【Biocode】产生三行的seq+01序列
代码说明:
sequence.txt与site.txt整合 如下图:
sequence.txt:
site.txt:
整理之后如下:
蛋白质序列中发生翻译后修饰的位置标记为“1”,其他的位置标记为“0”
代码如下:
#include<stdio.h>
#include<stdlib.h>
#include<iostream>
#include<string.h>
#include<algorithm>
#include<time.h>
#include<math.h>
using namespace std;
char str[];
char s[];
int map[];
int main()
{
//序列与位点结合 输出 一行序列 一行0 1 样本
int i,j,k,l,m,n;
//序列文件
FILE *p=fopen("sequence.txt","r");
//位置文件
FILE *p1=fopen("site_after.txt","r");
//输出文件
freopen("3lines_sequence.txt","w",stdout);
while(fgets(str,,p))
{
printf("%s",str);
fgets(str,,p);
l=strlen(str);
printf("%s",str);
fgets(s,,p1);
char *pp=strtok(s," ");
i=;
memset(map,,sizeof(map));
while(pp!=NULL)
{
k=atoi(pp);
// printf("**%d\n",k);
map[k-]=;
pp=strtok(NULL," ");
}
for(i=;i<l-;i++)
{
if(map[i]==)
printf("");
else
printf("");
}
printf("\n");
}
return();
}
注:
①在初始化字符数组的时候,空间要大于所读取文件最长的长度,否则会出现篡位的问题。
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