使用R的数据库查询
JS
很多方法可以用R查询数据。这篇文章展示了三种最常见的方法:
运用 DBI
使用dplyr语法
使用R note book
背景
最近的一些软件包改进可以更轻松地将数据库与R一起使用。下面的查询示例演示了这些R软件包的一些功能。
DBI。该DBI规范经历了许多最近的改进。使用数据库时,应始终使用符合要求DBI的包。
dplyr和dbplyr。该dplyr软件包现在具有用于与数据库通信的通用SQL后端,新dbplyr软件包将R代码转换为特定于数据库的SQL。在撰写R代码时,以下数据库支持SQL转化:Oracle,Microsoft SQL Server,PostgreSQL,Amazon Redshift,Apache Hive和Apache Impala。随着时间的推移会有更多。
odbc。odbc只要安装了ODBC驱动程序,R包就提供了连接到任何数据库的标准方法。所述odbcř包是DBI兼容的,并建议用于ODBC连接。
RStudio最近对其产品进行了改进,因此它们可以更好地与数据库配合使用。
RStudio IDE(v1.1)。使用最新版本的RStudio IDE,可以连接,浏览和查看各种数据库中的数据。IDE具有用于设置新连接的向导,以及用于浏览已建立连接的选项卡。这些新功能是可扩展的,可以与任何具有连接契约的 R包一起使用。
RStudio 。如果使用的是RStudio专业产品,可以免费下载RStudio Professional Drivers。以下示例使用Oracle ODBC驱动程序。如果使用的是开源工具,则可以使用自己的驱动程序或使用社区程序包 - 存在许多用于连接各种数据库的开源驱动程序和社区程序包。
将数据库与R一起使用是一个广泛的主题,还有更多工作要做。早期的博客文章讨论了我们的愿景。该愿景的一部分是创建一个网站,可以在一个地方找到有关数据库和R的所有内容。要了解更多信息,请访问我们的网站db.rstudio.com。
示例:查询Oracle数据库中的库数据
在此示例中,我们将查询Oracle数据库中的银行数据。我们使用DBI和odbc包连接到数据库。此特定连接需要数据库驱动程序和数据源名称(DSN),这两者都由系统管理员配置。您的连接可能使用其他方法。
library(DBI)
library(dplyr)
library(dbplyr)
library(odbc)
con - dbConnect(odbc::odbc(), Oracle DB)
1.使用查询 DBI
您可以DBI使用该dbGetQuery()功能查询数据。只需将SQL代码粘贴到R函数中作为带引号的字符串。此方法有时称为传递SQL代码,可能是查询数据的最简单方法。应谨慎使用,以根据需要逃避您的报价。例如,'yes'写成'yes'。
dbGetQuery(con,'
select month_idx, year, month,
sum(case when term_deposit = \'yes\' then 1.0 else 0.0 end) as subscribe,
count(*) as total
from bank
group by month_idx, year, month
')
2.使用dplyr语法进行查询
您可以用dplyr语法编写代码,并将dplyr代码转换为SQL。在dplyr语法中编写查询有几个好处:您可以为R对象和数据库表保持相同的一致语言,不需要SQL或特定的SQL变体,您可以利用dplyr使用延迟评估的事实。dplyr语法很容易阅读,但您始终可以使用该show_query()函数检查SQL转换。
q1 - tbl(con, bank) %%
group_by(month_idx, year, month) %%
summarise(
subscribe = sum(ifelse(term_deposit == yes, 1, 0)),
total = n())
show_query(q1)
SELECT month_idx, year, month, SUM(CASE WHEN (term_deposit = 'yes') THEN (1.0) ELSE (0.0) END) AS subscribe, COUNT(*) AS totalFROM (bank)
GROUP BY month_idx, year, mo
3.使用Rnote book 查询
您是否知道可以在R Notebook代码块中运行SQL代码?要使用SQL,请在“ 文件”“新建文件”菜单下的RStudio IDE中打开R Notebook。使用,启动新的代码块,并使用代码块选项指定您的连接。如果要将查询输出发送到R数据帧,请在代码块选项中使用。指定时,您将能够在后续R代码块中使用输出。在这个例子中,我们使用输出。{sql}connection=conoutput.var = mydataframeoutput.varggplot2
SELECT month_idx, year, month, SUM(CASE WHEN (term_deposit = 'yes') THEN (1.0) ELSE (0.0) END) AS subscribe,
COUNT(*) AS totalFROM (bank)
GROUP BY month_idx, year, month
library(ggplot2)
ggplot(mydataframe, aes(total, subscribe, color = year)) +
geom_point() +
xlab(Total contacts) +
ylab(Term Deposit Subscriptions) +
ggtitle(Contact volume)
image.png
摘要
使用R查询数据没有单一的最佳方法。您可以选择多种方法,每种方法都有其优点。以下是使用本文中介绍的方法的一些优点。
方法
好处
DBI :: dbGetQuery
需要的依赖性更少
dplyr语法
对R和数据库对象使用相同的语法
不需要SQL知识
代码是SQL变体的标准
懒惰的评价
R Notebook SQL引擎
复制并粘贴SQL - 无需格式化
SQL语法突出显示
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