geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换
在基因注释时，难免碰到各种GENE在不同数据库之间的ID转换（例如，Ensembl ID 转Entrez ID，或者Entrez ID与GENE Symbol之间的转换）。这里介绍一下常用的三个在线网站， DAVID、bioDBnet、Ensembl Biomart， DAVID访问太慢，Ensembl Biomart参数配置太麻烦，推荐使用bioDBnet。
bioDBnet RESET API
bioDBnet除支持web在线转换外，还提供了RESET API接口，允许程序语言(python、perl、R等)进行访问。
参考资料
geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换的更多相关文章
- org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID，symbol等之间的转换)
1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...
- JSON字符串和JS对象之间的转换
JSON字符串和JS对象之间的转换 1 json字符串转换为js对象 1.1 标准json格式字符串转换为Js对象 JSON字符串 str JSON.parse(str) eval(str) eva ...
- C# Stream 和 byte[] 之间的转换
一. 二进制转换成图片 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position = ; Image img = Image.FromStream( ...
- Java基础——基本类型和包装类、基本类型和字符串之间的转换
基本类型和包装类之间的转换 基本类型和包装类之间经常需要互相转换,以 Integer 为例(其他几个包装类的操作雷同哦): 在 JDK1.5 引入自动装箱和拆箱的机制后,包装类和基本类型之间的转换就更 ...
- String类型和基本数据类型之间的转换
Java 中基本类型和字符串之间的转换 在程序开发中,我们经常需要在基本数据类型和字符串之间进行转换. 其中,基本类型转换为字符串有三种方法: 1. 使用包装类的 toString() 方法 2. 使 ...
- Json与javaBean之间的转换工具类
/** * Json与javaBean之间的转换工具类 * * {@code 现使用json-lib组件实现 * 需要 * json-lib-2.4-jdk15.jar * ...
- Stream 和 byte[] 之间的转换
Stream 和 byte[] 之间的转换 一. 二进制转换成图片 ? 1 2 3 4 5 MemoryStream ms = new MemoryStream(bytes); ms.Position ...
- 百度坐标（BD09）、国测局坐标（火星坐标，GCJ02）、和WGS84坐标系之间的转换（JS版代码）
/** * Created by Wandergis on 2015/7/8. * 提供了百度坐标(BD09).国测局坐标(火星坐标,GCJ02).和WGS84坐标系之间的转换 */ //定义一些常量 ...
- java中的字符，字符串，数字之间的转换
string 和int之间的转换 string转换成int :Integer.valueOf("12") int转换成string : String.valueOf(12) ch ...
随机推荐
- 20165101刘天野 2018-2019-2《网络对抗技术》Exp7 网络欺诈防范
目录 20165101刘天野 2018-2019-2<网络对抗技术>Exp7 网络欺诈防范 1.实验内容 1.1 简单应用SET工具建立冒名网站 1.2 ettercap DNS spoo ...
- Ansible Ad-Hoc命令集
Ad-Hoc Ad-Hoc就是 “临时命令”, 从功能上讲 Ad-Hoc跟Ansible-playbook都差不多,Ansible提供了两种完成任务的方式: Ad-Hoc命令集与Ansible-pla ...
- shell 定义变量
注意定义变量的语法: var="ABC" 等号之间不能有空格,否则会报错
- TMS Scripter importtool的使用
uses ap_DateUtils; showmessage(dayof(now)); //注册delphi对象或变量 : IDEScripter1 IDEScripter1.AddConstan ...
- 算法（Algorithms）第4版 练习 1.5.6
对于weighted quick-union,对每个输入数据对,其最大的循环次数为lgN(sites) 故对于109 sites和106 input pairs,其总的指令次数为:sum = lg10 ...
- jQuery绑定事件的四种方式区别
jQuery中提供了四种事件监听方式,分别是bind.live.delegate.on,对应的解除监听的函数分别是unbind.die.undelegate.off.在开始看他们之前 一:bind(t ...
- MySQL中NOT IN语句对NULL值的处理
与使用in时不同: 在使用in 时: SELECT COUNT(name) FROM CVE WHERE name NOT IN ('CVE-1999-0001', 'CVE-1999-0002'); ...
- 9 python 数据类型—字典
字典是python中唯一的映射类型,采用键值对(key-value)的形式存储数据.python对key进行哈希函数运算,根据计算的结果决定value的存储地址,所以字典是无序存储的,且key必须是可 ...
- python-编译安装Python2.7
yum中最新的也是Python 2.6.6,只能下载Python 2.7.5的源代码自己编译安装. 操作步骤如下: 1)下载并解压Python 2.7.9的源代码 cd /opt wget --no- ...
- C语言小程序（一）、判断三角型类型
最近回炉重造C语言,陆续写一些比较短的代码,选择其中的一些贴到这里,都是在Linux下的代码,Windows未测试. 第一个判断三角形的类型,两个浮点型数据不能直接判断相等,为了输入方便一些,自己设置 ...