神经网络高维互信息计算Python实现(MINE)
论文
Belghazi, Mohamed Ishmael, et al. “ Mutual information neural estimation .” International Conference on Machine Learning . 2018.
利用神经网络的梯度下降法可以实现快速高维连续随机变量之间互信息的估计,上述论文提出了Mutual Information Neural Estimator (MINE)。NN在维度和样本量上都是线性可伸缩的,MI的计算可以通过反向传播进行训练。
核心
Python实现
现有github上的代码无法计算和估计高维随机变量,只能计算一维随机变量,下面的代码给出的修改方案能够计算真实和估计高维随机变量的真实互信息。
其中,为了计算理论的真实互信息,我们不直接暴力求解矩阵(耗时,这也是为什么要有MINE的原因),我们采用给定生成随机变量的参数计算理论互信息。
SIGNAL_NOISE = 0.2
SIGNAL_POWER = 3
完整代码基于pytorch
# Name: MINE_simple
# Author: Reacubeth
# Time: 2020/12/15 18:49
# Mail: noverfitting@gmail.com
# Site: www.omegaxyz.com
# *_*coding:utf-8 *_*
import numpy as np
import torch
import torch.nn as nn
from tqdm import tqdm
import matplotlib.pyplot as plt
SIGNAL_NOISE = 0.2
SIGNAL_POWER = 3
data_dim = 3
num_instances = 20000
def gen_x(num, dim):
return np.random.normal(0., np.sqrt(SIGNAL_POWER), [num, dim])
def gen_y(x, num, dim):
return x + np.random.normal(0., np.sqrt(SIGNAL_NOISE), [num, dim])
def true_mi(power, noise, dim):
return dim * 0.5 * np.log2(1 + power/noise)
mi = true_mi(SIGNAL_POWER, SIGNAL_NOISE, data_dim)
print('True MI:', mi)
hidden_size = 10
n_epoch = 500
class MINE(nn.Module):
def __init__(self, hidden_size=10):
super(MINE, self).__init__()
self.layers = nn.Sequential(nn.Linear(2 * data_dim, hidden_size),
nn.ReLU(),
nn.Linear(hidden_size, 1))
def forward(self, x, y):
batch_size = x.size(0)
tiled_x = torch.cat([x, x, ], dim=0)
idx = torch.randperm(batch_size)
shuffled_y = y[idx]
concat_y = torch.cat([y, shuffled_y], dim=0)
inputs = torch.cat([tiled_x, concat_y], dim=1)
logits = self.layers(inputs)
pred_xy = logits[:batch_size]
pred_x_y = logits[batch_size:]
loss = - np.log2(np.exp(1)) * (torch.mean(pred_xy) - torch.log(torch.mean(torch.exp(pred_x_y))))
# compute loss, you'd better scale exp to bit
return loss
model = MINE(hidden_size)
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01)
plot_loss = []
all_mi = []
for epoch in tqdm(range(n_epoch)):
x_sample = gen_x(num_instances, data_dim)
y_sample = gen_y(x_sample, num_instances, data_dim)
x_sample = torch.from_numpy(x_sample).float()
y_sample = torch.from_numpy(y_sample).float()
loss = model(x_sample, y_sample)
model.zero_grad()
loss.backward()
optimizer.step()
all_mi.append(-loss.item())
fig, ax = plt.subplots()
ax.plot(range(len(all_mi)), all_mi, label='MINE Estimate')
ax.plot([0, len(all_mi)], [mi, mi], label='True Mutual Information')
ax.set_xlabel('training steps')
ax.legend(loc='best')
plt.show()
结果
变量维度为1
变量维度为3
需要指出的是在计算最终的互信息时需要将基数e转为基数2。如果只是求得一个比较值,在真实使用的过程中可以省略。
本文的文字及图片来源于网络,仅供学习、交流使用,不具有任何商业用途,如有问题请及时联系我们以作处理
想要获取更多Python学习资料可以加
QQ:2955637827私聊
或加Q群630390733
大家一起来学习讨论吧!
神经网络高维互信息计算Python实现(MINE)的更多相关文章
- 基于神经网络的混合计算(DNC)-Hybrid computing using a NN with dynamic external memory
前言: DNC可以称为NTM的进一步发展,希望先看看这篇译文,关于NTM的译文:人工机器-NTM-Neutral Turing Machine 基于神经网络的混合计算 Hybrid computing ...
- 北京地铁月度消费总金额计算(Python版)
最近业余时间在学习Python,这是那天坐地铁时突发奇想,想看看我这一个月的地铁费共多少钱,所以简单的构思了下思路,就直接开写了,没想到用Python来实现还挺简单的. 设计思路: 每次乘车正常消费7 ...
- 函数计算 Python 连接 SQL Server 小结
python 连接数据库通常要安装第三方模块,连接 MS SQL Server 需要安装 pymssql .由于 pymsql 依赖于 FreeTDS,对于先于 2.1.3 版本的 pymssql,需 ...
- GIL计算python 2 和 python 3 计算密集型
首先我画了一张图来表示GIL运行的方式: Python 3执行如下计算代码:#-*-conding:utf-8-*-import threading import timedef add(): n = ...
- 计算Python运行时间
可以调用datetime 或者 time库实现得到Python运行时间 方法1 import datetime start_t = datetime.datetime.now() #运行大型代码 e ...
- 机器学习作业(四)神经网络参数的拟合——Python(numpy)实现
题目下载[传送门] 题目简述:识别图片中的数字,训练该模型,求参数θ. 出现了一个问题:虽然训练的模型能够有很好的预测准确率,但是使用minimize函数时候始终无法成功,无论设计的迭代次数有多大,如 ...
- 相似度与距离计算python代码实现
#定义几种距离计算函数 #更高效的方式为把得分向量化之后使用scipy中定义的distance方法 from math import sqrt def euclidean_dis(rating1, r ...
- 计算Python代码运行时间长度方法
在代码中有时要计算某部分代码运行时间,便于分析. import time start = time.clock() run_function() end = time.clock() print st ...
- 菜鸟之路——机器学习之BP神经网络个人理解及Python实现
关键词: 输入层(Input layer).隐藏层(Hidden layer).输出层(Output layer) 理论上如果有足够多的隐藏层和足够大的训练集,神经网络可以模拟出任何方程.隐藏层多的时 ...
随机推荐
- word选择+快捷键
统一修改红色章节标题字体:将鼠标放置在章节标题中,前提是各章节标题采用的格式是一样的,单击"选择"-"选择格式相似的文本"即可全部选中进行设置 如下图,章节标题 ...
- linux命令-awk,sort,uniq
学习地址:http://man.linuxde.net/awk#awk的工作原理 awk 选项参数说明: -F fs or --field-separator fs 指定输入文件折分隔符,fs是一个字 ...
- 【模板】【P3605】【USACO17JAN】Promotion Counting 晋升者计数——动态开点和线段树合并(树状数组/主席树)
(题面来自Luogu) 题目描述 奶牛们又一次试图创建一家创业公司,还是没有从过去的经验中吸取教训--牛是可怕的管理者! 为了方便,把奶牛从 1⋯N(1≤N≤100,000) 编号,把公司组织成一棵树 ...
- Java继承的两道实验题目
设计一个表示二维平面上点的类Point,包含有表示坐标位置的Protect类型的成员变量 获取和设置x和y值的public方法 package classwork_6; public class Po ...
- ZAB
ZAB=ZooKeeper Atomic Broadcast ZooKeeper原子消息广播协议,支持崩溃回复的原子广播协议. zk使用一个单一的主进程来接受并处理客户端的所有事务请求,并采用ZAB的 ...
- LaTex中的中文处理方法
相关代码与注释: 显示效果:
- 交换机Access、Trunk和Hybrid 接口类型及区别
交换机接口的类型可以是 Access.Trunk和Hybrid. Access类型的接口仅属于一个VLAN,只能接收.转发相应VLAN的帧: Trunk类型接口则默认属于所有VLAN,任何 Tagge ...
- 痞子衡嵌入式:深入i.MXRT1050系列ROM中串行NOR Flash启动初始化流程
大家好,我是痞子衡,是正经搞技术的痞子.今天痞子衡给大家分享的是深入i.MXRT1050系列ROM中串行NOR Flash启动初始化流程. 从外部串行NOR Flash启动问题是i.MXRT系列开发最 ...
- Python中str类型的字符串写入二进制文件时报TypeError错的处理方式
在用二进制模式打开文件情况下,写入一个str对象时报错:TypeError: a bytes-like object is required, not 'str' 出现该问题是因为Python严格区分 ...
- PyQt(Python+Qt)学习随笔:QListView的flow属性
老猿Python博文目录 专栏:使用PyQt开发图形界面Python应用 老猿Python博客地址 QListView的flow属性用于控制视图中的数据排列方向,其类型为枚举类型QListView.F ...