bioconduction 主页

http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html

安装

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager") BiocManager::install("org.Hs.eg.db")

有时可能因为镜像或者网络的原因导致安装失败

我在 RStudio 使用 清华的镜像

在线文档

http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/manuals/org.Hs.eg.db/man/org.Hs.eg.db.pdf

使用

library(org.Hs.eg.db)

org.Hs.eg.db的更多相关文章

  1. org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID,symbol等之间的转换)

    1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...

  2. R 语言 select函数在org.Hs.eg.db上的运用

    首先org.Hs.eg.db是一个关于人类的 一,在R中导入包library(org.Hs.eg.db) http://www.bioconductor.org/packages/release/da ...

  3. 使用clusterprofile做聚类分析

    library(clusterProfiler ) #cat test.txt gene_symbol EXOSC10ARHGEF10LVWA5B1SRRM1PTAFRCSMD2SH3GLB1GBP6 ...

  4. R: 修改镜像、bioconductor安装及go基因富集分析

    1.安装bioconductor及go分析涉及的相关包 source("http://bioconductor.org/biocLite.R") options(BioC_mirr ...

  5. GSEA - Gene set enrichment analysis 基因集富集 | ORA - Over-Representation Analysis 分析原理与应用

    RNA-seq是利器,大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据,所以RNA-seq的分析需求应该是很大的(大部分的生信从业人员应该都差不多要沾边吧). 普通的转录组套路并不多,差异表达基因.富集分析. ...

  6. org注释包

    1.注释包 物种 OrgDB 按蚊(Anopheles) org.Ag.eg.db 拟南芥(Arabidopsis) org.At.tair.db 牛(Brovine) org.Bt.eg.db 蠕虫 ...

  7. java基础学习总结——线程(一)

    一.线程的基本概念

  8. 探索gff/gtf格式

    参考: GFF格式说明 Generic Feature Format Version 3 (GFF3) 先下载一个 gtf 文件浏览一下 1 havana gene 11869 14409 . + . ...

  9. 探索Bioconductor数据包

    参考: R的bioconductor包TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene详解 Bioconductor的数据包library(org.Hs.eg.db)简介

随机推荐

  1. MySQL常用系统表汇总

    在这篇文章中: MySQL5.7 默认模式 Information_schema performance_schema mysql sys MYSQL SHOW 命令 致谢 概述 本篇文章虽大部分内容 ...

  2. windows下PyTorch安装之路记录

    最近两天被windows下pytorch的安装给搞得很烦了,不过在今天终于安装成功了,如下图所示 下面详细说下此次安装的详细记录吧.我的电脑环境是Windows10+cuda9.0+cudnn7.1. ...

  3. service的yaml说明

    apiVersion: v1 kind: Service metadata: name: nginx-service labels: app: nginx spec: ports: - port: 8 ...

  4. 01 .NET CORE 2.2 使用OCELOT -- 简单使用

    目前参考两篇文章,已实现基本的ocelot的网关功能. https://www.cnblogs.com/xlxr45/p/11320988.html https://www.jianshu.com/p ...

  5. Winfrom devexpress 通用权限框架

    毕业到现在也快两年了,手上的项目也有好几个,但总感觉不是狠理想,近来把手上杂七杂八的项目整理了一下,结合各个项目的优点,重新开发了一套winfrom+devexpress 通用权限(CS)框架(BS版 ...

  6. asp.net mvc ViewBag常用操作

    1.视图获取json类型数据 var str = '@(ViewBag.loginInfoList)'; if ($.trim(str).length>0) { re = new RegExp( ...

  7. 详解:Java字符串类型"switch"的底层原理

    前言: 最近更新得会比较频繁,希望大家见谅哦! 也感谢关注我的人,我会更加更加努力去做的! 基础 我们现在使用的Java的版本,基本上是都支持String类型的.当然除了String类型,还有int. ...

  8. GeoIP的使用-C语言版

    0x00. 简介 GeoIP库可以根据IP地址(支持IPv4 和 IPv6), 定位该IP所在的 洲.经纬度.国家.省市.ASN 等信息. GeoIP目前已经升级到GeoIP2,GeoIP2有两个版本 ...

  9. Vue2.0 新手入门 — 从环境搭建到发布

    什么是 Vue Vue 是一个前端框架,特点是数据绑定 比如你改变一个输入框 Input 标签的值,会自动同步更新到页面上其他绑定该输入框的组件的值 组件化 页面上小到一个按钮都可以是一个单独的文件. ...

  10. Kotlin开发springboot项目(一)

    Kotlin开发springboot项目(一) Kotlin语言与Xtend语言有很多相似之处 为什么会存在这么多JVM语言? 现存的语言提供了太过受限制的功能,要不就是功能太过繁杂,导致语言的臃肿和 ...