翻译:BioIT 爱好者(部分内容有调整)
原文:The top 10 R errors, the 7th one will surprise you

就像你学习走路时遇到了一些问题,你在学习 R 的过程中可能也会遇到一些错误。本文章的目标是对学习 R 时最常见的一些错误进行整理,并一一的去解释它们,以便您了解如何解决这些问题。


面对问题,最重要的建议是:“阅读错误信息”。有些错误信息通常不是很清楚,R 并不是真的很擅长表达它们,但是答案通常就在您的面前。一旦您敢于阅读错误信息,我们将帮助您阅读这些错误信息!

1. could not find function "%>%"

这是一个经典错误,可能发生在%>%或任何其他函数中。

有两种情况会导致出现这样的错误:

CASE 1 :
您拼写错了该函数的名称:

> rnom(1)  # instead rnorm(1)
Error: could not find function "rnom"

Correction :
该如何解决?通过纠正拼写错误。

> rnorm(1)
[1] -0.7503872

CASE 2 :
或者(在大多数情况下)您忘记了加载包含该函数的软件包。

> iris  %>% select(Species)
Error in iris %>% select(Species) : could not find function "%>%"

Correction :

不要忘记在你的脚本和 Rmd 开头安装并启动library(tidyverse)和其他的library(whatever)

library(dplyr)
iris  %>% select(Species)

2. Error: unexpected SPECIAL in "%>%"

错误代码:

library(dplyr)
iris  
%>% select(Species)
## Error: unexpected SPECIAL in %>%
## 2: iris  
## 3: %>%
##    ^

您将换行符放错了位置。

Correction :
%>%绝对不能在代码行的开头,您需要在%>%之后而不是之前进行换行。

library(dplyr)
iris  %>% 
  select(Species)

3. Error: unexpected 'else' in "else"

错误代码:

if (  1 != 1 ) {print("youpi")} 
else { print("coucou")}
## Error: unexpected 'else' in "else"
## 1: if (  1 != 1 ) {print("youpi")} 
## 2: else
##    ^

这与第二个错误的问题是一样的。您将换行符放错了位置。

Correction :
你需要检查else是否与前一行正确关联。

R 一次解释一行代码,所以当if没有关联的else代码时,要让你的代码起作用,请确保 R 知道您的指令已完成。

if (  1 != 1 ) {print("youpi")
  } else { print("coucou")}

4. object 'dataset' not found

错误代码:

library(dplyr)
dataset %>% select(Species)
## Error in eval(lhs, parent, parent) : object 'dataset' not found

您正在处理的对象不存在。

Correction :

拼写错误?或你需要确保你在这之前已经启动并分配了该对象。

5. there is no package called 'diplyr'

错误代码:

> library(diplyr)
Error in library(diplyr) : there is no package called ‘diplyr’

出现这样的错误有两种可能:

CASE 1 :
您拼错了库的名字。

Correction :

library(dplyr)

CASE 2 :
该软件包尚未安装。

Correction :
在终端中启动install.packages("dplyr")将解决此问题。

6. non-numeric argument to binary operator

错误代码:

> df + 1
## Error in df + 1 : non-numeric argument to binary operato

这样的报错可能会让人很困惑。

Correction :
确保您的算术运算有意义,并且应用在了正确的对象上。确保该对象包含您期望包含的对象。

在上面的示例中,df是一个函数,而不是数字,从而导致错误。

7. Problem with `filter()` input `..1`.

错误代码:

library(dplyr)
iris %>% filter(Species = "setosa")
## Error: Problem with `filter()` input `..1`.
## x Input `..1` is named.
## i This usually means that you've used `=` instead of `==`.
## i Did you mean `Species == "setosa"`?

在错误消息中包含解决方案。

Correction :
在错误消息中已经给出了如何校正的方法。您只输入了一个=,但条件必须用==编写。

library(dplyr)
iris %>% filter(Species == "setosa")

8. Error: unexpected symbol in:

错误代码:

library(dplyr)
iris %>% filter(Species == "setosa"
iris %>% filter(Species == "setosa")
## Error: <text>:3:1: unexpected symbol
## 2: iris %>% filter(Species == "setosa"
## 3: iris
##    ^

当您发送未完成的行,而您忘记了右括号,大括号或引号时,通常会出现此错误消息。在这种情况下,R 一直等到您的指令结束。但是,您不仅要发送丢失的括号(或括号/引号),而且要再次发送整个指令。Rmd 更加棘手,因为您没办法通过查看终端来检查确实已经发送给 R 的内容。

Correction :
已经修复了!现在,您已收到 R 发送的一条错误消息,重新启动您的指令,即可成功执行。

9. Operation not allowed without an active reactive context. (You tried to do something that can only be done from inside a reactive expression or observer.)

见下文。

10. Can't access reactive value 'go' outside of reactive consumer. Do you need to wrap inside reactive() or observer()?

错误代码:

library(shiny)
ui <- fluidPage(
  actionButton("go","go")
)
server <- function(input, output, session) {
  res <- input$go
}
shinyApp(ui, server)

您使用 Shiny 并尝试在observe()observEvent()reactive()render()之外使用input$。只是这有点不可能。别担心,在您犯错之前,确实也已经有人遇到过同类的错误!

Correction :
您可以在代码周围放置一个observe()

但是,求求您!不应在您的 shiny 应用程序中同时使用observe()reactive()(有时间的话我们将讨论这个问题..),因此,请尝试寻找更好的解决方案……:)

library(shiny)
ui <- fluidPage(
  actionButton("go","go")
)
server <- function(input, output, session) {
  r <- reactiveValues(x=NULL)
  observeEvent( TRUE ,once = TRUE, {
    r$x <- input$go
  })
}
shinyApp(ui, server)

最后

如果你还有其他烦人的经常性错误要分享,请在评论中写下它,一起分享交流!

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