CNN每层卷积结果视觉展示(3Dircadb肝脏数据为例)
试着展示了肝脏每层卷积之后的结果。代码如下:
import torch
import torch.nn as nn
import SimpleITK as sitk
import numpy as np def change_indenty(ct):
ct[ct < 40] = 40
ct[ct > 400] = 400
return ct class Dialte(nn.Module):
def __init__(self, num):
super(Dialte, self).__init__()
self.num= num
self.act = nn.ReLU(inplace=False)
self.norm = nn.BatchNorm3d
self.conv1 = nn.Sequential(
nn.Conv3d(1,1, kernel_size=3, stride=1, padding=1),
self.act,
self.norm(1)
) def forward(self, x):
for i in range(self.num):
x = self.conv1(x)
return x if __name__ == "__main__":
path = r"D:\myProject\HDC_vessel_seg\datasets\nii\image_2.nii"
image = sitk.ReadImage(path)
img_num = sitk.GetArrayFromImage(image)
img_num = change_indenty(img_num)
img_num = np.expand_dims(np.expand_dims(img_num, axis=0), axis=0).astype(np.float32)
img_num = torch.from_numpy(img_num)
print(img_num.shape) # image = torch.randn(1*3*8*8*8).reshape(1,3,8,8,8)
model = Dialte(num=5)
x = model(img_num)
# x = img_num # 展示原始图像
x = x[0,0,...]
x = x.cpu().data.numpy()
print("x",x.shape)
predict_seg = sitk.GetImageFromArray(x)
predict_seg.SetSpacing(image.GetSpacing())
predict_seg.SetOrigin(image.GetOrigin())
predict_seg.SetDirection(image.GetDirection())
# sitk.WriteImage(predict_seg, path.replace("vessel", "dialte"))
sitk.WriteImage(predict_seg, path.replace("image", "pre_image"))
结果:
原始
第一层:
第二层:
第三层:
第四层:
第五层:
CNN每层卷积结果视觉展示(3Dircadb肝脏数据为例)的更多相关文章
- CNN中各类卷积总结:残差、shuffle、空洞卷积、变形卷积核、可分离卷积等
CNN从2012年的AlexNet发展至今,科学家们发明出各种各样的CNN模型,一个比一个深,一个比一个准确,一个比一个轻量.我下面会对近几年一些具有变革性的工作进行简单盘点,从这些充满革新性的工作中 ...
- 利用TensorFlow识别手写的数字---基于两层卷积网络
1 为什么使用卷积神经网络 Softmax回归是一个比较简单的模型,预测的准确率在91%左右,而使用卷积神经网络将预测的准确率提高到99%. 2 卷积网络的流程 3 代码展示 # -*- coding ...
- (原)CNN中的卷积、1x1卷积及在pytorch中的验证
转载请注明处处: http://www.cnblogs.com/darkknightzh/p/9017854.html 参考网址: https://pytorch.org/docs/stable/nn ...
- layui在open弹出层回显,解决动态select数据回显问题
//监听数据表格工具条 table.on('tool(contentList)', function(obj){ //注:tool是工具条事件名,test是table原始容器的属性 l ...
- 利用 Flask 动态展示 Pyecharts 图表数据的几种方法
本文将介绍如何在 web 框架 Flask 中使用可视化工具 pyecharts, 看完本教程你将掌握几种动态展示可视化数据的方法,不会的话你来找我呀- Flask 模板渲染 1. 新建一个项目fla ...
- K3cloud、erp系统实时滚动展示未处理数据,监控投诉处理进度
痛点:企业内部erp人工记录产品投诉销售单,是否跟踪处理完客户投诉,结果不能实时透明,当天还有多少未解决的投诉单,也不能实时查看到,除非手工去系统单据查询,很不方便,跟踪也不顺畅! 解决方案:利 ...
- django学习-27.admin管理后台里:对列表展示页面的数据展示进行相关优化
目录结构 1.前言 2.完整的操作步骤 2.1.第一步:查看ModelAdmin类和BaseModelAdmin类的源码 2.2.第二步:查看表animal对应的列表展示页面默认的数据展示 2.3.第 ...
- 基于Vue开发的门户网站展示和后台数据管理系统
基于Vue的前端框架有很多,这几年随着前端技术的官方应用,总有是学不完的前端知识在等着我们,一个人的精力也是有限,不可能一一掌握,不过我们学习很大程度都会靠兴趣驱动,或者目标导向,最终是可以以点破面, ...
- [转]CNN 中千奇百怪的卷积方式大汇总
https://www.leiphone.com/news/201709/AzBc9Sg44fs57hyY.html 推荐另一篇很好的总结:变形卷积核.可分离卷积?卷积神经网络中十大拍案叫绝的操作. ...
- [DeeplearningAI笔记]卷积神经网络1.9-1.11池化层/卷积神经网络示例/优点
4.1卷积神经网络 觉得有用的话,欢迎一起讨论相互学习~Follow Me 1.9池化层 优点 池化层可以缩减模型的大小,提高计算速度,同时提高所提取特征的鲁棒性. 池化层操作 池化操作与卷积操作类似 ...
随机推荐
- 【微信小程序】05 设备信息 & 请求API
获取系统信息(设备信息) https://developers.weixin.qq.com/miniprogram/dev/api/base/system/wx.getSystemInfo.html ...
- 【Hibernate】Re02 官网介绍
介绍: 创始人:Gavin King.EJB3.0专家,JBoss核心成员之一,<Hibernate In Action>作者 Hibernate是ORM的解决方案. 优点: 1.功能强大 ...
- Implementation of Reinforcement Learning with Meta-Critic Networks and GAE in a Human-Centered Framework
论文<Future of AI and Empowering Reinforcement Learning with Meta-Critic Networks and GAE in a Huma ...
- 【转载】How to Use t-SNE Effectively —— (机器学习数据可视化) t-SNE使用指南
原文地址:https://distill.pub/2016/misread-tsne/ 说明: 原文是比较有名的一个指南性博文,讲的就是t-SNE技术的一些使用注意事项和说明,属于说明性文章,内容很不 ...
- 开源的 P2P 跨平台传文件应用「GitHub 热点速览」
就在上周,发完那篇文章之后不久,我就有幸获得了 GitHub Models 服务公测的访问权限,所以就体验了一下 Playground 聊天功能. 起初,我以为这是"微软菩萨"降临 ...
- FFmpeg开发笔记(四十八)从0开始搭建直播系统的开源软件架构
音视频技术的一个主要用途是直播,包括电视直播.电脑直播.手机直播等等,甚至在线课堂.在线问诊.安防监控等应用都属于直播系统的范畴.由于直播系统不仅涉及到音视频数据的编解码,还涉及到音视频数据的实时传 ...
- C#ListView类的继承
ListView控件类新加方法 新建一个类myListView class myListView : System.Windows.Forms.ListView { //添加自定义的方法 -- //设 ...
- mariadb5.5.56二进制离线安装
在生产环境中一般使用发布好的二进制版本,简单概括一下安装过程: 1. 下载 地址为:https://downloads.mariadb.org/mariadb/5.5.56/ 这里选择最新版本的5.5 ...
- ubuntu16.04/CentOS 7自动以root身份登录桌面
ubuntu16.04 1.首先设置root用户密码: # sudo passwd root 输入普通用户密码,再输入root用户密码: 2.启用登录时的root选项: # 编辑50-ubuntu.c ...
- 推荐7款美观且功能强大的WPF UI库
前言 经常看到有小伙伴在DotNetGuide技术社区交流群里提问:WPF有什么好用或者好看的UI组件库推荐的?,今天大姚给大家分享7款开源.美观.功能强大.简单易用的WPF UI组件库. WPF介绍 ...