3D Slicer Reconstruct CT/MRI

1. Load DCM file of your CT/MRI

2. Go to Volume Rendering, click the eye button to show volume

3. Go to Editor -> Threshold Effect -> Change Threshold (only include the head) -> Apply

4. Go to Editor - > Make Model Effect -> Apply

5. Go to Volume Rendering, click the eye button to hide volume

6. Go to Models, find the reconstructed model

Remove Redundant Points in MeshLab

1. Load model into MeshLab

2. Go to Edit -> Select Connected Components in a region.

3. Select some points on the part you want to keep, MeshLab will automatically select all the connected components.

4.Go to Filters -> Selection -> Invert Selection

5. Press Delete button on your keyboard

6. Go to File -> Export Mesh As... to save the clean model

Reference:

https://www.youtube.com/watch?v=MKLWzD0PiIc

3D Slicer Reconstruct CT/MRI的更多相关文章

  1. 使用3D Slicer对图像进行配准

    在进行深度学习之前,我们需要图像进行一些预处理操作,其中配准是很重要的一环,以下将介绍使用软件3D Slicer来进行图像配准 3D Slicer是(1)一个软件平台,用以图像分析(包括配准和实时编辑 ...

  2. 3D Slicer Programmatically Set Slice Offset and Intersections 用代码修改Slicer中的切片偏移和交叉点显示

    在3D Slicer中,当我们导入.mha/.mhd等格式的volume文件后,那么我们就可以在Axial, Sagittal, Coronal三个方向来观察我们的MRI或者CT的图像了.3D Sli ...

  3. 3D Slicer中文教程(七)—图像中值滤波

    1.中值滤波概念 中值滤波是对一个滑动窗口内的诸像素灰度值排序,用其中值代替窗口中心象素的原来灰度值,它是一种非线性的图像平滑法,它对脉冲干扰级椒盐噪声的抑制效果好,在抑制随机噪声的同时能有效保护边缘 ...

  4. 3D Slicer中文教程(八)—导出STL文件

    一.STL文件简介 STL(立体平版印刷术的缩写)是由3D Systems创建的立体平版印刷CAD软件原生的文件格式STL有“标准三角语言”和“标准镶嵌语言”等几个事后回溯.这种文件格式是由许多其他软 ...

  5. 3D Slicer中文教程(六)—调用matlab函数(MatlabBridge使用方法)

    1.安装MatlabBridge插件 (1)在工具栏找到Extension,点击进入Extension Manager (2)找到MatlabBridge,安装 2.配置MATLAB环境 (1)在模块 ...

  6. 3D Slicer中文教程(五)—三维视图颜色改变

    3D Slicer在分割后三维重建的图像,效果很好,但是存在一定的不足,默认的颜色并不是很合适,这时手动设置三维视图下的需要的颜色就很有必要了.如下图所示,默认的三维重建后的颜色. 这样的颜色显然不是 ...

  7. 3D Slicer中文教程(四)—图像分割

    1.数据获取 (1)下载3D Slicer自带的样本数据 (2)选择自由的数据 (3)网上数据库等其他方式下载数据 2.分割工具 Segment Editor是一个用于分割的模块.细分(也称为轮廓)描 ...

  8. 3D Slicer中文教程(三)—数据加载及保存方式

    1.打开数据与保存数据 (1)打开数据 ——可以将数据拖拽到3D Slicer应用窗口或者从菜单栏工具栏打开. ——多种方式加载大量数据. 有关DICOM数据,请参阅DICOM模块文档. 对于几乎所有 ...

  9. 3D Slicer中文教程(一)—下载及安装方法

    3D Slicer是用于医学图像信息学,图像处理和三维可视化的开源软件平台. 通过国家卫生研究院和全球开发人员社区的支持,二十多年来,Slicer为医生,研究人员和公众提供了免费,强大的跨平台加工工具 ...

随机推荐

  1. 常见问题1:默认div隐藏,点击按钮时出现,再点击时隐藏。

    例:默认div隐藏,点击按钮时出现,再点击时隐藏. <a href="#" onclick="f('ycbc')"; >控制按钮</a> ...

  2. 在 iOS 中信任手动安装的证书描述文件

    在 iOS 10.3 及更高版本中,手动安装包含证书有效负载的描述文件时,这个证书不会自动受 SSL 信任.   在安装通过电子邮件发送给您或从网站下载的描述文件时,您必须手动开启受 SSL 信任. ...

  3. 介绍三款串口监控工具:Device Monitoring Studio,portmon,Comspy

    在开发上位机下位机通讯程序时,有一个好的监控工具会事半功倍.特在网上找了几款串口监控软件,作了简单对比: 一.Device Monitoring Studio 网址:http://www.hhdsof ...

  4. 为什么大多公司不要培训班出来的JAVA程序员?

    经常听到这样的观点:很多公司不招聘培训班出来的学生.甚至于让人感觉,如果你参加过培训,那简直就是你程序员职业生涯中的一大污点. 撸码J总结了这些公司不要培训班学生的理由: 一:简历造假 网上有大量的帖 ...

  5. netty中的ChannelHandler和ChannelPipeline

    netty中的ChannelHandler和ChannelPipeline ChannelHandler 家族 https://www.w3cschool.cn/essential_netty_in_ ...

  6. C++ 中的不定参数与格式化字符串 # ## vsprintf

    日志打印或者格式字符串时,可能会用到不定参数的使用,这里记录一下. 格式化字符串有很多方法: snprintf std::stringstream # ##的使用 ##是一个连接符号,用于把参数连在一 ...

  7. 未能加载文件或程序集“SuperMap.Data.dll”

    重新配置的新的开发环境,使用的是原来的工程文件,编译通过,运行报错:"未能加载文件或程序集"SuperMap.Data.dll"或它的某一个依赖项.找不到指定的模块&qu ...

  8. 【开源】C#信息抽取系统【招募C#队友】

    FDDC2018金融算法挑战赛02-A股上市公司公告信息抽取 更新时间 2018年7月11日 By 带着兔子去旅行 信息抽取是NLP里的一个实用内容.该工具的目标是打造一个泛用的自动信息抽取工具.使得 ...

  9. C# 多线程调用静态方法或者静态实例中的同一个方法-方法内部的变量是线程安全的

    C#  多线程调用静态方法或者静态实例中的同一个方法-方法内部的变量是线程安全的 using System;using System.Threading;using System.Threading. ...

  10. Docker在windows下的使用【二】

    可参考学习地址: 极客学院docker教程,还不错,可以参考 1.Dockerhub下载镜像 下载地址:Dockerhub地址 有两种方式可以获得新的镜像 直接从dockerhub下载编译好的imag ...