如果一点基础没有最好先拿起一本教材开始学,《机器学习实战》还不错,P93,书上有python源码和练习数据,非常适合新手。

k均值聚类

名词:簇;相似度算法

伪代码

创建K个点作为起始质心
当任意一个点的簇分配结果发生变化时:
对数据集中的每个点:
对每个质心:
计算质心到数据点之间的距离
将数据点分配到距离其最近的簇
对每一个簇,计算簇中所有点的均值并将均值作为质心

目前的例子里聚类的对象都是数值点,这个在计算均值时比较容易理解,如果换到对人进行聚类(非数值),那怎么计算均值呢?

 

二分k均值聚类

 


数值型数据的聚类比较简单,尤其是坐标型的数据,那如何对非数值型数据进行聚类呢?

用Python实现文档聚类

 

在生物信息中的应用

 

 

待续~

K-均值聚类及其在生物信息中的应用的更多相关文章

  1. 【转】算法杂货铺——k均值聚类(K-means)

    k均值聚类(K-means) 4.1.摘要 在前面的文章中,介绍了三种常见的分类算法.分类作为一种监督学习方法,要求必须事先明确知道各个类别的信息,并且断言所有待分类项都有一个类别与之对应.但是很多时 ...

  2. 5-Spark高级数据分析-第五章 基于K均值聚类的网络流量异常检测

    据我们所知,有‘已知的已知’,有些事,我们知道我们知道:我们也知道,有 ‘已知的未知’,也就是说,有些事,我们现在知道我们不知道.但是,同样存在‘不知的不知’——有些事,我们不知道我们不知道. 上一章 ...

  3. 机器学习实战5:k-means聚类:二分k均值聚类+地理位置聚簇实例

    k-均值聚类是非监督学习的一种,输入必须指定聚簇中心个数k.k均值是基于相似度的聚类,为没有标签的一簇实例分为一类. 一 经典的k-均值聚类 思路: 1 随机创建k个质心(k必须指定,二维的很容易确定 ...

  4. 机器学习理论与实战(十)K均值聚类和二分K均值聚类

    接下来就要说下无监督机器学习方法,所谓无监督机器学习前面也说过,就是没有标签的情况,对样本数据进行聚类分析.关联性分析等.主要包括K均值聚类(K-means clustering)和关联分析,这两大类 ...

  5. 第十篇:K均值聚类(KMeans)

    前言 本文讲解如何使用R语言进行 KMeans 均值聚类分析,并以一个关于人口出生率死亡率的实例演示具体分析步骤. 聚类分析总体流程 1. 载入并了解数据集:2. 调用聚类函数进行聚类:3. 查看聚类 ...

  6. K均值聚类的失效性分析

    K均值聚类是一种应用广泛的聚类技术,特别是它不依赖于任何对数据所做的假设,比如说,给定一个数据集合及对应的类数目,就可以运用K均值方法,通过最小化均方误差,来进行聚类分析. 因此,K均值实际上是一个最 ...

  7. K均值聚类

    聚类(cluster)与分类的不同之处在于, 分类算法训练过程中样本所属的分类是已知的属监督学习. 而聚类算法不需要带有分类的训练数据,而是根据样本特征的相似性将其分为几类,又称为无监督分类. K均值 ...

  8. ML: 聚类算法-K均值聚类

    基于划分方法聚类算法R包: K-均值聚类(K-means)                   stats::kmeans().fpc::kmeansruns() K-中心点聚类(K-Medoids) ...

  9. 探索sklearn | K均值聚类

    1 K均值聚类 K均值聚类是一种非监督机器学习算法,只需要输入样本的特征 ,而无需标记. K均值聚类首先需要随机初始化K个聚类中心,然后遍历每一个样本,将样本归类到最近的一个聚类中,一个聚类中样本特征 ...

随机推荐

  1. hbase centOS生产环境配置笔记 (1 NameNode, 1 ResourceManager, 3 DataNode)

    本次是第一次在生产环境部署HBase,本文若有配置上的不妥之处还请高手指正. hadoop版本:hadoop-2.4.1 HBase版本:hbase-0.98.6.1-hadoop2 Zookeepe ...

  2. jquery简单插件到复杂插件(1)--tabs

    写在前面,到了新公司开始转做前段,之前一直写php,一共写了半年,转过来,jq都用不好,但是还是得不断的学习,谁没菜过.从最简单的开始写,最近也在学习些html5的小游戏,加油吧.js原生写的可以说惨 ...

  3. 2016年12月13日 星期二 --出埃及记 Exodus 21:8

    2016年12月13日 星期二 --出埃及记 Exodus 21:8 If she does not please the master who has selected her for himsel ...

  4. 2016年11月22日 星期二 --出埃及记 Exodus 20:13

    2016年11月22日 星期二 --出埃及记 Exodus 20:13 "You shall not murder.不可杀人.

  5. 2016年10月29日 星期六 --出埃及记 Exodus 19:14

    2016年10月29日 星期六 --出埃及记 Exodus 19:14 After Moses had gone down the mountain to the people, he consecr ...

  6. EF 增删改查

    StudentEntities entities = new StudentEntities(); //初始化对象 Register register = new Register(); #regio ...

  7. http_load的安装及使用方法

    http_load 程序非常小,解压后也不到100K http_load以并行复用的方式运行,用以测试web服务器的吞吐量与负载.但是它不同于大多数压力测试工 具,它可以以一个单一的进程运行,一般不会 ...

  8. Cheatsheet: 2014 11.01 ~ 11.30

    Mobile Android SDK: Working with Picasso View Debugging in Xcode 6 5 Common C# tasks in Apple Swift ...

  9. 【原创】pads layout 画多边形copper,出现Self-Intersecting Polygon,解决办法

    在做线性位移传感器的电路板时,需要在一个很小的多边形Copper操作,总是提示“Self-Intersecting Polygon”报错,意思是outline线自身交叉,换句话说就是线宽与多边形尺寸没 ...

  10. [SAP ABAP开发技术总结]字段符号FIELD-SYMBOLS

    声明:原创作品,转载时请注明文章来自SAP师太技术博客( 博/客/园www.cnblogs.com):www.cnblogs.com/jiangzhengjun,并以超链接形式标明文章原始出处,否则将 ...