Linux安装HDF5及遇到的问题总结

转自: http://www.linuxdiyf.com/linux/26164.html
 
ubuntu版本:16.04.2 64位
从HDF官网(https://support.hdfgroup.org/HDF5/)上下载hdf5-1.8.17.tar.gz
 
简要安装步骤如下:(详细步骤:hdf5-1.8.17/release_docs/INSTALL)
$ gunzip < hdf5-X.Y.Z.tar.gz | tar xf -   #解压缩
$ cd hdf5-X.Y.Z
$ ./configure --prefix=/usr/local/hdf5  #安装路径
$ make
$ make check                # run test suite.
$ make install
$ make check-install        # verify installation.
注:X.Y.Z是HDF版本
 
安装成功后,在安装目录/usr/local下出现hdf5文件夹,打开后
在/share/hdf5_examples/下是示例程序。打开c文件夹,下面我们来测试。该文件夹下有个名为run-c-ex.sh文件,执行该文件可以将c目录下所有.c文件执行。
运行命令:$ sudo ./run-c-ex.sh
即可得到所有文件的执行结果。
 
打开run-c-ex.sh文件可查看该文件内容如下
 
下面我们来讲怎么执行单个.c文件,以/usr/local/hdf5/share/hdf5_examples/c目录下h5_extend.c为例
执行 $ sudo h5cc -o h5_extend h5_extend.c
可是却报出错误:h5cc:command not found
我们在命令行输入h5cc,可以看到
提示我们h5cc没有安装,按照指示,我们输入sudo apt install hdf5-helpers
接下来再执行,却报出hdf5.h: No such file or directory的错误
只要安装libhdf5-serial-dev就可以了。
执行命令:$ sudo apt-get install libhdf5-serial-dev
再次执行 $ sudo h5cc -o h5_extend h5_extend.c
没有问题,执行:$ ./h5_extend
在/share/hdf5_examples/c目录下除了生成h5_extend和h5_extend.o两个文件,还有extend.h5文件。
 
下面介绍一个可视化工具HDFView,它可以用来查看和编辑HDF文件。(https://support.hdfgroup.org/products/Java/hdfview/)
下载HDFView,即可查看我们刚刚得到的extend.h5
 
 

 

【转】Linux安装HDF5及遇到的问题总结的更多相关文章

  1. torch7 安装 并安装 hdf5模块 torch模块 nn模块 (系统平台为 ubuntu18.04 版本)

    今年的CCF A会又要开始投稿了,实验室的师弟还在玩命的加实验,虽然我属于特殊情况是该从靠边站被老板扶正但是实验室的事情我也尽力的去帮助大家,所以师弟在做实验的时候遇到了问题也会来问问我,这次遇到的一 ...

  2. 搜狗输入法linux安装 以及 12个依赖包下载链接分享

    搜狗输入法linux安装版,先安装各种依赖包,大概12个依赖,可能中途还需要其他依赖,可以效仿解决依赖问题.如图这12个文件要是手动点击下载,那也太笨点了,我们要用shell命令批量下载.命令如下:w ...

  3. linux安装php

    接上篇:linux安装apache 一.安装php 先安装libxml2库 [root@ctxsdhy package]# yum -y install libxml2-devel 最新地址在:htt ...

  4. linux安装oracle11g

    准备oracle安装文件 Oracle11gR2包含两个文件linux_11gR2_database_1of2.zip和linux_11gR2_database_2of2.zip,将这两个文件通过SS ...

  5. TODO:Linux安装PHP MongoDB驱动

    TODO:Linux安装PHP MongoDB驱动 PHP利于学习,使用广泛,主要适用于Web开发领域. MongoDB的主要目标是在键/值存储方式(提供了高性能和高度伸缩性)以及传统的RDBMS系统 ...

  6. Symantec Backup Exec 2010 Agent For Linux安装

    以前写过一篇文章介绍过Symantec Backup Exec 2012 Agent For Linux安装安装,今天介绍一下Symantec Backup Exec 2010 Agent For L ...

  7. Symantec Backup Exec 2012 Agent For Linux安装

    Backup Exec 2012 介绍 Backup Exec 2012 是一种为虚拟和物理环境提供保护的集成产品,能够简化备份和灾难恢复,并提供了无可匹敌的恢复功能.借助于强大的 Symantec ...

  8. linux 安装jdk

    1.Linux安装JDK步骤1. 先从网上下载jdk(jdk-1_5_0_02-linux-i586.rpm) ,推荐SUN的官方网站www.sun.com,下载后放在/home目录中,当然其它地方也 ...

  9. Hadoop Linux安装

    Hadoop Linux安装 步骤流程 1.硬件准备 2.软件准备(推荐CDH) 3.将Hadoop安装包分发到各个节点下 4.安装JDK 5.修改/etc/hosts配置文件 6.设置SSH免密码登 ...

随机推荐

  1. LimeSDR Getting Started Quickly | LimeSDR上手指南

    0x00 概览 LimeSDR部分特性: USB 3.0 : 4 x Tx 发射天线接口 6 x Rx 接收天线接口: 可用于Wi-Fi, GSM, UMTS, LTE, LoRa, Bluetoot ...

  2. HDU 6075 Questionnaire 17多校4 水题

    Problem Description In order to get better results in official ACM/ICPC contests, the team leader co ...

  3. element.dataset API

    不久之前我向大家展示了非常有用的classList API,它是一种HTML5里提供的原生的对页面元素的CSS类进行增.删改的接口,完全可以替代jQuery里的那些CSS类操作方法.而另外一个非常有用 ...

  4. 新建oracle数据库表空间及删除表空间和用户

    进入oracle的命令控制台,按具体情况执行以下命令: sqlplus 默认数据库普通用户登录sqlplus / as sysdba 默认数据库管理员登录sqlplus username/passwo ...

  5. Python学习笔记第十四周

    目录: 一.HTML 1.概述 2.HTML 二.CSS 一.HTML 1.概述 HTML是英文Hyper Text Mark-up Lang(超文本标记语言)的缩写,他是一种制作万维网页面的标准语言 ...

  6. Android全局可调试(ro.debuggable = 1)的一种另类改法

    网上流传比较多的,是重打包boot.img.读aosp的init进程源码,发现通过patch init进程也可以实现相同目的. 首先看一下init进程对ro只读属性的检查: /* property_s ...

  7. printf 汇总

    //u32为unsigned long u32 g_u32FiveSecondCount = 0; mysprintf(TempBuf, "\r\n%ld Uart console.&quo ...

  8. WCF 添加服务引用 HTTP 请求已超过为 00:00:00 分配的超时。为此操作分配的时间可能是较长超时

    今天在用公司的笔记本引用WCF的时候,处于一直等待的过程,一直在下载信息,一直等了很长时间,弹出了一个消息 下载“http://ip:8085/xxxxx/xxxxx/mex/$metadata”时出 ...

  9. 利用scrapy下载图片保存到本地

    1.先声明一下,起始位置已经是将所有的图片链接都能到pipelines.py中 2.创建一个类,继承于ImagesPipeline,因此也就需要导入ImagesPipeline from scrapy ...

  10. 大型网站系统与Java中间件实践读书笔记

    转载:http://blog.csdn.net/ioscodelover/article/details/45047869 1.分布式系统相对集中式而言,是指多台计算机互相通过消息通信进行协作而对外提 ...