fold change的意义[转载]
转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html
1.解释
解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 的绝对表达值倍数变化(fold-change)来作为补充。
Fold change 用于描述一个初始值到一个最终值的变化程度。
1、例如,若初始值为30,最终值为60,则相应的fold change为2,或者可以描述为一个2折的增长。fold change仅仅靠最终值与初始值的比率计算即可得到。
2、例如,若初始值为A,最终值为B,则fold change为B/A。
3、再举一个例子,从80变到20,则fold change为0.25,反之,20变到80的fold change为4。一些开发值将小于1的fold change替换为对应的负数。
4、例如,从80变到20时,认为fold change为-4(即负4折)。
fold change经常用于微阵列芯片和RNA序列实验的基因表达数据分析,用来度量基因的表达水平。
fold change的意义[转载]的更多相关文章
- Fold Change和t分布
基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid ...
- fold change(ratio)
fold change 英文简称 : FC 中文全称 : 倍性变化 所属分类 : 生物科学 词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法.例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那 ...
- 差异基因分析:fold change(差异倍数), P-value(差异的显著性)
在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意 ...
- FFT的物理意义(转载)
文章转载自: http://blog.sina.com.cn/s/blog_640029b301010xkv.html FFT是离散傅立叶变换的快速算法,可以将一个信号变换到频域.有些信号在时域上是很 ...
- Z-score(Z值)的意义--转载
http://blog.sina.com.cn/s/blog_72208a6a0101cdt1.html http://www.docin.com/p-350677620.html http://we ...
- 对CCLE数据库可以做的分析--转载
转载:http://www.bio-info-trainee.com/1327.html 收集了那么多的癌症细胞系的表达数据,拷贝数变异数据,突变数据,总不能放着让它发霉吧! 这些数据可以利用的地方非 ...
- 关于BETA、RC、ALPHA、Release、GA等版本号的意义
关于BETA.RC.ALPHA.Release.GA等版本号的意义 转载 2016年06月19日 00:04:00 2049 0 1 . 最近由于工作需要经常要去SVN上拉开源项目的源码,对项目 ...
- 使用Trinity拼接以及分析差异表达一个小例子
使用Trinity拼接以及分析差异表达一个小例子 2017-06-12 09:42:47 293 0 0 Trinity 将测序数据分为许多独立的de Brujin grap ...
- 使用limma、Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌
使用limma.Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, Luyi ...
随机推荐
- VC++ 实现窗口抖动
RECT rect; int x, y, nWidth, nHeight; GetWindowRect(&rect); x = rect.left; y = rect.top; nWidth ...
- WAMP设置默认访问目录
打开httpd.conf 1.修改:DocumentRoot "F:/Project/Php" 2.修改 <Directory "F:/Project/Php&qu ...
- nginx配置语法
http://baijiahao.baidu.com/s?id=1604485941272024493&wfr=spider&for=pc http://blog.csdn.net/h ...
- 【RF库Collections测试】Get Slice From List
Name:Get Slice From ListSource:Collections <test library>Arguments:[ list_ | start=0 | end=Non ...
- git的常见问题
今天把电脑清理了下再push就出问题了 ,报这个错Failed with error: fatal: unable to access 'https://git.oschina.net/dubo_/G ...
- Microchip编译器产品线—MPLAB XC简介
以下为Microchip最新编译器产品线—MPLAB-XC简介 MPLAB-XC:适合所有PIC单片机和项目的编译器解决方案 Microchip最新编译器产品线—MPLAB-XC为项目开发的软件需求提 ...
- 【转】实现Ribbon风格的窗体
随着office2007的兴起,微软让我们看到了Ribbon风格的窗体,现在很多软件也都开始使用Ribbon风格.那么我们如果要自己开发,应当怎么做呢?本文就是为大家解开这个疑团的. 首先,Delph ...
- MyBatis——日志
Logging Mybatis内置的日志工厂提供日志功能,具体的日志实现有以下几种工具: SLF4J Apache Commons Logging Log4j 2 Log4j JDK logging ...
- java反序列化漏洞的检测
1.首先下载常用的工具ysoserial 这边提供下载地址:https://jitpack.io/com/github/frohoff/ysoserial/master-v0.0.5-gb617b7b ...
- 移动端touch事件滚动
本来想用在北京欢乐谷手机上用touch事件来模拟局部左右内容滚动里,但在touchmove上下滚动时由于禁止了默认事件而body滚动条不能滚动,虽然可以根据touchmove的坐标来判断方向,但体验效 ...