[hdu2457]DNA repair(AC自动机+dp)
题意:给出一些不合法的模式DNA串,给出一个原串,问最少需要修改多少个字符,使得原串中不包含非法串。
解题关键:多模式串匹配->AC自动机,求最优值->dp,注意在AC自动机上dp的套路。
AC自动机上的每个节点其实就是一种状态,进行模式匹配其实就是进行边的匹配
令$dp[i][j]$表示字符串长度为$i$时到达AC自动机上某个状态所需要修改的最小值。
转移方程:$dp[i + 1][Next[j][k]] = \min (dp[i][j] + (k! = str[i]),dp[i + 1][Next[j][k]])$
#include<cstdio>
#include<cstring>
#include<algorithm>
#include<cstdlib>
#include<cstring>
#include<iostream>
#include<queue>
#define inf 0x3f3f3f3f
using namespace std;
typedef long long ll;
const int N=;
const int MAXN=;
ll m,n;
int dp[][MAXN];
struct Trie{
int Next[MAXN][N],Fail[MAXN],root,tot;
bool End[MAXN];
int newnode(){
for(int i=;i<N;i++) Next[tot][i]=-;
End[tot++]=false;
return tot-;
}
void init(){
tot=;
root=newnode();
}
void insert(char buf[]){
int len=strlen(buf),now=root,k;
for(int i=;i<len;i++){
if(buf[i]=='A') k=;
else if(buf[i]=='G') k=;
else if(buf[i]=='C') k=;
else k=;
if(Next[now][k]==-) Next[now][k]=newnode();
now=Next[now][k];
}
End[now]=true;
}
void build(){
queue<int>que;
Fail[root]=root;
for(int i=;i<N;i++){
if(Next[root][i]==-) Next[root][i]=root;
else{
Fail[Next[root][i]]=root;
que.push(Next[root][i]);
}
}
while(!que.empty()){
int now=que.front();
que.pop();
if(End[Fail[now]]) End[now]=true;
for(int i=;i<N;i++){
if(Next[now][i]==-) Next[now][i]=Next[Fail[now]][i];//Next指针都已经建立好
else{
Fail[Next[now][i]]=Next[Fail[now]][i];
que.push(Next[now][i]);
}
}
}
}
int solve(char buf[]){
int len=strlen(buf);
for(int i=;i<=len;i++) for(int j=;j<=tot;j++) dp[i][j]=inf;
dp[][]=;
for(int i=;i<len;i++){//最主要的事情就是分清边和点
int tmp;
if(buf[i]=='A') tmp=;
else if(buf[i]=='G') tmp=;
else if(buf[i]=='C') tmp=;
else tmp=;
for(int j=;j<tot;j++){
if(dp[i][j]==inf||End[j]) continue;
for(int k=;k<;k++){
int u=Next[j][k];
if(End[u]) continue;
dp[i+][u]=min(dp[i][j]+(tmp!=k),dp[i+][u]);
}
}
}
int ans=inf;
for(int i=;i<tot;i++) ans=min(ans,dp[len][i]);
return ans==inf?-:ans;
}
}; Trie ac;
char buf[];
int main(){
int ca=;
while(scanf("%d",&n)&&n){
ca++;
ac.init();
for(int i=;i<n;i++) scanf("%s",buf),ac.insert(buf);
ac.build();
scanf("%s",buf);
int ans=ac.solve(buf);
printf("Case %d: %d\n",ca,ans);
}
}
[hdu2457]DNA repair(AC自动机+dp)的更多相关文章
- HDU2457 DNA repair —— AC自动机 + DP
题目链接:https://vjudge.net/problem/HDU-2457 DNA repair Time Limit: 5000/2000 MS (Java/Others) Memory ...
- HDU 2457/POJ 3691 DNA repair AC自动机+DP
DNA repair Problem Description Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains ...
- POJ 3691 DNA repair(AC自动机+DP)
题目链接 能AC还是很开心的...此题没有POJ2778那么难,那个题还需要矩阵乘法,两个题有点相似的. 做题之前,把2778代码重新看了一下,回忆一下当时做题的思路,回忆AC自动机是干嘛的... 状 ...
- POJ3691 DNA repair(AC自动机 DP)
给定N个长度不超过20的模式串,再给定一个长度为M的目标串S,求在目标串S上最少改变多少字符,可以使得它不包含任何的模式串 建立Trie图,求得每个节点是否是不可被包含的串,然后进行DP dp[i][ ...
- HDU 2457 DNA repair (AC自动机+DP)
题意:给N个串,一个大串,要求在最小的改变代价下,得到一个不含上述n个串的大串. 思路:dp,f[i][j]代表大串中第i位,AC自动机上第j位的最小代价. #include<algorithm ...
- hdu_2457_DNA repair(AC自动机+DP)
题目连接:hdu_2457_DNA repair 题意: 给你N个字符串,最后再给你一个要匹配的串,问你最少修改多少次,使得这个串不出现之前给的N的字符串 题解: 刚学AC自动机,切这题还真不知道怎么 ...
- poj 2778 DNA Sequence AC自动机DP 矩阵优化
DNA Sequence Time Limit: 1000MS Memory Limit: 65536K Total Submissions: 11860 Accepted: 4527 Des ...
- POJ 2778 DNA Sequence (AC自动机+DP+矩阵)
题意:给定一些串,然后让你构造出一个长度为 m 的串,并且不包含以上串,问你有多少个. 析:很明显,如果 m 小的话 ,直接可以用DP来解决,但是 m 太大了,我们可以认为是在AC自动机图中,根据离散 ...
- HDU2457 DNA repair(AC自动机+DP)
题目一串DNA最少需要修改几个基因使其不包含一些致病DNA片段. 这道题应该是AC自动机+DP的入门题了,有POJ2778基础不难写出来. dp[i][j]表示原DNA前i位(在AC自动机上转移i步) ...
随机推荐
- inch mil mm换算
inch:英寸 mil:密耳 mm:毫米 1mil=0.0254mm=25.4um 1mm=39.37mil 1inch=1000mil=25.4mm
- project 2013 激活 key 7YHNW-RVCQY-VBDB2-QX69Q-B96WK viso 66DNF-28W69-W4PPV-W3VYT-TJDBQ
project 2013 激活 key :7YHNW-RVCQY-VBDB2-QX69Q-B96WK viso2013 激活 key:66DNF-28W69-W4PPV-W3VYT-TJDBQ 软件 ...
- kubernetes之多容器pod以及通信
系列目录 容器经常是为了解决单一的,窄范围的问题,比如说微服务.然而现实中,一些复杂问题的完成往往需要多个容器.这里我们讨论一下如何把多个容器放在同一个pod里以及容器间的通信 什么是pod pod是 ...
- Python编写的ARP扫描工具
源码如下: rom scapy.all import * import threading import argparse import logging import re logging.getLo ...
- C# 操作World生成报告
直接上代码 using System; using System.IO; using System.Data; using Word = Microsoft.Office.Interop.Word; ...
- Java类加载器( 死磕9)
[正文]Java类加载器( CLassLoader ) 死磕9: 上下文加载器原理和案例 本小节目录 9.1. 父加载器不能访问子加载器的类 9.2. 一个宠物工厂接口 9.3. 一个宠物工厂管理 ...
- cocos2d-js v3事件管理器
总概: 1.时间监听器(cc.EventListener)封装用户的事件处理逻辑. 2.事件管理器(cc.eventManager)管理用户注册的事件监听器. 3.事件对象(cc.Event)包含事件 ...
- Qt JSON解析生成笔记
对于这样一段json { "name": "布衣食", "gender": "Male", "age" ...
- 关于indexOf的使用
今天项目中出现一个bug,在筛选数据的时候出现了冗余数据,查找发现在indexOf方法判断的时候找到了问题的所在. package demo; public class test { public s ...
- 在iOS平台使用ffmpeg解码h264视频流(转)
在iOS平台使用ffmpeg解码h264视频流,有需要的朋友可以参考下. 对于视频文件和rtsp之类的主流视频传输协议,ffmpeg提供avformat_open_input接口,直接将文件路径或UR ...