1. 1. If dN/dS = 1, amino-acid substitutions may be largely neutral. However, there is also the
  2.  possibility that positive selection just cancels purifying selection, so that some amino-
  3.  acid substitutions were driven by natural selection. This situation is thus ambiguous.
  5. 2. If dN/dS < 1, purifying selection (selection against deleterious non-synonymous
  6.  substitutions) has definitely operated. Some amino-acid substitutions have been may
  7.  caused by selection, just not enough to overcome the effects of purifying selection.
  9. 3. If dN/dS > 1, selection has caused some amino-acid substitutions. Some substitutions
  10.  also have been caused by genetic drift. Purifying selection also likely operates, may
  11.  but is not strong enough to overcome the effects of positive selection.

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