1. If dN/dS = 1, amino-acid substitutions may be largely neutral. However, there is also the
possibility that positive selection just cancels purifying selection, so that some amino-
acid substitutions were driven by natural selection. This situation is thus ambiguous. 2. If dN/dS < 1, purifying selection (selection against deleterious non-synonymous
substitutions) has definitely operated. Some amino-acid substitutions have been may
caused by selection, just not enough to overcome the effects of purifying selection. 3. If dN/dS > 1, selection has caused some amino-acid substitutions. Some substitutions
also have been caused by genetic drift. Purifying selection also likely operates, may
but is not strong enough to overcome the effects of positive selection.

ka/ks的更多相关文章

  1. Ka/ Ks|同义替换的三种路径|kaks_Calculator|

    生命组学 研究old gene 和 young gene CAI选择信号:CGmutation信号 Neutrality plot:CG3与GC1.GC2的关系:平:mutation:正相关:sele ...

  2. Unity3D-RayMarch-几何图元-3添加阴影

    效果图: 在RayMarch渲染算法中计算阴影非常简单,当射线碰撞到物体,从碰撞点逆着光源方向再次执行射线步进算法,如果这一过程中碰撞到了其他物体,则碰撞点被其他物体遮挡,该处具有阴影. shader ...

  3. GenTree:基因进化和功能分析

    欢迎来到"bio生物信息"的世界 GenTree是一个集合多种数据的在线数据库. 总共涉及的基因有63152个,蛋白质编码基因有20300个. 评估基因年龄用的是UCSC数据库的1 ...

  4. GWAS中的名称概念

    基因: 是指决定生物某一遗传性状的染色体DNA片段 基因型: `基因型`又称`遗传型`,是某一生物个体全部基因组合的总称.它反应生物体的遗传构成,即从双亲获得的全部基因的总和.遗传学中具体使用的基因型 ...

  5. The sequence and de novo assembly of the giant panda genome.ppt

    sequencing:使用二代测序原因:高通量,短序列 不用长序列原因: 1.算法错误率高 2.长序列测序将嵌合体基因错误积累.嵌合体基因:通过重组由来源与功能不同的基因序列剪接而形成的杂合基因 se ...

  6. 【豆科基因组】利马豆/洋扁豆Lima bean(Phaseolus lunatus L.)基因组2021NC

    目录 一.来源 二.结果 扁豆的染色体水平高质量组装 扁豆相关农艺性状的QTL定位 直系/旁系同源的演化和物种形成事件 与农艺性状相关基因的直系同源物 群体结构分析揭示扁豆遗传簇 豆荚发育过程中的基因 ...

  7. 【豆科基因组】绿豆Mungbean, Vigna radiata苏绿基因组预印

    目录 一.来源 二.结果 测序组装 组装评价 编码基因预测 基因功能注释 非编码RNA注释 假基因预测 重复序列注释 进化分析和分歧时间估计 全基因组复制 LTR插入时间估计 正选择基因 一.来源 H ...

  8. 【豆科基因组】小豆(红豆)adzuki bean, Vigna angularis基因组2015

    目录 一.来源 研究一:Draft genome sequence of adzuki bean, Vigna angularis 研究二:Genome sequencing of adzuki be ...

  9. 柯尔莫可洛夫-斯米洛夫检验(Kolmogorov–Smirnov test,K-S test)

    柯尔莫哥洛夫-斯米尔诺夫检验(Колмогоров-Смирнов检验)基于累计分布函数,用以检验两个经验分布是否不同或一个经验分布与另一个理想分布是否不同. 在进行cumulative probab ...

随机推荐

  1. IO模型

    前言 说到IO模型,都会牵扯到同步.异步.阻塞.非阻塞这几个词.从词的表面上看,很多人都觉得很容易理解.但是细细一想,却总会发现有点摸不着头脑.自己也曾被这几个词弄的迷迷糊糊的,每次看相关资料弄明白了 ...

  2. Spring在web应用中获得Bean的方法

    一:使用ApplicationContext获得Bean 首先新建一个类,该类必须实现ApplicationContextAware接口,改接口有一个方法,public void setApplica ...

  3. Windows安装RabbitMQ集群的几个注意点

    记录一下RabbitMQ在windows平台下安装的几个注意点- -,好记性不如烂笔头 安装过程与Linux安装一致,教程参照官网集群配置:此处只列举出几个注意点: 1. erlang的版本需要一致, ...

  4. linux安装中文字体

    一.查看系统字体 在开始安装之前,我们先查看系统中已经安装的字体. 要查看系统中已经安装的字体,我们可以使用fc-list命令进行查看.如果系统中没有该命令的话,我们需要先安装相关的软件包. 在cen ...

  5. jQ图片列表光标移动动画

    本效果使用jQuery和CSS实现了图片列表,当鼠标移入时图片向左微动,移出则复原. 效果展示: http://hovertree.com/texiao/jquery/88/ 效果图如下: 其中的jQ ...

  6. 从 HTTP 到 HTTPS - 什么是 HTTPS

    这篇文章首发于我的个人网站:听说 - https://tasaid.com/,建议在我的个人网站阅读,拥有更好的阅读体验. 这篇文章与 博客园 和 Segmentfault 共享. 前端开发QQ群:3 ...

  7. Office 365使用情况调查不完全分析报告

    感谢大家参与了9月13日在Office 365技术群(O萌)中发起的一个关于Office 365使用情况的调查,在一天左右的时间内,我们一共收到了67份反馈,其中绝大部分是在3分钟内提交的. 本次调查 ...

  8. iOS 生成二维码

    首先先下载生成二维码的支持文件 libqrencode 添加依赖库 CoreGraphics.framework. QuartzCore.framework.AVFoundation.framewor ...

  9. 【转】漫谈iOS程序的证书和签名机制

    转自:漫谈iOS程序的证书和签名机制 接触iOS开发半年,曾经也被这个主题坑的摸不着头脑,也在淘宝上买过企业证书签名这些服务,有大神都做了一个全自动的发布打包(不过此大神现在不卖企业证书了),甚是羡慕 ...

  10. Oracle 数据库中对记录进行分页处理——学习笔记

    学习到 oracle 的视图的时候,了解到对 Oracle 中数据的记录进行分页处理和 Mysql 提供的 limit 来进行分页处理大有不同,limit 是 mysql 中特有的关键字. 那么在 o ...