的excel功能支持公式,同时能对数 ...

  4. IIS初始化(预加载),解决第一次访问慢,程序池被回收问题

    你以为你可以慢,那是不可能的!你以为你可以不动,那也是不可能的! 河南是守株待兔故事情节的发源地,讲的是懒惰的农夫坐在树桩旁等待可爱的小毛兔撞树的故事,那么这种事情怎么可能天天出现呢!你以为的事并一定 ...

  5. iOS - 分析JSON、XML的区别和解析方式的底层是如何实现的(延伸实现原理)

    <分析JSON.XML的区别,JSON.XML解析方式的底层是如何实现的(延伸实现原理)> (一)JSON与XML的区别: (1)可读性方面:基本相同,XML的可读性比较好: (2)可扩展 ...

  6. Android无需申请权限拨打电话

    Android打电话有两种实现方法: 第一种方法,拨打电话跳转到拨号界面.源代码如下: Intent intent = new Intent(Intent.ACTION_DIAL); Uri data ...

  7. FE

    <link rel="stylesheet" type="text/css" media="screen" href="li ...

  8. 【Linux】AWK入门

    什么是AWK AWK是一种用于处理文本的编程语言工具,一个模式匹配程序.一个典型的示例是将数据转换成格式化的报告. 在命令行输入如下awk命令: awk -F":" '{ prin ...

  9. 从一道面试题来认识java类加载时机与过程

    说明:本文的内容是看了<深入理解Java虚拟机:JVM高级特性与最佳实践>后为加印象和理解,便记录了重要的内容. 1  开门见山 以前曾经看到过一个java的面试题,当时觉得此题很简单,可 ...

  10. apache httpd服务器403 forbidden的问题

    一.问题描述 在apache2的httpd配置中,很多情况都会出现403. 刚安装好httpd服务,当然是不会有403的问题了.主要是修改了一些配置后出现,问题描述如下: 修改了DocumentRoo ...