Fast Newman-FN算法以及模块度定义介绍
一、社区的定义
Newman第一次提出模块度定义就是在2004年发表的这篇文章“fast algorithm for community structure in networks”,第一次用量化的公式来确定社区划分。
首先,我们来看Newman如何定义社区的:the vertices in networks are often found to cluster into tightly knit groups with a high density of within-group edges and a lower density of between -group edges。
用大白话说就是:社区内部的边尽可能地多,但是社区之间的边尽可能地少
(一些定义):i、j指社区i和社区j;
n是网络中节点的数量;
m是网络中边的数量。一条边上连接两个节点,和明显,2m即网络中所有节点度之和
二、如何量化到模快度?
我们先用eij表示社区i和社区j之间连接的边的数量比整个网络边的数量,eii表示社区i内部边的数量比整个网络边的数量,既然这样的话我们只要使∑ieii尽可能大就好了,但是问题又来了,最大肯定就是1咯,所有节点归为一个社区,那这样很明显就没有意义了。
于是他有提出,网络中连接两个同种类型的边(即社区内部的边的比例eii)减去在相同结构下任意连接这两个节点边的比例的期望,于是模块度登场
Q=∑i(eii-ai2)
其中,ai=∑jeij 表示与社区i中节点相连的边占所有边的比例。如果社团内部边的比例不大于社团内部边随机连接的期望,那么Q=0,最大时为1。一般来说,Q值最大对应的社团结构就是网络中的社团结构
三、如何变成算法可操作性?
意思来了,我们只要优化Q就好了,但是如何把n个节点划分多少个社区?每个社区多少个节点?作者指出有2n-1种可能,这样的话根本无法将Q推广在高于20节点以上的网络?为了减少时间复杂度,作者提出一种贪婪策略
FN:(1)首先将网络中每个节点自定义成一个社区
(2)计算出两两社区结合是Q的值,找到Q增加最大的或者减少最少的合并方式进行社区合并
(3)直到所有社区合并成一个大社区时停止,找出合并过程中最大的Q是的社区划分结果
这个时候,Newman有注意到,当两个社区合并时,模块度的增量detaQ=(eji+eij-2ai*aj)=2(eij-2ai*aj)
四、代码来了
clear all
close all
clc % load preprocess.mat
% E=e;
load('dolphin.mat');
E=A;
% E(find(E>0))=1;%建立邻接矩阵
tic;
e=E;
e(e==1)=1/sum(E(:));
a=sum(e);
n=size(A,2);
b=[1:n];
b=num2cell(b);%用来存储社团元素的变量
c={};
k=1;
while length(e)>1
lg=length(e);
detaQ=-(10^9)*ones(n-k+1);%△Q
for i=1:lg-1
for j=i+1:lg
if e(i,j)~=0
detaQ(i,j)=2*(e(i,j)-a(i)*a(j));%计算△Q
end
end
end
if sum(detaQ+(10^9))==0
break
end
% Q(k)=max(detaQ(:));%寻找△Q的最大值,并把它存储进Q(k)矩阵
%-----------------------------寻找最大△Q对应的两个社团,并将其合并,并改变e矩阵
[I,J]=find(detaQ==max(detaQ(:))); for ii=1:length(I)
e(J(ii),:)=e(I(ii),:)+e(J(ii),:);
e(I(ii),:)=0;
e(:,J(ii))=e(:,I(ii))+e(:,J(ii));
e(:,I(ii))=0; % e(I,I)=e(I,I)/2;
%—————————记录△Q最大所对应的社团以及各社团中的元素 b{J(ii)}=[b{I(ii)} b{J(ii)}];
b{I(ii)}=0;
end e(I,:)=[];
e(:,I)=[];
b(I)=[];
c(k,:)=num2cell(zeros(1,n));
c(k,1:length(b))=b;
for kk=1:length(b)
c2=cell2mat(c(k,kk));
c2(c2==0)=[];
c{k,kk}=c2;
c2=[];
end
a=sum(e);
k=k+1;
tmp=0;
for jj=1:length(e)
tmp=tmp+(e(jj,jj)-a(jj)*a(jj));
end
Q(k)=tmp;
end
max_k=find(Q==max(Q(:)))-1; ll=0;
for i=1:length(c(max_k,:))
if sum(c{max_k,i})~=0
ll=ll+1;
c{max_k,i}=c{max_k,i}(c{max_k,i}~=0);
end
end
c_newman=c(max_k,1:ll);
label=zeros(n,1);
for i=1:ll
label(c{max_k,i}')=i;
end
Fast Newman-FN算法以及模块度定义介绍的更多相关文章
- 数据结构与算法 java描述 第一章 算法及其复杂度
目录 数据结构与算法 java描述 笔记 第一章 算法及其复杂度 算法的定义 算法性能的分析与评价 问题规模.运行时间及时间复杂度 渐进复杂度 大 O 记号 大Ω记号 Θ记号 空间复杂度 算法复杂度及 ...
- C#开发微信门户及应用(43)--微信各个项目模块的定义和相互关系
我们在开发微信相关的应用的时候,一般需要完善的基础模块支持,包括微信公众号,微信企业号,以及一些业务模块的支持,一般随着功能的增多,我们需要非常清晰的界定他们的关系.模块的分拆以及合并往往需要考虑的代 ...
- RequireJS 模块的定义与加载
模块不同于传统的脚本文件,它良好地定义了一个作用域来避免全局名称空间污染.它可以显式地列出其依赖关系,并以函数(定义此模块的那个函数)参数的形式将这些依赖进行注入,而无需引用全局变量.RequireJ ...
- 使用AndroidStudio编写APICloud模块需要注意的地方,解决模块未定义。
在新的版本下,使用AndroidStudio编写APICloud模块,已经非常简单了,解决模块未定义,最重要的就是要先看官方的视频! 注意在模块的module.json中name很重要,建议做到三统一 ...
- barnes-hut算法 && Fast Multipole Methods算法
barnes-hut算法 http://arborjs.org/docs/barnes-hut Fast Multipole Methods算法 http://www.umiacs.umd.edu/~ ...
- 重拾算法之复杂度分析(大O表示法)
.katex { display: block; text-align: center; white-space: nowrap; } .katex-display > .katex > ...
- Python_模块的定义与使用
1.模块的定义: 1.1 标准格式: import 模块名 模块名.函数名(实参列表) 1.2 特殊格式: from 模块名 import 函数名1,函数名2... 函数名(实参列表) 2.模块的使用 ...
- Python排序算法之选择排序定义与用法示例
Python排序算法之选择排序定义与用法示例 这篇文章主要介绍了Python排序算法之选择排序定义与用法,简单描述了选择排序的功能.原理,并结合实例形式分析了Python定义与使用选择排序的相关操作技 ...
- WEB开发性能优化--核心定义介绍篇(1)
推荐理由 随着 互联网的蓬勃发展,并且伴随着产品功能的越来越复杂,对于技术人员来说最大的挑战就是如何在保证业务快速发展的同时,也可保证不断复杂的业务对用户体验的影响,其中对用户来说最重要的体验指标是如 ...
随机推荐
- DevExpress VCL 已死-----关于13.1.4的发布。
随着DevExpress VCL 13.1.4 的发布,已基本上宣布了devexpress vcl 已经死亡了. 除了一些bug 修正,没有什么新的东西,每年的订阅费又那么贵,而且delphi 现在已 ...
- 2018.09.23 codeforces 1053A. In Search of an Easy Problem(gcd)
传送门 今天的签到题. 有一个很显然的结论,gcd(n∗m,k)≤2gcd(n*m,k)\le 2gcd(n∗m,k)≤2. 本蒟蒻是用的行列式求三角形面积证明的. 如果满足这个条件,就可以直接构造出 ...
- 2018.07.04 BZOJ 2618 Cqoi2006凸多边形(半平面交)
2618: [Cqoi2006]凸多边形 Time Limit: 5 Sec Memory Limit: 128 MB Description 逆时针给出n个凸多边形的顶点坐标,求它们交的面积.例如n ...
- 2018.07.06 BZOJ 1588: HNOI2002营业额统计(非旋treap)
1588: [HNOI2002]营业额统计 Time Limit: 5 Sec Memory Limit: 162 MB Description 营业额统计 Tiger最近被公司升任为营业部经理,他上 ...
- SQL之mysql常用操作语句(入门级)
1.进入数据库: mysql -u root -p mysql -h localhost -u root -p database_name 2.列出数据库 show databases; 3.选择数据 ...
- HDU 2037 今年暑假不AC (区间贪心)
题意:又是中文题... 析:先说一下区间贪心的一个定理,选择不相交的区间:数轴上有n个开区间(ai, bi).选择尽量多的区间,使得这些区间两两不相交,贪心策略是,一定是选bi小的.(想一下为什么). ...
- nginx 配置图片服务器 (window版本)
配置nginx二级域名 ①找到配置文件 例如:%nginx_home%/conf/nginx.conf ②配置 #user nobody; worker_processes 1; #error_log ...
- 理解load averages
今天在客户的生产环境中遇到了网络丢包的问题,但是查看我方部署smokeping监控发现对同一条线路监控,我方监控显示正常,判断丢包是由客户服务器负载过高导致,原因及排查思路如下: 使用uptime ...
- WPF 最简单的TextBox水印
最简单的TextBox加水印的方法,但是不具有很强的通用性. 如果你只是使用一次,或者用的不多,偷偷懒可以使用. 因为此方法只需要修改TextBox的Template,而不用重写何任代码. 注意: 1 ...
- abp + angular $http + webapi 服务
什么是angular $http服务 http是angularjs的一个核心服务,用于读取远程服务器的数据,也就是封装了浏览器原生的xhtmlrequest对象,可以直接同外部进行通信. 怎样使用an ...