一、Ensemble:http://www.ensembl.info/2015/06/18/1000-genomes-phase-3-frequencies-genotypes-and-ld-data/

二、安装API

git clone https://github.com/Ensembl/ensembl.git
git clone https://github.com/Ensembl/ensembl-variation.git
git clone https://github.com/Ensembl/ensembl-funcgen.git
git clone https://github.com/Ensembl/ensembl-compara.git
git clone https://github.com/Ensembl/ensembl-io.git #Can't locate DBI.pm
sudo apt-get install libdbi-perl #Can't locate DBD/mysql.pm
sudo apt-get install libdbd-mysql-perl #Can't locate Try/Tiny.pm
sudo apt-get install libpath-tiny-perl
#或者
sudo cpan -i Try::Tiny #Can't locate Bio/DB/HTS/Tabix.pm
git clone https://github.com/Ensembl/Bio-DB-HTS.git
#如果perl INSTALL.pl安装失败的话,将INSTALL.pl198行注释点,再试试

为SNP增加种族人群频率的更多相关文章

  1. HapMap

    HapMap五周年回顾 2011-01-12 | 作者: [关闭] 作者简介:曾长青,中国科学院北京基因组所研究员,博士生导师.CUSBEA奖学金.百人计划.杰出青年基金.首批新世纪百千万人才工程国家 ...

  2. (转)HapMap简介

    1.人类基因组的HapMap和国际HapMap计划 (1)何谓HapMap HapMap是Haplotype Map 的简称,Haplo意为单一,在基因组中专指来自父母的一对染色体中的一条.Haplo ...

  3. SNPs & MAF

    SNPs,全称是single nucleotide polymorphisms,SNPs等位基因频率的容易估计.采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略.该策略的原理是:首先选择参考样本制作标 ...

  4. Linux基础介绍【第六篇】

    定时任务crond介绍 crond是什么? crond是linux系统中用来定期执行命令或指定程序任务的一种服务或软件.一般情况下,安装完CentOS5/6 linux操作系统之后,默认便会启动cro ...

  5. HTML5填充颜色的fillStyle测试

    效果:http://hovertree.com/texiao/html5/canvas/1/ 代码: <html> <head> <meta http-equiv=&qu ...

  6. JVM原理讲解和调优

    一.什么是JVM JVM是Java Virtual Machine(Java虚拟机)的缩写,JVM是一种用于计算设备的规范,它是一个虚构出来的计算机,是通过在实际的计算机上仿真模拟各种计算机功能来实现 ...

  7. HTML5资料

    1 Canvas教程 <canvas>是一个新的用于通过脚本(通常是JavaScript)绘图的HTML元素.例如,他可以用于绘图.制作图片的组合或者简单的动画(当然并不那么简单).It ...

  8. [转载]"百度方法+"案例—从持续集成到持续交付

    前言 百度开放云(https://bce.baidu.com)是百度基于十五年基础架构核心技术积累推出的云服务,目前推出了14个云计算产品和9个大数据产品,并提供数字营销云.在线教育.物联网等10种解 ...

  9. Bois设置教程

    BIOS设置图解教程之Award篇 (目前主板上常见的BIOS主要为AMI与AWARD两个系列,如何辨别BIOS品牌系列请移步,本文详细讲解Award系列的BIOS设置图解教程,如果你的BIOS为AM ...

随机推荐

  1. Matplotlib学习---用matplotlib画直方图/密度图(histogram, density plot)

    直方图用于展示数据的分布情况,x轴是一个连续变量,y轴是该变量的频次. 下面利用Nathan Yau所著的<鲜活的数据:数据可视化指南>一书中的数据,学习画图. 数据地址:http://d ...

  2. Python里format()方法基本使用

    '''第一种:自然连接''' #format 连接字符串 str = '{}使用的python是{}版本'.format('我','3.6.5') print(str) #打印结果:我使用的pytho ...

  3. POI如何自动调整Excel单元格中字体的大小

    问题 目的是要将Excel中的文字全部显示出来,可以设置对齐格式为[缩小字体填充],但是这样的话只能展示出一行数据,字体会变得很小.还有一种办法,设置对齐格式为[自动换行],然后让单元格中的字体自动调 ...

  4. IDEA @Contract annotation

    IDEA @Contract annotation ----------------------------------- http://www.jetbrains.com/help/idea/con ...

  5. python学习日记(深浅copy)

    赋值 #赋值,指向同一内存地址 l1 = [1,2,3,4,5] l2 = l1 print(l1,l2) print(id(l1),id(l2)) 浅copy #浅copy,第一层互相独立,创建了新 ...

  6. 【agc030f】Permutation and Minimum(动态规划)

    [agc030f]Permutation and Minimum(动态规划) 题面 atcoder 给定一个长度为\(2n\)的残缺的排列\(A\),定义\(b_i=min\{A_{2i-1},A_{ ...

  7. 【CodeChef】Querying on a Grid(分治,最短路)

    [CodeChef]Querying on a Grid(分治,最短路) 题面 Vjudge CodeChef 题解 考虑分治处理这个问题,每次取一个\(mid\),对于\(mid\)上的三个点构建最 ...

  8. 浏览器在DPI缩放时变化问题

    在高分辨笔记本电脑上,如果使用了"放大".那么原来在笔记本上很小的字和图就看起来大很多了.看起来舒服. 这个笔记本电脑是 1920 1080 装W10,系统推荐说125%佳.于是设 ...

  9. APIO2018解题报告

    今年的APIO好邪啊. T1铁人两项 题目大意 给一个无向图,问有多少三元组(三个元素两两不同)使得它们构成一条简单路径 . 题解 无向图这种东西不好直接处理,考虑点双缩点建圆方树. 然后就出现了一个 ...

  10. nginx常用配置

    nginx.conf配置文件详解 其主要分为几个模块 全局快 从开始到events块之间的一部分内容,其作用域为全局作用域 events块 主要负责Nginx服务器与用户的网络连接 常用设置: 是否开 ...