scRNA-seq单细胞测序数据分析工具汇总
本文总结自一篇综述:
Computational approaches for interpreting scRNA-seq data
单细胞分析分为两个层次:
- cell level
- gene level
Tools for the visualization and clustering of cells.
Tools for the ordering of cells & bifurcation/branch identification
Tools for gene-level analysis
scRNA-seq单细胞测序数据分析工具汇总的更多相关文章
- 基于单细胞测序数据构建细胞状态转换轨迹(cell trajectory)方法总结
细胞状态转换轨迹构建示意图(Trapnell et al. Nature Biotechnology, 2014) 在各种生物系统中,细胞都会展现出一系列的不同状态(如基因表达的动态变化等),这些状态 ...
- 单细胞测序技术(single cell sequencing)
单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02 来源: 一呼百诺 点击次数:6587关键词: 前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向 ...
- 微生物组学数据分析工具综述 | 16S+宏基因组+宏病毒组+宏转录组--转载
转载:https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ 建立在高通量测序基础上的微生物群落研究,当前主要有三大类:基于16S/18S/ITS等扩增子做 ...
- 这个数据分析工具秒杀Excel,可视化分析神器!
入门Excel容易,想要精通就很难了,大部分人通过学习能掌握60%的基础操作,但是一些复杂数据可视化分析就需要用到各种技巧,操作理解难度加深 Excel作为一直是使用最广泛的数据表格工具,在数据量日 ...
- Excel入门简单,想要进阶实属不易?推荐这个数据分析工具
大数据时代,数据分析在我们的日常生活和工作中应用越来越广泛,不管是公司的行政.人事.销售.运营还是专业的数据分析师,都经常需要通过数据来发现业务问题,因此数据分析正逐渐成为职场通用能力. 说到数据分析 ...
- [转载] 一共81个,开源大数据处理工具汇总(下),包括日志收集系统/集群管理/RPC等
原文: http://www.36dsj.com/archives/25042 接上一部分:一共81个,开源大数据处理工具汇总(上),第二部分主要收集整理的内容主要有日志收集系统.消息系统.分布式服务 ...
- 从零开始学数据分析,什么程度可以找到工作?( 内附20G、5000分钟数据分析工具教程大合集 )
从零开始学数据分析,什么程度可以找到工作?( 内附20G.5000分钟数据分析工具教程大合集 ) 我现在在Coursera上面学data science 中的R programming,过去很少接 ...
- App运营者必须知道的30款数据分析工具
如今的移动应用早已不再是某种结构单一.功能简单的工具了.当我们的移动应用变得越来越庞杂,我们便会需要借用分析工具,来跟踪和分析App内的每一个部分.幸运的是,目前市面上有许多数据分析工具可供App开发 ...
- 备忘--简单比较SPSS、RapidMiner、KNIME以及Kettle四款数据分析工具
SPSS.RapidMiner.KNIME以及Kettle四款工具都可以用来进行数据分析,只是彼此有各自的侧重点和有劣势.它们都可以逐步的定义数据分析过程,也同样都可以对数据进行ETL处理.笔者从自己 ...
随机推荐
- java常用功能
1.复制文件 private void fileChannelCopy(File source, File target) throws IOException { FileInputStream f ...
- 本地缓存之GUAVA
项目开发中,很多配置数据需要缓存,一般来说,开发人员都会手动写HashMap,HashSet或者ConcurrentHashMap,ConcurrentHashSet缓存数据,但是这样的缓存往往存在内 ...
- Python 运算符与基本数据类型
一.运算符 1.算数运算: 2.比较运算: 3.赋值运算: 4.逻辑运算: 5.成员运算: 二.基本数据类型 1.空(None) 表示该值是一个空对象,空值是Python里一个特殊的值,用None表示 ...
- python xml childNodes,childNodes[1].childNodes[0].data例子
xml: <?xml version='1.0' encoding='utf-8'?><!--this is a test about xml--><booklist t ...
- python3.4学习笔记(二十五) Python 调用mysql redis实例代码
python3.4学习笔记(二十五) Python 调用mysql redis实例代码 #coding: utf-8 __author__ = 'zdz8207' #python2.7 import ...
- SpringBoot之集成WebSocket
websocket是什么不做介绍.开发环境:jdk1.8,win7_64旗舰版,idea 1.初始化一个springboot项目 2.加入websocket依赖 <!-- springb ...
- 如何使用Unity制作虚拟导览(一)
https://www.cnblogs.com/yangyisen/p/5108289.html Unity用来制作游戏已经是目前市场上的一个发展趋势,而且有越来越多的公司与开发者不断的加入,那么Un ...
- MySQL Crash Course #19# Chapter 27. Globalization and Localization
Globalization and Localization When discussing multiple languages and characters sets, you will run ...
- Python面试题之装饰器漫谈
讲 Python 装饰器前,我想先举个例子,虽有点污,但跟装饰器这个话题很贴切. 每个人都有的内裤主要功能是用来遮羞,但是到了冬天它没法为我们防风御寒,咋办?我们想到的一个办法就是把内裤改造一下,让它 ...
- P2486 [SDOI2011]染色
P2486 [SDOI2011]染色 树链剖分 用区间修改线段树维护 对于颜色段的计算:sum[o]=sum[lc]+sum[rc] 因为可能重复计算,即左子树的右端点和右子树的左端点可能颜色相同 多 ...