K-均值聚类及其在生物信息中的应用
如果一点基础没有最好先拿起一本教材开始学,《机器学习实战》还不错,P93,书上有python源码和练习数据,非常适合新手。
k均值聚类
名词:簇;相似度算法
伪代码
创建K个点作为起始质心
当任意一个点的簇分配结果发生变化时:
对数据集中的每个点:
对每个质心:
计算质心到数据点之间的距离
将数据点分配到距离其最近的簇
对每一个簇,计算簇中所有点的均值并将均值作为质心
目前的例子里聚类的对象都是数值点,这个在计算均值时比较容易理解,如果换到对人进行聚类(非数值),那怎么计算均值呢?
二分k均值聚类
数值型数据的聚类比较简单,尤其是坐标型的数据,那如何对非数值型数据进行聚类呢?
在生物信息中的应用
待续~
K-均值聚类及其在生物信息中的应用的更多相关文章
- 【转】算法杂货铺——k均值聚类(K-means)
k均值聚类(K-means) 4.1.摘要 在前面的文章中,介绍了三种常见的分类算法.分类作为一种监督学习方法,要求必须事先明确知道各个类别的信息,并且断言所有待分类项都有一个类别与之对应.但是很多时 ...
- 5-Spark高级数据分析-第五章 基于K均值聚类的网络流量异常检测
据我们所知,有‘已知的已知’,有些事,我们知道我们知道:我们也知道,有 ‘已知的未知’,也就是说,有些事,我们现在知道我们不知道.但是,同样存在‘不知的不知’——有些事,我们不知道我们不知道. 上一章 ...
- 机器学习实战5:k-means聚类:二分k均值聚类+地理位置聚簇实例
k-均值聚类是非监督学习的一种,输入必须指定聚簇中心个数k.k均值是基于相似度的聚类,为没有标签的一簇实例分为一类. 一 经典的k-均值聚类 思路: 1 随机创建k个质心(k必须指定,二维的很容易确定 ...
- 机器学习理论与实战(十)K均值聚类和二分K均值聚类
接下来就要说下无监督机器学习方法,所谓无监督机器学习前面也说过,就是没有标签的情况,对样本数据进行聚类分析.关联性分析等.主要包括K均值聚类(K-means clustering)和关联分析,这两大类 ...
- 第十篇:K均值聚类(KMeans)
前言 本文讲解如何使用R语言进行 KMeans 均值聚类分析,并以一个关于人口出生率死亡率的实例演示具体分析步骤. 聚类分析总体流程 1. 载入并了解数据集:2. 调用聚类函数进行聚类:3. 查看聚类 ...
- K均值聚类的失效性分析
K均值聚类是一种应用广泛的聚类技术,特别是它不依赖于任何对数据所做的假设,比如说,给定一个数据集合及对应的类数目,就可以运用K均值方法,通过最小化均方误差,来进行聚类分析. 因此,K均值实际上是一个最 ...
- K均值聚类
聚类(cluster)与分类的不同之处在于, 分类算法训练过程中样本所属的分类是已知的属监督学习. 而聚类算法不需要带有分类的训练数据,而是根据样本特征的相似性将其分为几类,又称为无监督分类. K均值 ...
- ML: 聚类算法-K均值聚类
基于划分方法聚类算法R包: K-均值聚类(K-means) stats::kmeans().fpc::kmeansruns() K-中心点聚类(K-Medoids) ...
- 探索sklearn | K均值聚类
1 K均值聚类 K均值聚类是一种非监督机器学习算法,只需要输入样本的特征 ,而无需标记. K均值聚类首先需要随机初始化K个聚类中心,然后遍历每一个样本,将样本归类到最近的一个聚类中,一个聚类中样本特征 ...
随机推荐
- XMLHttpRequest 2.0与FileReader接口的方法
jsonpd的实现: var jsonp = function (options) { var url = options.url, params = options.params || {}, ca ...
- jquery easyui中文培训文档
目 录 1.... Accordion(可折叠标签)... 2 1.1 实例... 2 1.2 参数... 3 2.... DateBox(日期框)... 4 2 ...
- ContentProvider官方教程(9)定义一个provider完整示例:实现方法,定义权限等
Creating a Content Provider In this document Designing Data Storage Designing Content URIs Implement ...
- MTK6589下传感器框架结构和代码分析以及传感器的参数指标
MTK6589下传感器框架结构和代码分析以及传感器的参数指标 作者:韩炜彬 中国当代著名嵌入式研究专家 一. 模块框架 1)配置 路径:Alps/mediatek/config/$(pro ...
- 【leetcode❤python】121. Best Time to Buy and Sell Stock
#-*- coding: UTF-8 -*- #Method1 :超时#class Solution(object):# def maxProfit(self, prices):# # ...
- Threads in Spring
使用Spring时经常会问,我们定义的Bean应该是Singleton还是Prototype?多个客户端同时调用Dao层,需要考虑线程安全吗?通过阅读官方文档和Spring的源代码,这类问题的答案是: ...
- UVA 607 二十二 Scheduling Lectures
Scheduling Lectures Time Limit:3000MS Memory Limit:0KB 64bit IO Format:%lld & %llu Submi ...
- hdu 4946 Area of Mushroom(凸包)
链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=4946 Area of Mushroom Time Limit: 2000/1000 MS (Java/Ot ...
- 测试框架Mockito使用笔记
Mockito,测试框架,语法简单,功能强大! 静态.私有.构造等方法测试需要配合PowerMock,PowerMock有Mockito和EasyMock两个版本,语法相同,本文只介绍Mockito. ...
- WPF基础学习第二天(高级控件)
1.Menu菜单控件 Exp1: Code: <Window x:Class="菜单Menu.MainWindow" xmlns="http://schemas.m ...