Seurat | 单细胞分析工具
Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用。
最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章。
Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species
主要目的:identifying subpopulations of cells that are present across multiple data sets
主要就是为了多样品之间的比较,甚至不同物种间的对比。
Overview of Seurat alignment workflow
We aimed to develop a diverse integration strategy that could compare scRNA-seq data sets across different conditions, technologies, or species.
Identifying shared correlation structures across data sets
Machine-learning techniques for ‘data fusion’ aim to integrate information from multiple experiments into a consistent representation.
待续~
Seurat | 单细胞分析工具的更多相关文章
- Android代码分析工具lint学习
1 lint简介 1.1 概述 lint是随Android SDK自带的一个静态代码分析工具.它用来对Android工程的源文件进行检查,找出在正确性.安全.性能.可使用性.可访问性及国际化等方面可能 ...
- 【转】gc日志分析工具
性能测试排查定位问题,分析调优过程中,会遇到要分析gc日志,人肉分析gc日志有时比较困难,相关图形化或命令行工具可以有效地帮助辅助分析. Gc日志参数 通过在tomcat启动脚本中添加相关参数生成gc ...
- Java 性能分析工具 , 第 3 部分: Java Mission Control
引言 本文为 Java 性能分析工具系列文章第三篇,这里将介绍如何使用 Java 任务控制器 Java Mission Control 深入分析 Java 应用程序的性能,为程序开发人员在使用 Jav ...
- Java 性能分析工具 , 第 2 部分:Java 内置监控工具
引言 本文为 Java 性能分析工具系列文章第二篇,第一篇:操作系统工具.在本文中将介绍如何使用 Java 内置监控工具更加深入的了解 Java 应用程序和 JVM 本身.在 JDK 中有许多内置的工 ...
- Java 性能分析工具 , 第 1 部分: 操作系统工具
引言 性能分析的前提是将应用程序内部的运行状况以及应用运行环境的状况以一种可视化的方式更加直接的展现出来,如何来达到这种可视化的展示呢?我们需要配合使用操作系统中集成的程序监控工具和 Java 中内置 ...
- 系统级性能分析工具perf的介绍与使用
测试环境:Ubuntu16.04(在VMWare虚拟机使用perf top存在无法显示问题) Kernel:3.13.0-32 系统级性能优化通常包括两个阶段:性能剖析(performance pro ...
- KRPano资源分析工具使用说明(KRPano XML/JS解密 切片图批量下载 球面图还原 加密混淆JS还原美化)
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:htt ...
- 使用KRPano资源分析工具强力加密KRPano项目(XML防破解,切片图保护,JS反调试)
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:htt ...
- 使用KRPano资源分析工具分析动态网站资源
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:htt ...
随机推荐
- AnswerOpenCV一周佳作欣赏(0615-0622)
一.How to make auto-adjustments(brightness and contrast) for image Android Opencv Image Correction i' ...
- 20155201 网络攻防技术 实验九 Web安全基础
20155201 网络攻防技术 实验九 Web安全基础 一.实践内容 本实践的目标理解常用网络攻击技术的基本原理.Webgoat实践下相关实验. 二.报告内容: 1. 基础问题回答 1)SQL注入攻击 ...
- jsoup对 HTML 文档的解析和操作
本文手动转载自http://www.cnblogs.com/chenying99/archive/2013/01/04/2844615.html,仅根据个人需要对实用部分进行转载,详细请阅读原文. j ...
- topcoder srm 315 div1
problem1 link 直接模拟即可. import java.util.*; import java.math.*; import static java.lang.Math.*; publi ...
- UFS 介绍 1[【转】
本文转载自:https://blog.csdn.net/u014645605/article/details/52063624 硬件架构: 接口示意图: UFS 速度和emmc的对比 UFS2.1 U ...
- Master of GCD 【线段树区间更新 || 差分】
Master of GCD 时间限制: 1 Sec 内存限制: 128 MB 提交: 670 解决: 112 [提交] [状态] [命题人:admin] 题目描述 Hakase has n num ...
- bzoj1565: [NOI2009]植物大战僵尸 最大权闭合子图,tarjan
bzoj1565: [NOI2009]植物大战僵尸 链接 https://www.lydsy.com/JudgeOnline/problem.php?id=1565 思路 很容易的想到最大权闭合子图 ...
- SpringBoot Mybatis问题收集
1.在SpringBoot中打印mybatis中执行的sql 其实在application.properties 文件下,添加一下配置即可: logging.level.org.springframe ...
- 【做题】uoj#370滑稽树上滑稽果——巧妙dp
一个显然的结论是最终树的形态必然是一条链.具体证明只要考虑选定树上的某一条链,然后把其他部分全部接在它后面,这样答案一定不会变劣. 那么,一开始的想法是考虑每一位的最后出现位置,但这并不容易实现.注意 ...
- NRF24L01模块配置
发射数据时: (1)首先将nRF24L01配置为发射模式 (2)接着把接收节点地址TX_ADDR和有效数据TX_PLD按照时序由SPI口写入nRF24L01缓存区,TX_PLD必须在CSN为低 ...