如果一点基础没有最好先拿起一本教材开始学,《机器学习实战》还不错,P93,书上有python源码和练习数据,非常适合新手。

k均值聚类

名词:簇;相似度算法

伪代码

创建K个点作为起始质心
当任意一个点的簇分配结果发生变化时:
对数据集中的每个点:
对每个质心:
计算质心到数据点之间的距离
将数据点分配到距离其最近的簇
对每一个簇,计算簇中所有点的均值并将均值作为质心

目前的例子里聚类的对象都是数值点,这个在计算均值时比较容易理解,如果换到对人进行聚类(非数值),那怎么计算均值呢?

 

二分k均值聚类

 


数值型数据的聚类比较简单,尤其是坐标型的数据,那如何对非数值型数据进行聚类呢?

用Python实现文档聚类

 

在生物信息中的应用

 

 

待续~

K-均值聚类及其在生物信息中的应用的更多相关文章

  1. 【转】算法杂货铺——k均值聚类(K-means)

    k均值聚类(K-means) 4.1.摘要 在前面的文章中,介绍了三种常见的分类算法.分类作为一种监督学习方法,要求必须事先明确知道各个类别的信息,并且断言所有待分类项都有一个类别与之对应.但是很多时 ...

  2. 5-Spark高级数据分析-第五章 基于K均值聚类的网络流量异常检测

    据我们所知,有‘已知的已知’,有些事,我们知道我们知道:我们也知道,有 ‘已知的未知’,也就是说,有些事,我们现在知道我们不知道.但是,同样存在‘不知的不知’——有些事,我们不知道我们不知道. 上一章 ...

  3. 机器学习实战5:k-means聚类:二分k均值聚类+地理位置聚簇实例

    k-均值聚类是非监督学习的一种,输入必须指定聚簇中心个数k.k均值是基于相似度的聚类,为没有标签的一簇实例分为一类. 一 经典的k-均值聚类 思路: 1 随机创建k个质心(k必须指定,二维的很容易确定 ...

  4. 机器学习理论与实战(十)K均值聚类和二分K均值聚类

    接下来就要说下无监督机器学习方法,所谓无监督机器学习前面也说过,就是没有标签的情况,对样本数据进行聚类分析.关联性分析等.主要包括K均值聚类(K-means clustering)和关联分析,这两大类 ...

  5. 第十篇:K均值聚类(KMeans)

    前言 本文讲解如何使用R语言进行 KMeans 均值聚类分析,并以一个关于人口出生率死亡率的实例演示具体分析步骤. 聚类分析总体流程 1. 载入并了解数据集:2. 调用聚类函数进行聚类:3. 查看聚类 ...

  6. K均值聚类的失效性分析

    K均值聚类是一种应用广泛的聚类技术,特别是它不依赖于任何对数据所做的假设,比如说,给定一个数据集合及对应的类数目,就可以运用K均值方法,通过最小化均方误差,来进行聚类分析. 因此,K均值实际上是一个最 ...

  7. K均值聚类

    聚类(cluster)与分类的不同之处在于, 分类算法训练过程中样本所属的分类是已知的属监督学习. 而聚类算法不需要带有分类的训练数据,而是根据样本特征的相似性将其分为几类,又称为无监督分类. K均值 ...

  8. ML: 聚类算法-K均值聚类

    基于划分方法聚类算法R包: K-均值聚类(K-means)                   stats::kmeans().fpc::kmeansruns() K-中心点聚类(K-Medoids) ...

  9. 探索sklearn | K均值聚类

    1 K均值聚类 K均值聚类是一种非监督机器学习算法,只需要输入样本的特征 ,而无需标记. K均值聚类首先需要随机初始化K个聚类中心,然后遍历每一个样本,将样本归类到最近的一个聚类中,一个聚类中样本特征 ...

随机推荐

  1. SPRING官方网下载地址

    SPRING官方网站改版后,建议都是通过 Maven和Gradle下载,对不使用Maven和Gradle开发项目的,下载就非常麻烦,下给出Spring Framework jar官方直接下载路径: h ...

  2. iOS高仿app源码:纯代码打造高仿优质《内涵段子》

    iOS高仿app源码:纯代码打造高仿优质<内涵段子>收藏下来 字数1950 阅读4999 评论173 喜欢133 Github 地址 https://github.com/Charlesy ...

  3. python学习笔记五 模块下(基础篇)

    shevle 模块 扩展pickle模块... 1.潜在的陷进 >>> import shelve>>> s = shelve.open("nb" ...

  4. ubuntu安装StarDict星际译王

    http://sixipiaoyang.blog.163.com/blog/static/6232358820144146386437/ 1,安装StarDict星际译王. 这是linux系统中最常用 ...

  5. stm32中断服务函数

    你打开stm32的启动文件,例如startup_stm32f10x_hd.s 里面有很多中断跳转的入口.用白话说就是固件库帮你写好了发生什么中断时跳转到哪里,这些名字是一个函数名,你要把这些函数写出来 ...

  6. 查询mysql数据库中所有用户及用户权限

    SELECT DISTINCT CONCAT('User: ''',user,'''@''',host,''';') AS query FROM mysql.user;

  7. 一、Java语言基础

    1.标识符和关键字 标识符是java中必须使用的,具有一定的规则,用来标识类名.变量名.方法名.数组名.文件名等. 例:int i = 100;                    变量i就是标识符 ...

  8. linux内核中的GPIO系统之(2):pin control subsystem

    一.前言 在linux2.6内核上工作的嵌入式软件工程师在pin control上都会遇到这样的状况: (1)启动一个新的项目后,需要根据硬件平台的设定进行pin control相关的编码.例如:在b ...

  9. Lambda表达式之Python

    一.lambda函数 1.lambda函数基础: lambda函数也叫匿名函数,即,函数没有具体的名称,而用def创建的方法是有名称的.如下: """命名的foo函数&q ...

  10. [HDOJ5933]ArcSoft's Office Rearrangement(贪心)

    题目链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=5933 题意:长度为nn的数组: a_1, a_2, \cdotsa​1​​,a​2​​,⋯, 每次操作 ...