P 1080 Human Gene Functions
大概作了一周,终于A了
类似于求最长公共子序列,稍有变形
当前序列 ch1 中字符为 a,序列 ch2 中字符为 b
则有 3 种配对方式:
1. a 与 b
2. a 与 -
3. - 与 b
动态转移方程:
dp[i][j] = max(dp[i - 1][j - 1] + g(ch1[i],ch2[j]) , dp[i - 1][j] + g(ch1[i],‘-') , dp[i][j-1] + g('-',ch2[j]))
代码如下:
#include<stdio.h>
#include<string.h>
#include<algorithm>
using namespace std;
int dp[][];
int g(char a,char b)
{
if( a == b ) return ;
if(a == 'A' && b == 'C' || b == 'A' && a == 'C') return -;
if(a == 'A' && b == 'G' || b == 'A' && a == 'G') return -;
if(a == 'A' && b == 'T' || b == 'A' && a == 'T') return -;
if(a == 'C' && b == 'G' || b == 'C' && a == 'G') return -;
if(a == 'C' && b == 'T' || b == 'C' && a == 'T') return -;
if(a == 'G' && b == 'T' || b == 'G' && a == 'T') return -;
if(a == 'A' && b == '-' || b == 'A' && a == '-') return -;
if(a == 'C' && b == '-' || b == 'C' && a == '-') return -;
if(a == 'G' && b == '-' || b == 'G' && a == '-') return -;
if(a == 'T' && b == '-' || b == 'T' && a == '-') return -;
}
int main()
{
char ch1[],ch2[];
int t,s1,s2;
scanf("%d",&t);
while(t--)
{
memset(dp,,sizeof(dp));
scanf("%d %s",&s1,ch1 + );
scanf("%d %s",&s2,ch2 + );
for(int i = ; i <= s1 ; i ++)
dp[i][] = dp[i - ][] + g('-',ch1[i]);
for(int i = ; i <= s2 ; i ++)
dp[][i] = dp[][i - ] + g(ch2[i],'-');
for(int i = ; i <= s1 ; i ++)
for(int j = ; j <=s2 ; j ++)
dp[i][j] = max(dp[i-][j-] + g(ch1[i],ch2[j]),
max(dp[i-][j] + g(ch1[i],'-'),dp[i][j - ] + g('-',ch2[j])));
printf("%d\n",dp[s1][s2]);
}
return ;
}
P 1080 Human Gene Functions的更多相关文章
- poj 1080 ——Human Gene Functions——————【最长公共子序列变型题】
Human Gene Functions Time Limit: 1000MS Memory Limit: 10000K Total Submissions: 17805 Accepted: ...
- poj 1080 Human Gene Functions(lcs,较难)
Human Gene Functions Time Limit: 1000MS Memory Limit: 10000K Total Submissions: 19573 Accepted: ...
- POJ 1080 Human Gene Functions -- 动态规划(最长公共子序列)
题目地址:http://poj.org/problem?id=1080 Description It is well known that a human gene can be considered ...
- poj 1080 Human Gene Functions(dp)
题目:http://poj.org/problem?id=1080 题意:比较两个基因序列,测定它们的相似度,将两个基因排成直线,如果需要的话插入空格,使基因的长度相等,然后根据那个表格计算出相似度. ...
- dp poj 1080 Human Gene Functions
题目链接: http://poj.org/problem?id=1080 题目大意: 给两个由A.C.T.G四个字符组成的字符串,可以在两串中加入-,使得两串长度相等. 每两个字符匹配时都有个值,求怎 ...
- HDU 1080 Human Gene Functions
最长公共子序列的变形 题目大意:给出两个基因序列,求这两个序列的最大相似度. 题目中的表格给出了两两脱氧核苷酸的相似度. 状态转移方程为: dp[i][j] = max(dp[i-1][j]+Simi ...
- POJ 1080 Human Gene Functions
题意:给两个DNA序列,在这两个DNA序列中插入若干个'-',使两段序列长度相等,对应位置的两个符号的得分规则给出,求最高得分. 解法:dp.dp[i][j]表示第一个字符串s1的前i个字符和第二个字 ...
- 【HDOJ】1080 Human Gene Functions
DP.wa了一下午,原来是把mmax写在外层循环了.最近事情太多了,刷题根本没状态. #include <cstdio> #include <cstring> #include ...
- POJ 1080 Human Gene Functions 【dp】
题目大意:每次给出两个碱基序列(包含ATGC的两个字符串),其中每一个碱基与另一串中碱基如果配对或者与空串对应会有一个分数(可能为负),找出一种方式使得两个序列配对的分数最大 思路:字符串动态规划的经 ...
随机推荐
- 串口控RGB三色灯
本文由博主原创,如有不对之处请指明,转载请说明出处. /********************************* 代码功能:串口控RGB三色灯 使用函数: Serial.flush(); / ...
- (转载)python2+selenium自动化测试系列(一)
1.Selenium2+python自动化1-环境搭建 2.Selenium2+python自动化2-pip降级selenium3.0 3.Selenium2+python自动化3-解决pip使用异常 ...
- Python3实现最小堆建堆算法
今天看Python CookBook中关于“求list中最大(最小)的N个元素”的内容,介绍了直接使用python的heapq模块的nlargest和nsmallest函数的解决方式,记得学习数据结构 ...
- MongoDB学习:(二)MongoDB简单使用
MongoDB学习:(二)MongoDB简单使用 MongoDB使用: 执行mongodb的操作之前,我们需要运行命令,来进入操作命令界面 >mongo 提示该错误,说明我们系统缺少一个补丁,该 ...
- 无法在Web服务器上启动调试,已附加了一个调试器
运行环境:开发环境:Windows7旗舰版64bit.VisualStudio2008 With SP1.ArcEngine10.0.NetFrameWork4.0.IIS7和C#开发语言. 问题描述 ...
- Kinect2在线重建(Tracking and Mapping)
前言 个人理解错误的地方还请不吝赐教,转载请标明出处,内容如有改动更新,请看原博:http://www.cnblogs.com/hitcm/ 如有任何问题,feel free to ...
- 第九章 springboot + mybatis + 多数据源 (AOP实现)(转载)
本编博客转发自:http://www.cnblogs.com/java-zhao/p/5415896.html 1.ShopDao package com.xxx.firstboot.dao; imp ...
- Java常用的7大排序算法汇总
1.插入排序算法 插入排序的基本思想是在遍历数组的过程中,假设在序号 i 之前的元素即 [0..i-1] 都已经排好序,本趟需要找到 i 对应的元素 x 的正确位置 k ,并且在寻找这个位置 k 的过 ...
- postgresql数据迁移
postgresql从库故障准备新库 1,创建用户[root@localhost home]# userdel postgres[root@localhost home]# groupdel post ...
- C#类和接口、虚方法和抽象方法及值类型和引用类型的区别
1.C#类和接口的区别接口是负责功能的定义,项目中通过接口来规范类,操作类以及抽象类的概念!而类是负责功能的具体实现!在类中也有抽象类的定义,抽象类与接口的区别在于:抽象类是一个不完全的类,类里面有抽 ...