Talairach空间、MNI空间、Native空间、Stereotaxic空间

  Native空间就是原始空间。

图像没有做任何变换时就是在原始空间。在这个空间中图像的维度、原点、voxel size等都是不同的,不同被试的图像之间不具有可比性,计算出来的任何特征都不能进行统计分析,或是用于机器学习。所以必须对所有被试的图像进行配准标准化到同一个模板上,这样所有被试的维度、原点、voxel size就一样了。

使用MNI标准模板,就表示把图像转换至MNI空间了。一般而言MNI模板是最常用的,研究的比较多。标准空间的图像也是指MNI空间的图像。

Talairach空间和MNI空间的坐标有对应的关系,很多软件都提供这个功能,如Mricron、REST等。

Talairach空间只要是为了判别当前坐标在什么结构上,注意Talairach atlas and Talairach coordinates 就是Stereotaxic space.

------------------------------------------------------------------------------

MNI坐标和Talairach坐标进行转换

MNI2tal

Alternatively, you can download the appropriate Matlab file:

另有一个程序可以考虑:
Talairach Client - Version 2.4.2使用Matlab读取MASK、ROI坐标的时候,图像的起始原点是以1开始。
譬如Talairach atlas 维度是141,172,110:
MRIcroN读图的时候有两个坐标,左下角的是Native Space坐标,左上角的是图像坐标,
左上角 = 左下角+[71,103,43]

偏移值与图像的维度密切相关。
http://brainmap.org/icbm2tal/
http://www.talairach.org/

Talairach空间、MNI空间、Native空间、Stereotaxic空间的更多相关文章

  1. OpenGL 的空间变换(下):空间变换

    通过本文的上篇 OpenGL 的空间变换(上):矩阵在空间几何中的应用 ,我们了解到矩阵的基础概念.并且掌握了矩阵在空间几何中的应用.接下来,我们将结合矩阵来了解 OpenGL 的空间变换. 在使用 ...

  2. 有一台机器,上面有m个储存空间。然后有n个请求,第i个请求计算时需要占 R[i]个空间,储存计算结果则需要占据O[i]个空间(据O[i]个空间(其中O[i]<R[i])。问怎么安排这n个请求的顺序,使

    有一台机器,上面有m个储存空间.然后有n个请求,第i个请求计算时需要占 R[i]个空间,储存计算结果则需要占据O[i]个空间(据O[i]个空间(其中O[i]<R[i]).问怎么安排这n个请求的顺 ...

  3. [原][数学][C++][osg]空间向量OA到转到空间向量OB、以及四元素Q1转到Q2的函数

    注意:Oa其实在OK的延长线上,上图只是为了好看才把Oa和OK分开了 算法需求如图所示: 已知空间向量OA和空间向量OB 我想算出OA向OB按某角度或者某时间移动 变成空间向量Oa的算法 先说废话:我 ...

  4. unity, 相机空间 与 相机gameObject的局部空间

    在unity里 相机空间 与 相机gameObject的局部空间 不重合. Camera.worldToCameraMatrix的文档中有这样一句话: Note that camera space m ...

  5. Oracle 删除用户和表空间////Oracle创建删除用户、角色、表空间、导入导出、...命令总结/////Oracle数据库创建表空间及为用户指定表空间

    Oracle 使用时间长了, 新增了许多user 和tablespace. 需要清理一下 对于单个user和tablespace 来说, 可以使用如下命令来完成. 步骤一:  删除user drop ...

  6. webgl 的空间变换(下):空间变换

    在网上看了很多关于在三维世界中怎么把一个顶点经过一步步变化,最终呈现在我们的屏幕上的. 其实很多博客或者书籍已经讲的很清楚了,那为什么我还要特别再写一次博客来阐述自己观点呢?(这里只针对那些学习web ...

  7. 0xC0000005;Access Violation(栈区空间很宝贵, linux上栈区空间默认为8M,vc6下默认栈空间大小为1M)

    写C/C++程序最怕出现这样的提示了,还好是在调试环境下显示出来的,在非调试状态就直接崩溃退出. 从上述汇编代码发现在取内存地址 eax+38h 的值时出错, 那说明这个地址非法呗, 不能访问, 一般 ...

  8. 【oracle11g,13】表空间管理2:undo表空间管理(调优) ,闪回原理

    一.undo空间原理: dml操作会产生undo数据. update时,sever process 会在databuffer 中找到该记录的buffer块,没有就从datafile中找并读入data ...

  9. ORACLE表空间offline谈起,表空间备份恢复

    从ORACLE表空间offline谈起,表空间备份恢复将表空间置为offline,可能的原因包括维护.备份恢复等目的:表空间处于offline状态,那么Oracle不会允许任何对该表空间中对象的SQL ...

随机推荐

  1. day3 作业

    文件操作用户很广泛,我们经常对文件进行操作: global log 127.0.0.1 local2 daemon maxconn log 127.0.0.1 local2 info defaults ...

  2. day4装饰器

    Python装饰器 1.必备 def foo(): print(foo) <function foo at 0x7f62db093f28> >>> foo <fun ...

  3. 实现优先级队列 --heapq模块

    以给定的优先级对元素进行排序,每次pop删除优先级最高的 # coding=utf-8 # example.py # # Example of a priority queue import heap ...

  4. vscode vue配置和一些其它辅助【工具篇】

    后续有补充就经常更新

  5. jquery的一个模板引擎-zt

    jQuery-jTemplate.js下载:http://jtemplates.tpython.com/ 一 , 简单介绍 它是一个基于jQuery开发的javascript模板引擎.它主要的作用如下 ...

  6. 关于node的path模块

    const path=require('path'); //basename('绝对路径','截取的后缀') 返回文件的扩展名 let a=path.basename('C:\\temp\\myfil ...

  7. 在Linux中设置UMASK值

    umask值用于设置用户在创建文件时的默认权限,当我们在系统中创建目录或文件时,目录或文件所具有的默认权限就是由umask值决定的. 对于root用户,系统默认的umask值是0022:对于普通用户, ...

  8. Ngnix的日志管理和用定时任务完成日志切割

    一.日志管理 先来看看ngnix的配置文件的server段 接下来我们解释一下默认格式的具体意思 #log_format main '$remote_addr(远程IP) - $remote_user ...

  9. 【记录】mybatis-generator如何使用(maven方式)

    1.首先在pom.xml中添加插件 <plugin> <groupId>org.mybatis.generator</groupId> <artifactId ...

  10. 【Python初级】StringIO和BytesIO读写操作的小思考

    from io import StringIO; f = StringIO(); f.write('Hello World'); s = f.readline(); print s; 上面这种方法“无 ...