Do not add complex clothes/facial hair to a model for Mixamo to auto rig, it will cause confusion.

Adjust your character to this T pose as much as possible. If you are doing an A pose, the two thigh (upLeg) bones might be misplaced.

Animation retargeting: mapping, change base pose

https://docs.unrealengine.com/latest/INT/Engine/Animation/RetargetingDifferentSkeletons/

Generating UE4 assets: Migrate to a foldler called "Content", otherwise the references might be broken

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