大概作了一周,终于A了

类似于求最长公共子序列,稍有变形

当前序列 ch1 中字符为 a,序列 ch2 中字符为 b

则有 3 种配对方式:

1. a 与 b

2. a 与 -

3. - 与 b

动态转移方程:

dp[i][j] = max(dp[i - 1][j - 1] + g(ch1[i],ch2[j]) , dp[i - 1][j] + g(ch1[i],‘-') , dp[i][j-1] + g('-',ch2[j]))

代码如下:

#include<stdio.h>
#include<string.h>
#include<algorithm>
using namespace std;
int dp[][];
int g(char a,char b)
{
if( a == b ) return ;
if(a == 'A' && b == 'C' || b == 'A' && a == 'C') return -;
if(a == 'A' && b == 'G' || b == 'A' && a == 'G') return -;
if(a == 'A' && b == 'T' || b == 'A' && a == 'T') return -;
if(a == 'C' && b == 'G' || b == 'C' && a == 'G') return -;
if(a == 'C' && b == 'T' || b == 'C' && a == 'T') return -;
if(a == 'G' && b == 'T' || b == 'G' && a == 'T') return -;
if(a == 'A' && b == '-' || b == 'A' && a == '-') return -;
if(a == 'C' && b == '-' || b == 'C' && a == '-') return -;
if(a == 'G' && b == '-' || b == 'G' && a == '-') return -;
if(a == 'T' && b == '-' || b == 'T' && a == '-') return -;
}
int main()
{
char ch1[],ch2[];
int t,s1,s2;
scanf("%d",&t);
while(t--)
{
memset(dp,,sizeof(dp));
scanf("%d %s",&s1,ch1 + );
scanf("%d %s",&s2,ch2 + );
for(int i = ; i <= s1 ; i ++)
dp[i][] = dp[i - ][] + g('-',ch1[i]);
for(int i = ; i <= s2 ; i ++)
dp[][i] = dp[][i - ] + g(ch2[i],'-');
for(int i = ; i <= s1 ; i ++)
for(int j = ; j <=s2 ; j ++)
dp[i][j] = max(dp[i-][j-] + g(ch1[i],ch2[j]),
max(dp[i-][j] + g(ch1[i],'-'),dp[i][j - ] + g('-',ch2[j])));
printf("%d\n",dp[s1][s2]);
}
return ;
}

P 1080 Human Gene Functions的更多相关文章

  1. poj 1080 ——Human Gene Functions——————【最长公共子序列变型题】

    Human Gene Functions Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 10000K Total Submissions: 17805   Accepted:  ...

  2. poj 1080 Human Gene Functions(lcs,较难)

    Human Gene Functions Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 10000K Total Submissions: 19573   Accepted:  ...

  3. POJ 1080 Human Gene Functions -- 动态规划(最长公共子序列)

    题目地址:http://poj.org/problem?id=1080 Description It is well known that a human gene can be considered ...

  4. poj 1080 Human Gene Functions(dp)

    题目:http://poj.org/problem?id=1080 题意:比较两个基因序列,测定它们的相似度,将两个基因排成直线,如果需要的话插入空格,使基因的长度相等,然后根据那个表格计算出相似度. ...

  5. dp poj 1080 Human Gene Functions

    题目链接: http://poj.org/problem?id=1080 题目大意: 给两个由A.C.T.G四个字符组成的字符串,可以在两串中加入-,使得两串长度相等. 每两个字符匹配时都有个值,求怎 ...

  6. HDU 1080 Human Gene Functions

    最长公共子序列的变形 题目大意:给出两个基因序列,求这两个序列的最大相似度. 题目中的表格给出了两两脱氧核苷酸的相似度. 状态转移方程为: dp[i][j] = max(dp[i-1][j]+Simi ...

  7. POJ 1080 Human Gene Functions

    题意:给两个DNA序列,在这两个DNA序列中插入若干个'-',使两段序列长度相等,对应位置的两个符号的得分规则给出,求最高得分. 解法:dp.dp[i][j]表示第一个字符串s1的前i个字符和第二个字 ...

  8. 【HDOJ】1080 Human Gene Functions

    DP.wa了一下午,原来是把mmax写在外层循环了.最近事情太多了,刷题根本没状态. #include <cstdio> #include <cstring> #include ...

  9. POJ 1080 Human Gene Functions 【dp】

    题目大意:每次给出两个碱基序列(包含ATGC的两个字符串),其中每一个碱基与另一串中碱基如果配对或者与空串对应会有一个分数(可能为负),找出一种方式使得两个序列配对的分数最大 思路:字符串动态规划的经 ...

随机推荐

  1. 【BZOJ3123】森林(主席树,启发式合并)

    题意:一个带点权的森林,要求维护以下操作: 1.询问路径上的点权K大值 2.两点之间连边 n,m<=80000 思路:如果树的结构不发生变化只需要维护DFS序 现在因为树的结构发生变化,要将两棵 ...

  2. S_ISREG等几个常见的宏(转)

    来自百度文库:http://wenku.baidu.com/view/31777dc1d5bbfd0a795673b1.html stat函数讲解: 表头文件: #include <sys/st ...

  3. MVC中实现只有当用户登录成功的时候才等浏览内容,否则跳转到登录页面

    第一步,在登录的时候记录Session //提供Session接口方便后面判断用户登录 Session["UserInfo"] = uinfo;  //uInfo是用户登录Mode ...

  4. MessageDigest消息摘要

    <1>MessageDigest基础 MessageDigest 类为应用程序提供信息摘要算法的功能,如 MD5 或 SHA 算法. MessageDigest 对象开始被初始化.该对象通 ...

  5. AndroidStudio关联svn并上传代码到svn服务器上

    打开AndroidStudio,按Ctrl+Shif+S快捷键,进入Settings设置页面.如上图所示,找到Version Control->点击Subversion->右边框口中勾选U ...

  6. Reverse链表 非递归实现

    #include<iostream> struct node{ int payload; node* next; }; void bianli(node* head){ node* ite ...

  7. powerdesigner连接数据库 导出数据

    powerdesigner连接数据库 导出数据 生成PDM文件 傻瓜试教程   也可下载文档:http://download.csdn.net/detail/shutingwang/6378665  ...

  8. WCF use ProtoBuf

    ProtoBuf, 比起xml和json, 传输的数据里面没有自描述标签, 而且是基于二进制的, 所以有着超高的传输效率, 据牛人张善友的描述, 可以替代WCF的自带的编码方案, 效率有极大的提升. ...

  9. Codeforces 740A. Alyona and copybooks 模拟

    A. Alyona and copybooks time limit per test: 1 second memory limit per test: 256 megabytes input: st ...

  10. MySQL之运算符与函数、自定义函数

    一自定义函数简介 (1)自定义函数定义 用户自定义函数(user-defined function,UDF)是一种对MySQL数据库扩展的途径,其用法与内置函数相同. (2)自定义函数的两个必要条件 ...