python panda读写内存溢出:MemoryError
pandas中read_xxx的块读取功能
pandas设计时应该是早就考虑到了这些可能存在的问题,所以在read功能中设计了块读取的功能,也就是不会一次性把所有的数据都放到内存中来,而是分块读到内存中,最后再将块合并到一起,形成一个完整的DataFrame。
- def read_sql_table(table_name, con, schema=None, index_col=None,
- coerce_float=True, parse_dates=None, columns=None,
- chunksize=None):
1.chunksize是在一个每一个chunk块中有多少行。
2.当chunksize是非None的时候read_xxx返回的是一个迭代器
比如我自己的写的一个全量同步数据的代码如下:
- gtr=pd.read_sql_table(sync_table, data_from_engine_dict[database],chunksize=20000)
- count=0
- for df in gtr:
- if count==0:
- df.to_sql(database+"_"+sync_table, data_to_engine, if_exists="replace", index=False)
- else:
- df.to_sql(database + "_" + sync_table, data_to_engine, if_exists="append", index=False)
- count+=1
发现数据库中的表会被修改,我今天做了如下升级:
其他的read_xxx也有类似的参数
- pandas.read_csv(filepath_or_buffer: Union[str, pathlib.Path, IO[~AnyStr]], sep=',', delimiter=None, header='infer', names=None, index_col=None,
- usecols=None, squeeze=False, prefix=None, mangle_dupe_cols=True, dtype=None, engine=None, converters=None, true_values=None, false_values=None,
- skipinitialspace=False, skiprows=None, skipfooter=0, nrows=None, na_values=None, keep_default_na=True, na_filter=True, verbose=False,
- skip_blank_lines=True, parse_dates=False, infer_datetime_format=False, keep_date_col=False, date_parser=None, dayfirst=False, cache_dates=True,
- iterator=False, chunksize=None, compression='infer', thousands=None, decimal=b'.', lineterminator=None, quotechar='"', quoting=0, doublequote=True,
- escapechar=None, comment=None, encoding=None, dialect=None, error_bad_lines=True, warn_bad_lines=True, delim_whitespace=False, low_memory=True,
- memory_map=False, float_precision=None)[source]
我们再介绍一个不用改的参数:
- low_memory : bool, default True
- Internally process the file in chunks, resulting in lower memory use while parsing, but possibly mixed type inference.
- To ensure no mixed types either set False, or specify the type with the dtype parameter.
- Note that the entire file is read into a single DataFrame regardless, use the chunksize or iterator parameter to return the data in chunks.
- (Only valid with C parser).
- low_memory 默认就是True,如果不小心改成了False,chunksize参数不生效。
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