scRNA-seq单细胞测序数据分析工具汇总
本文总结自一篇综述:
Computational approaches for interpreting scRNA-seq data
单细胞分析分为两个层次:
- cell level
- gene level

Tools for the visualization and clustering of cells.

Tools for the ordering of cells & bifurcation/branch identification

Tools for gene-level analysis

scRNA-seq单细胞测序数据分析工具汇总的更多相关文章
- 基于单细胞测序数据构建细胞状态转换轨迹(cell trajectory)方法总结
细胞状态转换轨迹构建示意图(Trapnell et al. Nature Biotechnology, 2014) 在各种生物系统中,细胞都会展现出一系列的不同状态(如基因表达的动态变化等),这些状态 ...
- 单细胞测序技术(single cell sequencing)
单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02 来源: 一呼百诺 点击次数:6587关键词: 前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向 ...
- 微生物组学数据分析工具综述 | 16S+宏基因组+宏病毒组+宏转录组--转载
转载:https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ 建立在高通量测序基础上的微生物群落研究,当前主要有三大类:基于16S/18S/ITS等扩增子做 ...
- 这个数据分析工具秒杀Excel,可视化分析神器!
入门Excel容易,想要精通就很难了,大部分人通过学习能掌握60%的基础操作,但是一些复杂数据可视化分析就需要用到各种技巧,操作理解难度加深 Excel作为一直是使用最广泛的数据表格工具,在数据量日 ...
- Excel入门简单,想要进阶实属不易?推荐这个数据分析工具
大数据时代,数据分析在我们的日常生活和工作中应用越来越广泛,不管是公司的行政.人事.销售.运营还是专业的数据分析师,都经常需要通过数据来发现业务问题,因此数据分析正逐渐成为职场通用能力. 说到数据分析 ...
- [转载] 一共81个,开源大数据处理工具汇总(下),包括日志收集系统/集群管理/RPC等
原文: http://www.36dsj.com/archives/25042 接上一部分:一共81个,开源大数据处理工具汇总(上),第二部分主要收集整理的内容主要有日志收集系统.消息系统.分布式服务 ...
- 从零开始学数据分析,什么程度可以找到工作?( 内附20G、5000分钟数据分析工具教程大合集 )
从零开始学数据分析,什么程度可以找到工作?( 内附20G.5000分钟数据分析工具教程大合集 ) 我现在在Coursera上面学data science 中的R programming,过去很少接 ...
- App运营者必须知道的30款数据分析工具
如今的移动应用早已不再是某种结构单一.功能简单的工具了.当我们的移动应用变得越来越庞杂,我们便会需要借用分析工具,来跟踪和分析App内的每一个部分.幸运的是,目前市面上有许多数据分析工具可供App开发 ...
- 备忘--简单比较SPSS、RapidMiner、KNIME以及Kettle四款数据分析工具
SPSS.RapidMiner.KNIME以及Kettle四款工具都可以用来进行数据分析,只是彼此有各自的侧重点和有劣势.它们都可以逐步的定义数据分析过程,也同样都可以对数据进行ETL处理.笔者从自己 ...
随机推荐
- boostrap小图标
- webstorm的个性化设置settings
如何更改主题(字体&配色):File -> settings -> Editor -> colors&fonts -> scheme name.主题下载地址 如 ...
- 简化document.createElement("div")动态生成层方法
我们在WEB开发时,很多时候往往需要我们 JavaScript 来动态建立 html 元素,动态的设置相关的属性.比方说我们想要建立一個 div 层,则可以使用以下代码实现. 一.直接建立functi ...
- ES6学习--Object.assign()
ES6提供了Object.assign(),用于合并/复制对象的属性. Object.assign(target, source_1, ..., source_n) 1. 初始化对象属性 构造器正是为 ...
- java安全体系之JCA、JCE、JAAS、JSSE及其关系
首先.如果是运行在internet上的系统,并且如果是个涉及到利益性的系统,不可避免的会遭受各种攻击(我们公司的很多系统从OS到DB到webapp就实时有收到攻击和破解),所以尽可能保证安全性将不再是 ...
- Autotools使用流程【转】
本文转载自:http://blog.csdn.net/scucj/article/details/6079052 手工写Makefile是一件很有趣的事情,对于比较大型的项目,如果有工具可以代劳,自然 ...
- 标准IO与文件IO 的区别【转】
本文转载自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_63f31f3401013jrn.html 先来了解下什么是标准IO以及文件IO. 标准IO:标准I/O是ANSI C建立的一 ...
- 如果恨一个程序员,忽悠他去做iOS开发
如果你恨一个程序员,忽悠他去做iOS开发.不管他背景是cobel还是 java,送他一本iOS开发的书.这种书最好是国人写的,容易以偏概全一点,相比洋鬼子的书,更容易学到皮毛.这叫舍不得孩子套不着狼, ...
- POJ 2752 Seek the Name, Seek the Fame(KMP中next的理解)题解
题意: 要求你给出每个前后缀相同的串的长度,比如: "alala"的前缀分别为{"a", "al", "ala", &q ...
- PAT第二次上机题目
5-1 #include <iostream> #include <cstdlib> using namespace std; template <class T> ...