启动子

 
启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性。
起始时间和表达的程度。启动子(Promoters)就像“开关”,决定基因的活动。既然基因是成序列的核苷酸(nucleotides),那么启动子也应由DNA组成。启动子本身并不控制基因活动,而是通过与称为转录(transcription)因子的这种蛋白质(proteins)结合而控制基因活动的。转录因子就像一面“旗子”,指挥着酶(enzymes)(RNA聚合酶polymerases) 的活动。这种酶制造着基因的RNA复制本。一般分为广谱表达型启动子、组织特异性启动子、肿瘤特异性启动子等多种形式。基因的启动子部分发生改变(突变),则导致基因表达的调节障碍。这种变化常见于恶性肿瘤
 
外显子

外显子所属现代词,指的是真核生物基因的一部分,它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。

剪接方式并不是唯一的(参看替代剪接),所以外显子只能在成体mRNA中被看出。即使是使用生物信息学方法,要精确预测外显子的位置也是非常困难的。在反式剪接中,不同mRNA的外显子可以被接合在一起。

外显子在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA外显子的DNA中的区域。简言之,外显子就是指真核细胞的基因在表达过程中能编码蛋白质的核苷酸序列。关键概念:比较不同物种的相关基因,发现相应的外显子序列通常是保守的,而内含子序列则很少保守。编码蛋白质的序列通常处于选择压力之下,内含子由于没有选择压力,因此比外显子的进化快得多。通过确定在多种生物中出现的片段来鉴定编码区域,而外显子的保守性可以作为这种鉴定的基础。

内含子

http://baike.baidu.com/link?url=UcztkZTIdaKx2OfkP_TFGET0phpDrM5qiQphXQCqj7CQy8poCmaqs5FBfBTEK7H6

内含子(introns)在转录后的加工中,从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列。术语内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域。内含子可能含有“旧码”,就是在进化过程中丧失功能的基因部分。正因为内含子对翻译产物的结构无意义,它比外显子累积有更多的突变。
内含子是阻断基因线性表达的序列。DNA上的内含子会被转录到前体RNA中,但RNA上的内含子会在RNA离开细胞核进行转译前被剪除。在成熟mRNA被保留下来的基因部分被称为外显子。内含子有时也叫内显子,与外显子相对。
内含子(intron)是真核生物细胞DNA中的间插序列。这些序列被转录在前体RNA中,经过剪接被去除,最终不存在于成熟RNA分子中。内含子和外显子的交替排列构成了割裂基因。在前体RNA中的内含子常被称作“间插序列”。在转录后的加工中,它比外显子有更多的突变。
大多数真核结构基因中的间插序列(interveningsequence)或不编码序列。它们可以转录,但在基因转录后,由这些间插序列转录的部分(也可用内含子这个术语表示)经加工被从初级转录本中准确除去,才产生有功能的RNA。基因的编码部分称外显子。内含子常比外显子长,且占基因的更大比例。真核基因所含内含子的数目、位置和长度不尽相同。
内含子(Interveningregion)是一个基因中非编码DNA片断,它分开相邻的外显子。更精确的定义是:内含子是阻断基因线性表达的序列。DNA上的内含子会被转录到前体RNA中,但RNA上的内含子会在RNA离开细胞核进行转译前被剪除。在成熟mRNA被保留下来的基因部分被称为外显子。真核生物的基因含有外显子和内含子,是前者区别原核生物的特征之一。
归根到底,是在剪接过程中同一段DNA,有时被看作外显子,有时则是内含子。内含子和外显子的比例因种而异。

启动子&外显子&内含子的更多相关文章

  1. 第三章 RNA测序

    第三章 RNA测序   RNA测序(RNA Sequencing,简称RNA-Seq,也被称为全转录物组鸟枪法测序Whole Transcriptome Shotgun Sequencing,简称WT ...

  2. PSI-BLAST|PHI-BLAST|UniProt|IGV|Galaxy|clustalx

    生物信息学软件: NCBI:BLAST,设定k-mer 默认是全局比对,Blastn是局部比对. PSI-BLAST最灵敏的BLAST,选中部分矩阵后在数据库中查找相应蛋白. PHI-BLAST找氨基 ...

  3. 在非小细胞肺癌中,MET基因的14号外显子突变和年龄,依赖于癌症阶段的CNV,C-MET过表达的关系

    背景:c-MET是肝细胞生长因子的酪氨酸激酶受体.MET 14号外显子编码部分c-MET的胞内跨膜结构域,包括重要的调节原件,比如酪氨酸1003,一个降解c-MET的相关酶的结合位点. 拥有MET 1 ...

  4. 外显子分析:cutadapt,去除序列adapter详细解析

    外显子测序时带有adapt接头,因此我们需要去除adapt接头,cutadapt的作用是去除adapt接头,一般用到如下命令: cutadapt -a AACCGGTT -o output.fastq ...

  5. 柳叶刀重磅出击!全外显子测序在胎儿结构异常的评估Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study

    柳叶刀发表的文献解读:Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective coh ...

  6. 外显子分析思路总结(Exome Sequencing Analysis review)

    趁着周末,大好的日子,总结了一下外显子分析的思路(套路)

  7. 计算基因上外显子碱基覆盖度(exon coverage depth):Samtool工具使用

    假设想要计算ATP1A4基因上的外显子碱基覆盖度 首先查询这个基因所有exon的起始和终止位置,查询链接:http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcri ...

  8. Methods for follow-up research of exome analysis:外显子后续分析研究思路总结

    外显子后续分析研究思路一般有以下几种(Methods for follow-up research of exome analysis): 1.对突变频率.突变类型.突变方式进行统计分析 Mutati ...

  9. Android多线程编程<一>Android中启动子线程的方法

          我们知道在Android中,要更新UI只能在UI主线程去更新,而不允许在子线程直接去操作UI,但是很多时候,很多耗时的工作都交给子线程去实现,当子线程执行完这些耗时的工作后,我们希望去修改 ...

随机推荐

  1. javascript中的正则匹配函数exec(),test(),match()

    test() var str = "cat";var reStr = /cat/;alert(reStr.test(str)); 输出为:true 它的返回值为true or fa ...

  2. Android之实战篇(三)

    先给出我们用到的工具类 1.发送请求的工具类 本实例采用HttpClient与服务器通信,用到了一个工具类对Httpclient进行封装:定义了两个方法来发送请求 getRequest:发送GET请求 ...

  3. Python 100例(下)

    如果你坚持到这了,哪就为自己鼓掌吧!坚持,你一定可以. 实例51: 题目:学习使用按位与&. #!/usr/bin/env  python# --*--coding:utf-8 --*--'' ...

  4. iOS中"查看更多/收起"功能实现

    实现效果如图: 查看更多功能在很多app种都有应用,在这里简单的实现,介绍实现流程: 一个tableViewCell中包含一个collectionView,"查看更多"按钮是tab ...

  5. Python正则表达式学习笔记

    [] 字符类,只要匹配里面的任意字符,都算匹配 . 元字符,可以匹配除换行符之外的所有字符 大小写敏感,但是可以关闭 \d  可以匹配0-9中的任意数字 {3}大括号里面的数字,边上前面一个字符匹配的 ...

  6. 为CKEditor开发插入代码的插件 已提供下载

    http://www.cnblogs.com/moozi/archive/2010/01/06/1640034.html

  7. Html标签中Alt和Title都是提示性语言标签

    在Html标签中Alt和Title都是提示性语言标签,在我们浏览一些网页时,鼠标停留在一张图片或文字链接上时,在鼠标的右下角出现一个提示信息框,对目标进行一定的注释说明,这就是它们的作用.    其中 ...

  8. Seajs是什么及其优缺点&如何使用?

    这篇文章主要介绍了Seajs的相关知识和和学习心得,适合刚接触SeaJS的同学,需要的朋友可以参考下,有更好的新手教程或文档,欢迎推荐.分享! 1.Seajs简介   Seajs,一个Web模块加载框 ...

  9. Android源码编译jar包BUILD_JAVA_LIBRARY 与BUILD_STATIC_JAVA_LIBRARY的区别(二)

    上文简单介绍了BUILD_JAVA_LIBRARY 与BUILD_STATIC_JAVA_LIBRARY编译出来jar包的区别, 那么你如果拿到了一个内容是dex格式的jar包,而你又偏偏需要这个ja ...

  10. iOS学习笔记(十三)——获取手机信息(UIDevice、NSBundle、NSLocale)

    iOS的APP的应用开发的过程中,有时为了bug跟踪或者获取用反馈的需要自动收集用户设备.系统信息.应用信息等等,这些信息方便开发者诊断问题,当然这些信息是用户的非隐私信息,是通过开发api可以获取到 ...