python 离群点检测
- import numpy as np
- import pandas as pd
- from sklearn.cluster import KMeans
- import matplotlib.pyplot as mp
- def get_data_zs(inputfile):
- data = pd.read_excel(inputfile, index_col='Id', encoding='gb18030')
- data_zs = 1.0 * (data - data.mean()) / data.std()
- return data, data_zs
- def model_data_zs(data, k, b):
- model = KMeans(n_clusters=k, n_jobs=4, max_iter=b)
- model.fit(data_zs)
- # 标准化数据及其类别
- r = pd.concat(
- [data_zs, pd.Series(model.labels_, index=data.index)], axis=1)
- # print(r.head())
- # 每个样本对应的类别
- r.columns = list(data.columns) + [u'聚类类别'] # 重命名表头
- return model, r, k
- def make_norm(model, k):
- norm = []
- for i in range(k):
- norm_tmp = r[['R', 'F', 'M']][
- r[u'聚类类别'] == i] - model.cluster_centers_[i]
- norm_tmp = norm_tmp.apply(np.linalg.norm, axis=1) # 求出绝对距离
- norm.append(norm_tmp / norm_tmp.median()) # 求相对距离并添加
- norm = pd.concat(norm)
- return norm
- def draw_discrete_point(threshold):
- mp.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']
- mp.rcParams['axes.unicode_minus'] = False
- norm[norm <= threshold].plot(style='go') # 正常点
- discrete_points = norm[norm > threshold] # 离散点阈值
- discrete_points.plot(style='rs')
- # print(discrete_points)
- for i in range(len(discrete_points)): # 离群点做标记
- id = discrete_points.index[i]
- n = discrete_points.iloc[i]
- mp.annotate('(%s,%0.2f)' % (id, n), xy=(id, n), xytext=(id, n))
- mp.xlabel(r'编号')
- mp.ylabel(r'相对距离')
- mp.show()
- if __name__ == '__main__':
- inputfile = 'data/consumption_data.xls'
- threshold = 2 # 离散点阈值
- k = 3 # 聚类类别
- b = 500 # 聚类最大循环次数
- data, data_zs = get_data_zs(inputfile)
- model, r, k = model_data_zs(data, k, b)
- norm = make_norm(model, k)
- draw_discrete_point(threshold)
- print('All Done')
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