SparkCore2
二、RDD编程
2.5 RDD中的函数传递
在实际开发中我们往往需要自己定义一些对于RDD的操作,那么此时需要主要的是,初始化工作是在Driver端进行的,而实际运行程序是在Executor端进行的,这就涉及到了跨进程通信,是需要序列化的。下面我们看几个例子:
2.5.1 传递一个方法
1.创建一个类
class Search(s:String){
//过滤出包含字符串的数据
def isMatch(s: String): Boolean = {
s.contains(query)
}
//过滤出包含字符串的RDD
def getMatch1 (rdd: RDD[String]): RDD[String] = {
rdd.filter(isMatch)
}
//过滤出包含字符串的RDD
def getMatche2(rdd: RDD[String]): RDD[String] = {
rdd.filter(x => x.contains(query))
}
}
2.创建Spark主程序
object SeriTest {
def main(args: Array[String]): Unit = {
//1.初始化配置信息及SparkContext
val sparkConf: SparkConf = new SparkConf().setAppName("WordCount").setMaster("local[*]")
val sc = new SparkContext(sparkConf)
//2.创建一个RDD
val rdd: RDD[String] = sc.parallelize(Array("hadoop", "spark", "hive", "atguigu"))
//3.创建一个Search对象
val search = new Search()
//4.运用第一个过滤函数并打印结果
val match1: RDD[String] = search.getMatche1(rdd)
match1.collect().foreach(println)
}
}
3.运行程序
Exception in thread "main" org.apache.spark.SparkException: Task not serializable
at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.ensureSerializable(ClosureCleaner.scala:298)
at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.org$apache$spark$util$ClosureCleaner$$clean(ClosureCleaner.scala:288)
at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.clean(ClosureCleaner.scala:108)
at org.apache.spark.SparkContext.clean(SparkContext.scala:2101)
at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$filter$1.apply(RDD.scala:387)
at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$filter$1.apply(RDD.scala:386)
at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:151)
at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:112)
at org.apache.spark.rdd.RDD.withScope(RDD.scala:362)
at org.apache.spark.rdd.RDD.filter(RDD.scala:386)
at com.atguigu.Search.getMatche1(SeriTest.scala:39)
at com.atguigu.SeriTest$.main(SeriTest.scala:18)
at com.atguigu.SeriTest.main(SeriTest.scala)
Caused by: java.io.NotSerializableException: com.atguigu.Search
4.问题说明
//过滤出包含字符串的RDD
def getMatch1 (rdd: RDD[String]): RDD[String] = {
rdd.filter(isMatch)
}
在这个方法中所调用的方法isMatch()是定义在Search这个类中的,实际上调用的是this. isMatch(),this表示Search这个类的对象,程序在运行过程中需要将Search对象序列化以后传递到Executor端。
5.解决方案
使类继承scala.Serializable即可。
class Search() extends Serializable{...}
2.5.2 传递一个属性
1.创建Spark主程序
object TransmitTest {
def main(args: Array[String]): Unit = {
//1.初始化配置信息及SparkContext
val sparkConf: SparkConf = new SparkConf().setAppName("WordCount").setMaster("local[*]")
val sc = new SparkContext(sparkConf)
//2.创建一个RDD
val rdd: RDD[String] = sc.parallelize(Array("hadoop", "spark", "hive", "atguigu"))
//3.创建一个Search对象
val search = new Search()
//4.运用第一个过滤函数并打印结果
val match1: RDD[String] = search.getMatche2(rdd)
match1.collect().foreach(println)
}
}
2.运行程序
Exception in thread "main" org.apache.spark.SparkException: Task not serializable
at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.ensureSerializable(ClosureCleaner.scala:298)
at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.org$apache$spark$util$ClosureCleaner$$clean(ClosureCleaner.scala:288)
at org.apache.spark.util.ClosureCleaner$.clean(ClosureCleaner.scala:108)
at org.apache.spark.SparkContext.clean(SparkContext.scala:2101)
at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$filter$1.apply(RDD.scala:387)
at org.apache.spark.rdd.RDD$$anonfun$filter$1.apply(RDD.scala:386)
at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:151)
at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:112)
at org.apache.spark.rdd.RDD.withScope(RDD.scala:362)
at org.apache.spark.rdd.RDD.filter(RDD.scala:386)
at com.atguigu.Search.getMatche1(SeriTest.scala:39)
at com.atguigu.SeriTest$.main(SeriTest.scala:18)
at com.atguigu.SeriTest.main(SeriTest.scala)
Caused by: java.io.NotSerializableException: com.atguigu.Search
3.问题说明
//过滤出包含字符串的RDD
def getMatche2(rdd: RDD[String]): RDD[String] = {
rdd.filter(x => x.contains(query))
}
在这个方法中所调用的方法query是定义在Search这个类中的字段,实际上调用的是this. query,this表示Search这个类的对象,程序在运行过程中需要将Search对象序列化以后传递到Executor端。
4.解决方案
1)使类继承scala.Serializable即可。
class Search() extends Serializable{...}
2)将类变量query赋值给局部变量
修改getMatche2为
//过滤出包含字符串的RDD
def getMatche2(rdd: RDD[String]): RDD[String] = {
val query_ : String = this.query//将类变量赋值给局部变量
rdd.filter(x => x.contains(query_))
}
2.6 RDD依赖关系
2.6.1 Lineage
RDD只支持粗粒度转换,即在大量记录上执行的单个操作。将创建RDD的一系列Lineage(血统)记录下来,以便恢复丢失的分区。RDD的Lineage会记录RDD的元数据信息和转换行为,当该RDD的部分分区数据丢失时,它可以根据这些信息来重新运算和恢复丢失的数据分区。
(1)读取一个HDFS文件并将其中内容映射成一个个元组
scala> val wordAndOne = sc.textFile("/fruit.tsv").flatMap(_.split("\t")).map((_,1))
wordAndOne: org.apache.spark.rdd.RDD[(String, Int)] = MapPartitionsRDD[22] at map at <console>:24
(2)统计每一种key对应的个数
scala> val wordAndCount = wordAndOne.reduceByKey(_+_)
wordAndCount: org.apache.spark.rdd.RDD[(String, Int)] = ShuffledRDD[23] at reduceByKey at <console>:26
(3)查看“wordAndOne”的Lineage
scala> wordAndOne.toDebugString
res5: String =
(2) MapPartitionsRDD[22] at map at <console>:24 []
| MapPartitionsRDD[21] at flatMap at <console>:24 []
| /fruit.tsv MapPartitionsRDD[20] at textFile at <console>:24 []
| /fruit.tsv HadoopRDD[19] at textFile at <console>:24 []
(4)查看“wordAndCount”的Lineage
scala> wordAndCount.toDebugString
res6: String =
(2) ShuffledRDD[23] at reduceByKey at <console>:26 []
+-(2) MapPartitionsRDD[22] at map at <console>:24 []
| MapPartitionsRDD[21] at flatMap at <console>:24 []
| /fruit.tsv MapPartitionsRDD[20] at textFile at <console>:24 []
| /fruit.tsv HadoopRDD[19] at textFile at <console>:24 []
(5)查看“wordAndOne”的依赖类型
scala> wordAndOne.dependencies
res7: Seq[org.apache.spark.Dependency[_]] = List(org.apache.spark.OneToOneDependency@5d5db92b)
(6)查看“wordAndCount”的依赖类型
scala> wordAndCount.dependencies
res8: Seq[org.apache.spark.Dependency[_]] = List(org.apache.spark.ShuffleDependency@63f3e6a8)
注意:RDD和它依赖的父RDD(s)的关系有两种不同的类型,即窄依赖(narrow dependency)和宽依赖(wide dependency)。
2.6.2 窄依赖
窄依赖指的是每一个父RDD的Partition最多被子RDD的一个Partition使用,窄依赖我们形象的比喻为独生子女
2.6.3 宽依赖
宽依赖指的是多个子RDD的Partition会依赖同一个父RDD的Partition,会引起shuffle,总结:宽依赖我们形象的比喻为超生
2.6.4 DAG
DAG(Directed Acyclic Graph)叫做有向无环图,原始的RDD通过一系列的转换就就形成了DAG,根据RDD之间的依赖关系的不同将DAG划分成不同的Stage,对于窄依赖,partition的转换处理在Stage中完成计算。对于宽依赖,由于有Shuffle的存在,只能在parent RDD处理完成后,才能开始接下来的计算,因此宽依赖是划分Stage的依据。
2.6.5 任务划分(面试重点)
RDD任务切分中间分为:Application、Job、Stage和Task
1)Application:初始化一个SparkContext即生成一个Application
2)Job:一个Action算子就会生成一个Job
3)Stage:根据RDD之间的依赖关系的不同将Job划分成不同的Stage,遇到一个宽依赖则划分一个Stage。
4)Task:Stage是一个TaskSet,将Stage划分的结果发送到不同的Executor执行即为一个Task。
注意:Application->Job->Stage-> Task每一层都是1对n的关系。
2.7 RDD缓存
RDD通过persist方法或cache方法可以将前面的计算结果缓存,默认情况下 persist() 会把数据以序列化的形式缓存在 JVM 的堆空间中。
但是并不是这两个方法被调用时立即缓存,而是触发后面的action时,该RDD将会被缓存在计算节点的内存中,并供后面重用。
通过查看源码发现cache最终也是调用了persist方法,默认的存储级别都是仅在内存存储一份,Spark的存储级别还有好多种,存储级别在object StorageLevel中定义的。
在存储级别的末尾加上“_2”来把持久化数据存为两份
缓存有可能丢失,或者存储存储于内存的数据由于内存不足而被删除,RDD的缓存容错机制保证了即使缓存丢失也能保证计算的正确执行。通过基于RDD的一系列转换,丢失的数据会被重算,由于RDD的各个Partition是相对独立的,因此只需要计算丢失的部分即可,并不需要重算全部Partition。
(1)创建一个RDD
scala> val rdd = sc.makeRDD(Array("atguigu"))
rdd: org.apache.spark.rdd.RDD[String] = ParallelCollectionRDD[19] at makeRDD at <console>:25
(2)将RDD转换为携带当前时间戳不做缓存
scala> val nocache = rdd.map(_.toString+System.currentTimeMillis)
nocache: org.apache.spark.rdd.RDD[String] = MapPartitionsRDD[20] at map at <console>:27
(3)多次打印结果
scala> nocache.collect
res0: Array[String] = Array(atguigu1538978275359)
scala> nocache.collect
res1: Array[String] = Array(atguigu1538978282416)
scala> nocache.collect
res2: Array[String] = Array(atguigu1538978283199)
(4)将RDD转换为携带当前时间戳并做缓存
scala> val cache = rdd.map(_.toString+System.currentTimeMillis).cache
cache: org.apache.spark.rdd.RDD[String] = MapPartitionsRDD[21] at map at <console>:27
(5)多次打印做了缓存的结果
scala> cache.collect
res3: Array[String] = Array(atguigu1538978435705)
scala> cache.collect
res4: Array[String] = Array(atguigu1538978435705)
scala> cache.collect
res5: Array[String] = Array(atguigu1538978435705)
2.8 RDD CheckPoint
Spark中对于数据的保存除了持久化操作之外,还提供了一种检查点的机制,检查点(本质是通过将RDD写入Disk做检查点)是为了通过lineage做容错的辅助,lineage过长会造成容错成本过高,这样就不如在中间阶段做检查点容错,如果之后有节点出现问题而丢失分区,从做检查点的RDD开始重做Lineage,就会减少开销。检查点通过将数据写入到HDFS文件系统实现了RDD的检查点功能。
为当前RDD设置检查点。该函数将会创建一个二进制的文件,并存储到checkpoint目录中,该目录是用SparkContext.setCheckpointDir()设置的。在checkpoint的过程中,该RDD的所有依赖于父RDD中的信息将全部被移除。对RDD进行checkpoint操作并不会马上被执行,必须执行Action操作才能触发。
案例实操:
(1)设置检查点
scala> sc.setCheckpointDir("hdfs://hadoop102:9000/checkpoint")
(2)创建一个RDD
scala> val rdd = sc.parallelize(Array("atguigu"))
rdd: org.apache.spark.rdd.RDD[String] = ParallelCollectionRDD[14] at parallelize at <console>:24
(3)将RDD转换为携带当前时间戳并做checkpoint
scala> val ch = rdd.map(_+System.currentTimeMillis)
ch: org.apache.spark.rdd.RDD[String] = MapPartitionsRDD[16] at map at <console>:26
scala> ch.checkpoint
(4)多次打印结果
scala> ch.collect
res55: Array[String] = Array(atguigu1538981860336)
scala> ch.collect
res56: Array[String] = Array(atguigu1538981860504)
scala> ch.collect
res57: Array[String] = Array(atguigu1538981860504)
scala> ch.collect
res58: Array[String] = Array(atguigu1538981860504)
三、键值对RDD数据分区器
Spark目前支持Hash分区和Range分区,用户也可以自定义分区,Hash分区为当前的默认分区,Spark中分区器直接决定了RDD中分区的个数、RDD中每条数据经过Shuffle过程属于哪个分区和Reduce的个数
注意:
(1)只有Key-Value类型的RDD才有分区器的,非Key-Value类型的RDD分区器的值是None
(2)每个RDD的分区ID范围:0~numPartitions-1,决定这个值是属于那个分区的。
3.1 获取RDD分区
可以通过使用RDD的partitioner 属性来获取 RDD 的分区方式。它会返回一个 scala.Option 对象, 通过get方法获取其中的值。相关源码如下:
def getPartition(key: Any): Int = key match {
case null => 0
case _ => Utils.nonNegativeMod(key.hashCode, numPartitions)
}
def nonNegativeMod(x: Int, mod: Int): Int = {
val rawMod = x % mod
rawMod + (if (rawMod < 0) mod else 0)
}
(1)创建一个pairRDD
scala> val pairs = sc.parallelize(List((1,1),(2,2),(3,3)))
pairs: org.apache.spark.rdd.RDD[(Int, Int)] = ParallelCollectionRDD[3] at parallelize at <console>:24
(2)查看RDD的分区器
scala> pairs.partitioner
res1: Option[org.apache.spark.Partitioner] = None
(3)导入HashPartitioner类
scala> import org.apache.spark.HashPartitioner
import org.apache.spark.HashPartitioner
(4)使用HashPartitioner对RDD进行重新分区
scala> val partitioned = pairs.partitionBy(new HashPartitioner(2))
partitioned: org.apache.spark.rdd.RDD[(Int, Int)] = ShuffledRDD[4] at partitionBy at <console>:27
(5)查看重新分区后RDD的分区器
scala> partitioned.partitioner
res2: Option[org.apache.spark.Partitioner] = Some(org.apache.spark.HashPartitioner@2)
3.2 Hash分区
HashPartitioner分区的原理:对于给定的key,计算其hashCode,并除以分区的个数取余,如果余数小于0,则用余数+分区的个数(否则加0),最后返回的值就是这个key所属的分区ID。
使用Hash分区的实操
scala> nopar.partitioner
res20: Option[org.apache.spark.Partitioner] = None
scala> val nopar = sc.parallelize(List((1,3),(1,2),(2,4),(2,3),(3,6),(3,8)),8)
nopar: org.apache.spark.rdd.RDD[(Int, Int)] = ParallelCollectionRDD[10] at parallelize at <console>:24
scala>nopar.mapPartitionsWithIndex((index,iter)=>{ Iterator(index.toString+" : "+iter.mkString("|")) }).collect
res0: Array[String] = Array("0 : ", 1 : (1,3), 2 : (1,2), 3 : (2,4), "4 : ", 5 : (2,3), 6 : (3,6), 7 : (3,8))
scala> val hashpar = nopar.partitionBy(new org.apache.spark.HashPartitioner(7))
hashpar: org.apache.spark.rdd.RDD[(Int, Int)] = ShuffledRDD[12] at partitionBy at <console>:26
scala> hashpar.count
res18: Long = 6
scala> hashpar.partitioner
res21: Option[org.apache.spark.Partitioner] = Some(org.apache.spark.HashPartitioner@7)
scala> hashpar.mapPartitions(iter => Iterator(iter.length)).collect()
res19: Array[Int] = Array(0, 3, 1, 2, 0, 0, 0)
3.3 Ranger分区
HashPartitioner分区弊端:可能导致每个分区中数据量的不均匀,极端情况下会导致某些分区拥有RDD的全部数据。
RangePartitioner作用:将一定范围内的数映射到某一个分区内,尽量保证每个分区中数据量的均匀,而且分区与分区之间是有序的,一个分区中的元素肯定都是比另一个分区内的元素小或者大,但是分区内的元素是不能保证顺序的。简单的说就是将一定范围内的数映射到某一个分区内。实现过程为:
第一步:先重整个RDD中抽取出样本数据,将样本数据排序,计算出每个分区的最大key值,形成一个Array[KEY]类型的数组变量rangeBounds;
第二步:判断key在rangeBounds中所处的范围,给出该key值在下一个RDD中的分区id下标;该分区器要求RDD中的KEY类型必须是可以排序的
3.4 自定义分区
要实现自定义的分区器,你需要继承 org.apache.spark.Partitioner 类并实现下面三个方法。
(1)numPartitions: Int:返回创建出来的分区数。
(2)getPartition(key: Any): Int:返回给定键的分区编号(0到numPartitions-1)。
(3)equals():Java 判断相等性的标准方法。这个方法的实现非常重要,Spark 需要用这个方法来检查你的分区器对象是否和其他分区器实例相同,这样 Spark 才可以判断两个 RDD 的分区方式是否相同。
需求:将相同后缀的数据写入相同的文件,通过将相同后缀的数据分区到相同的分区并保存输出来实现。
(1)创建一个pairRDD
scala> val data = sc.parallelize(Array((1,1),(2,2),(3,3),(4,4),(5,5),(6,6)))
data: org.apache.spark.rdd.RDD[(Int, Int)] = ParallelCollectionRDD[3] at parallelize at <console>:24
(2)定义一个自定义分区类
scala> :paste
// Entering paste mode (ctrl-D to finish)
class CustomerPartitioner(numParts:Int) extends org.apache.spark.Partitioner{
//覆盖分区数
override def numPartitions: Int = numParts
//覆盖分区号获取函数
override def getPartition(key: Any): Int = {
val ckey: String = key.toString
ckey.substring(ckey.length-1).toInt%numParts
}
}
// Exiting paste mode, now interpreting.
defined class CustomerPartitioner
(3)将RDD使用自定义的分区类进行重新分区
scala> val par = data.partitionBy(new CustomerPartitioner(2))
par: org.apache.spark.rdd.RDD[(Int, Int)] = ShuffledRDD[2] at partitionBy at <console>:27
(4)查看重新分区后的数据分布
scala> par.mapPartitionsWithIndex((index,items)=>items.map((index,_))).collect
res3: Array[(Int, (Int, Int))] = Array((0,(2,2)), (0,(4,4)), (0,(6,6)), (1,(1,1)), (1,(3,3)), (1,(5,5)))
使用自定义的 Partitioner 是很容易的:只要把它传给 partitionBy() 方法即可。Spark 中有许多依赖于数据混洗的方法,比如 join() 和 groupByKey(),它们也可以接收一个可选的 Partitioner 对象来控制输出数据的分区方式。
四、数据读取与保存
Spark的数据读取及数据保存可以从两个维度来作区分:文件格式以及文件系统。
文件格式分为:Text文件、Json文件、Csv文件、Sequence文件以及Object文件;
文件系统分为:本地文件系统、HDFS、HBASE以及数据库。
4.1 文件类数据读取与保存
4.1.1 Text文件
1)数据读取:textFile(String)
scala> val hdfsFile = sc.textFile("hdfs://hadoop102:9000/fruit.txt")
hdfsFile: org.apache.spark.rdd.RDD[String] = hdfs://hadoop102:9000/fruit.txt MapPartitionsRDD[21] at textFile at <console>:24
2)数据保存: saveAsTextFile(String)
scala> hdfsFile.saveAsTextFile("/fruitOut")
4.1.2 Json文件
如果JSON文件中每一行就是一个JSON记录,那么可以通过将JSON文件当做文本文件来读取,然后利用相关的JSON库对每一条数据进行JSON解析。
注意:使用RDD读取JSON文件处理很复杂,同时SparkSQL集成了很好的处理JSON文件的方式,所以应用中多是采用SparkSQL处理JSON文件。
(1)导入解析json所需的包
scala> import scala.util.parsing.json.JSON
(2)上传json文件到HDFS
[atguigu@hadoop102 spark]$ hadoop fs -put ./examples/src/main/resources/people.json /
(3)读取文件
scala> val json = sc.textFile("/people.json")
json: org.apache.spark.rdd.RDD[String] = /people.json MapPartitionsRDD[8] at textFile at <console>:24
(4)解析json数据
scala> val result = json.map(JSON.parseFull)
result: org.apache.spark.rdd.RDD[Option[Any]] = MapPartitionsRDD[10] at map at <console>:27
(5)打印
scala> result.collect
res11: Array[Option[Any]] = Array(Some(Map(name -> Michael)), Some(Map(name -> Andy, age -> 30.0)), Some(Map(name -> Justin, age -> 19.0)))
4.1.3 Sequence文件
SequenceFile文件是Hadoop用来存储二进制形式的key-value对而设计的一种平面文件(Flat File)。Spark 有专门用来读取 SequenceFile 的接口。在 SparkContext 中,可以调用 sequenceFile[ keyClass, valueClass](path)。
注意:SequenceFile文件只针对PairRDD
(1)创建一个RDD
scala> val rdd = sc.parallelize(Array((1,2),(3,4),(5,6)))
rdd: org.apache.spark.rdd.RDD[(Int, Int)] = ParallelCollectionRDD[13] at parallelize at <console>:24
(2)将RDD保存为Sequence文件
scala> rdd.saveAsSequenceFile("file:///opt/module/spark/seqFile")
(3)查看该文件
[atguigu@hadoop102 seqFile]$ pwd
/opt/module/spark/seqFile
[atguigu@hadoop102 seqFile]$ ll
总用量 8
-rw-r--r-- 1 atguigu atguigu 108 10月 9 10:29 part-00000
-rw-r--r-- 1 atguigu atguigu 124 10月 9 10:29 part-00001
-rw-r--r-- 1 atguigu atguigu 0 10月 9 10:29 _SUCCESS
[atguigu@hadoop102 seqFile]$ cat part-00000
SEQ org.apache.hadoop.io.IntWritable org.apache.hadoop.io.IntWritableط
(4)读取Sequence文件
scala> val seq = sc.sequenceFile[Int,Int]("file:///opt/module/spark/seqFile")
seq: org.apache.spark.rdd.RDD[(Int, Int)] = MapPartitionsRDD[18] at sequenceFile at <console>:24
(5)打印读取后的Sequence文件
scala> seq.collect
res14: Array[(Int, Int)] = Array((1,2), (3,4), (5,6))
4.1.4 对象文件
对象文件是将对象序列化后保存的文件,采用Java的序列化机制。可以通过objectFile[k,v](path) 函数接收一个路径,读取对象文件,返回对应的 RDD,也可以通过调用saveAsObjectFile() 实现对对象文件的输出。因为是序列化所以要指定类型。
(1)创建一个RDD
scala> val rdd = sc.parallelize(Array(1,2,3,4))
rdd: org.apache.spark.rdd.RDD[Int] = ParallelCollectionRDD[19] at parallelize at <console>:24
(2)将RDD保存为Object文件
scala> rdd.saveAsObjectFile("file:///opt/module/spark/objectFile")
(3)查看该文件
[atguigu@hadoop102 objectFile]$ pwd
/opt/module/spark/objectFile
[atguigu@hadoop102 objectFile]$ ll
总用量 8
-rw-r--r-- 1 atguigu atguigu 142 10月 9 10:37 part-00000
-rw-r--r-- 1 atguigu atguigu 142 10月 9 10:37 part-00001
-rw-r--r-- 1 atguigu atguigu 0 10月 9 10:37 _SUCCESS
[atguigu@hadoop102 objectFile]$ cat part-00000
SEQ!org.apache.hadoop.io.NullWritable"org.apache.hadoop.io.BytesWritableW@`l
(4)读取Object文件
scala> val objFile = sc.objectFile[Int]("file:///opt/module/spark/objectFile")
objFile: org.apache.spark.rdd.RDD[Int] = MapPartitionsRDD[31] at objectFile at <console>:24
(5)打印读取后的Sequence文件
scala> objFile.collect
res19: Array[Int] = Array(1, 2, 3, 4)
4.2 文件系统类数据读取与保存
4.2.1 HDFS
Spark的整个生态系统与Hadoop是完全兼容的,所以对于Hadoop所支持的文件类型或者数据库类型,Spark也同样支持.另外,由于Hadoop的API有新旧两个版本,所以Spark为了能够兼容Hadoop所有的版本,也提供了两套创建操作接口.对于外部存储创建操作而言,hadoopRDD和newHadoopRDD是最为抽象的两个函数接口,主要包含以下四个参数.
1)输入格式(InputFormat): 制定数据输入的类型,如TextInputFormat等,新旧两个版本所引用的版本分别是org.apache.hadoop.mapred.InputFormat和org.apache.hadoop.mapreduce.InputFormat(NewInputFormat)
2)键类型: 指定[K,V]键值对中K的类型
3)值类型: 指定[K,V]键值对中V的类型
4)分区值: 指定由外部存储生成的RDD的partition数量的最小值,如果没有指定,系统会使用默认值defaultMinSplits
注意:其他创建操作的API接口都是为了方便最终的Spark程序开发者而设置的,是这两个接口的高效实现版本.例如,对于textFile而言,只有path这个指定文件路径的参数,其他参数在系统内部指定了默认值。
1.在Hadoop中以压缩形式存储的数据,不需要指定解压方式就能够进行读取,因为Hadoop本身有一个解压器会根据压缩文件的后缀推断解压算法进行解压.
2.如果用Spark从Hadoop中读取某种类型的数据不知道怎么读取的时候,上网查找一个使用map-reduce的时候是怎么读取这种这种数据的,然后再将对应的读取方式改写成上面的hadoopRDD和newAPIHadoopRDD两个类就行了
4.2.2 MySQL数据库连接
支持通过Java JDBC访问关系型数据库。需要通过JdbcRDD进行,示例如下:
(1)添加依赖
<dependency>
<groupId>mysql</groupId>
<artifactId>mysql-connector-java</artifactId>
<version>5.1.27</version>
</dependency>
(2)Mysql读取:
package com.atguigu
import java.sql.DriverManager
import org.apache.spark.rdd.JdbcRDD
import org.apache.spark.{SparkConf, SparkContext}
object MysqlRDD {
def main(args: Array[String]): Unit = {
//1.创建spark配置信息
val sparkConf: SparkConf = new SparkConf().setMaster("local[*]").setAppName("JdbcRDD")
//2.创建SparkContext
val sc = new SparkContext(sparkConf)
//3.定义连接mysql的参数
val driver = "com.mysql.jdbc.Driver"
val url = "jdbc:mysql://hadoop102:3306/rdd"
val userName = "root"
val passWd = "000000"
//创建JdbcRDD
val rdd = new JdbcRDD(sc, () => {
Class.forName(driver)
DriverManager.getConnection(url, userName, passWd)
},
"select * from `rddtable` where `id`>=?;",
1,
10,
1,
r => (r.getInt(1), r.getString(2))
)
//打印最后结果
println(rdd.count())
rdd.foreach(println)
sc.stop()
}
}
Mysql写入:
def main(args: Array[String]) {
val sparkConf = new SparkConf().setMaster("local[2]").setAppName("HBaseApp")
val sc = new SparkContext(sparkConf)
val data = sc.parallelize(List("Female", "Male","Female"))
data.foreachPartition(insertData)
}
def insertData(iterator: Iterator[String]): Unit = {
Class.forName ("com.mysql.jdbc.Driver").newInstance()
val conn = java.sql.DriverManager.getConnection("jdbc:mysql://hadoop102:3306/rdd", "root", "000000")
iterator.foreach(data => {
val ps = conn.prepareStatement("insert into rddtable(name) values (?)")
ps.setString(1, data)
ps.executeUpdate()
})
}
4.2.3 HBase数据库
由于 org.apache.hadoop.hbase.mapreduce.TableInputFormat 类的实现,Spark 可以通过Hadoop输入格式访问HBase。这个输入格式会返回键值对数据,其中键的类型为org. apache.hadoop.hbase.io.ImmutableBytesWritable,而值的类型为org.apache.hadoop.hbase.client.
Result。
(1)添加依赖
<dependency>
<groupId>org.apache.hbase</groupId>
<artifactId>hbase-server</artifactId>
<version>1.3.1</version>
</dependency>
<dependency>
<groupId>org.apache.hbase</groupId>
<artifactId>hbase-client</artifactId>
<version>1.3.1</version>
</dependency>
(2)从HBase读取数据
package com.atguigu
import org.apache.hadoop.conf.Configuration
import org.apache.hadoop.hbase.HBaseConfiguration
import org.apache.hadoop.hbase.client.Result
import org.apache.hadoop.hbase.io.ImmutableBytesWritable
import org.apache.hadoop.hbase.mapreduce.TableInputFormat
import org.apache.spark.rdd.RDD
import org.apache.spark.{SparkConf, SparkContext}
import org.apache.hadoop.hbase.util.Bytes
object HBaseSpark {
def main(args: Array[String]): Unit = {
//创建spark配置信息
val sparkConf: SparkConf = new SparkConf().setMaster("local[*]").setAppName("JdbcRDD")
//创建SparkContext
val sc = new SparkContext(sparkConf)
//构建HBase配置信息
val conf: Configuration = HBaseConfiguration.create()
conf.set("hbase.zookeeper.quorum", "hadoop102,hadoop103,hadoop104")
conf.set(TableInputFormat.INPUT_TABLE, "rddtable")
//从HBase读取数据形成RDD
val hbaseRDD: RDD[(ImmutableBytesWritable, Result)] = sc.newAPIHadoopRDD(
conf,
classOf[TableInputFormat],
classOf[ImmutableBytesWritable],
classOf[Result])
val count: Long = hbaseRDD.count()
println(count)
//对hbaseRDD进行处理
hbaseRDD.foreach {
case (_, result) =>
val key: String = Bytes.toString(result.getRow)
val name: String = Bytes.toString(result.getValue(Bytes.toBytes("info"), Bytes.toBytes("name")))
val color: String = Bytes.toString(result.getValue(Bytes.toBytes("info"), Bytes.toBytes("color")))
println("RowKey:" + key + ",Name:" + name + ",Color:" + color)
}
//关闭连接
sc.stop()
}
}
3)往HBase写入
def main(args: Array[String]) {
//获取Spark配置信息并创建与spark的连接
val sparkConf = new SparkConf().setMaster("local[*]").setAppName("HBaseApp")
val sc = new SparkContext(sparkConf)
//创建HBaseConf
val conf = HBaseConfiguration.create()
val jobConf = new JobConf(conf)
jobConf.setOutputFormat(classOf[TableOutputFormat])
jobConf.set(TableOutputFormat.OUTPUT_TABLE, "fruit_spark")
//构建Hbase表描述器
val fruitTable = TableName.valueOf("fruit_spark")
val tableDescr = new HTableDescriptor(fruitTable)
tableDescr.addFamily(new HColumnDescriptor("info".getBytes))
//创建Hbase表
val admin = new HBaseAdmin(conf)
if (admin.tableExists(fruitTable)) {
admin.disableTable(fruitTable)
admin.deleteTable(fruitTable)
}
admin.createTable(tableDescr)
//定义往Hbase插入数据的方法
def convert(triple: (Int, String, Int)) = {
val put = new Put(Bytes.toBytes(triple._1))
put.addImmutable(Bytes.toBytes("info"), Bytes.toBytes("name"), Bytes.toBytes(triple._2))
put.addImmutable(Bytes.toBytes("info"), Bytes.toBytes("price"), Bytes.toBytes(triple._3))
(new ImmutableBytesWritable, put)
}
//创建一个RDD
val initialRDD = sc.parallelize(List((1,"apple",11), (2,"banana",12), (3,"pear",13)))
//将RDD内容写到HBase
val localData = initialRDD.map(convert)
localData.saveAsHadoopDataset(jobConf)
}
五、RDD编程进阶
5.1 累加器
累加器用来对信息进行聚合,通常在向 Spark传递函数时,比如使用 map() 函数或者用 filter() 传条件时,可以使用驱动器程序中定义的变量,但是集群中运行的每个任务都会得到这些变量的一份新的副本,更新这些副本的值也不会影响驱动器中的对应变量。如果我们想实现所有分片处理时更新共享变量的功能,那么累加器可以实现我们想要的效果。
5.1.1 系统累加器
针对一个输入的日志文件,如果我们想计算文件中所有空行的数量,我们可以编写以下程序:
scala> val notice = sc.textFile("./NOTICE")
notice: org.apache.spark.rdd.RDD[String] = ./NOTICE MapPartitionsRDD[40] at textFile at <console>:32
scala> val blanklines = sc.accumulator(0)
warning: there were two deprecation warnings; re-run with -deprecation for details
blanklines: org.apache.spark.Accumulator[Int] = 0
scala> val tmp = notice.flatMap(line => {
| if (line == "") {
| blanklines += 1
| }
| line.split(" ")
| })
tmp: org.apache.spark.rdd.RDD[String] = MapPartitionsRDD[41] at flatMap at <console>:36
scala> tmp.count()
res31: Long = 3213
scala> blanklines.value
res32: Int = 171
累加器的用法如下所示。
通过在驱动器中调用SparkContext.accumulator(initialValue)方法,创建出存有初始值的累加器。返回值为 org.apache.spark.Accumulator[T] 对象,其中 T 是初始值 initialValue 的类型。Spark闭包里的执行器代码可以使用累加器的 += 方法(在Java中是 add)增加累加器的值。 驱动器程序可以调用累加器的value属性(在Java中使用value()或setValue())来访问累加器的值。
注意:工作节点上的任务不能访问累加器的值。从这些任务的角度来看,累加器是一个只写变量。
对于要在行动操作中使用的累加器,Spark只会把每个任务对各累加器的修改应用一次。因此,如果想要一个无论在失败还是重复计算时都绝对可靠的累加器,我们必须把它放在 foreach() 这样的行动操作中。转化操作中累加器可能会发生不止一次更新
5.1.2 自定义累加器
自定义累加器类型的功能在1.X版本中就已经提供了,但是使用起来比较麻烦,在2.0版本后,累加器的易用性有了较大的改进,而且官方还提供了一个新的抽象类:AccumulatorV2来提供更加友好的自定义类型累加器的实现方式。实现自定义类型累加器需要继承AccumulatorV2并至少覆写下例中出现的方法,下面这个累加器可以用于在程序运行过程中收集一些文本类信息,最终以Set[String]的形式返回。1
package com.atguigu.spark
import org.apache.spark.util.AccumulatorV2
import org.apache.spark.{SparkConf, SparkContext}
import scala.collection.JavaConversions._
class LogAccumulator extends org.apache.spark.util.AccumulatorV2[String, java.util.Set[String]] {
private val _logArray: java.util.Set[String] = new java.util.HashSet[String]()
override def isZero: Boolean = {
_logArray.isEmpty
}
override def reset(): Unit = {
_logArray.clear()
}
override def add(v: String): Unit = {
_logArray.add(v)
}
override def merge(other: org.apache.spark.util.AccumulatorV2[String, java.util.Set[String]]): Unit = {
other match {
case o: LogAccumulator => _logArray.addAll(o.value)
}
}
override def value: java.util.Set[String] = {
java.util.Collections.unmodifiableSet(_logArray)
}
override def copy():org.apache.spark.util.AccumulatorV2[String, java.util.Set[String]] = {
val newAcc = new LogAccumulator()
_logArray.synchronized{
newAcc._logArray.addAll(_logArray)
}
newAcc
}
}
// 过滤掉带字母的
object LogAccumulator {
def main(args: Array[String]) {
val conf=new SparkConf().setAppName("LogAccumulator")
val sc=new SparkContext(conf)
val accum = new LogAccumulator
sc.register(accum, "logAccum")
val sum = sc.parallelize(Array("1", "2a", "3", "4b", "5", "6", "7cd", "8", "9"), 2).filter(line => {
val pattern = """^-?(\d+)"""
val flag = line.matches(pattern)
if (!flag) {
accum.add(line)
}
flag
}).map(_.toInt).reduce(_ + _)
println("sum: " + sum)
for (v <- accum.value) print(v + "")
println()
sc.stop()
}
}
5.2 广播变量(调优策略)
广播变量用来高效分发较大的对象。向所有工作节点发送一个较大的只读值,以供一个或多个Spark操作使用。比如,如果你的应用需要向所有节点发送一个较大的只读查询表,甚至是机器学习算法中的一个很大的特征向量,广播变量用起来都很顺手。 在多个并行操作中使用同一个变量,但是 Spark会为每个任务分别发送。
scala> val broadcastVar = sc.broadcast(Array(1, 2, 3))
broadcastVar: org.apache.spark.broadcast.Broadcast[Array[Int]] = Broadcast(35)
scala> broadcastVar.value
res33: Array[Int] = Array(1, 2, 3)
使用广播变量的过程如下:
(1) 通过对一个类型 T 的对象调用 SparkContext.broadcast 创建出一个 Broadcast[T] 对象。 任何可序列化的类型都可以这么实现。
(2) 通过 value 属性访问该对象的值(在 Java 中为 value() 方法)。
(3) 变量只会被发到各个节点一次,应作为只读值处理(修改这个值不会影响到别的节点)。
六、扩展
6.1 RDD相关概念关系
输入可能以多个文件的形式存储在HDFS上,每个File都包含了很多块,称为Block。当Spark读取这些文件作为输入时,会根据具体数据格式对应的InputFormat进行解析,一般是将若干个Block合并成一个输入分片,称为InputSplit,注意InputSplit不能跨越文件。随后将为这些输入分片生成具体的Task。InputSplit与Task是一一对应的关系。随后这些具体的Task每个都会被分配到集群上的某个节点的某个Executor去执行。
1) 每个节点可以起一个或多个Executor。
2) 每个Executor由若干core组成,每个Executor的每个core一次只能执行一个Task。
3) 每个Task执行的结果就是生成了目标RDD的一个partiton。
注意: 这里的core是虚拟的core而不是机器的物理CPU核,可以理解为就是Executor的一个工作线程。而 Task被执行的并发度 = Executor数目 * 每个Executor核数。至于partition的数目:
1) 对于数据读入阶段,例如sc.textFile,输入文件被划分为多少InputSplit就会需要多少初始Task。
2) 在Map阶段partition数目保持不变。
3) 在Reduce阶段,RDD的聚合会触发shuffle操作,聚合后的RDD的partition数目跟具体操作有关,例如repartition操作会聚合成指定分区数,还有一些算子是可配置的。
RDD在计算的时候,每个分区都会起一个task,所以rdd的分区数目决定了总的的task数目。申请的计算节点(Executor)数目和每个计算节点核数,决定了你同一时刻可以并行执行的task。
比如的RDD有100个分区,那么计算的时候就会生成100个task,你的资源配置为10个计算节点,每个两2个核,同一时刻可以并行的task数目为20,计算这个RDD就需要5个轮次。如果计算资源不变,你有101个task的话,就需要6个轮次,在最后一轮中,只有一个task在执行,其余核都在空转。如果资源不变,你的RDD只有2个分区,那么同一时刻只有2个task运行,其余18个核空转,造成资源浪费。这就是在spark调优中,增大RDD分区数目,增大任务并行度的做法。
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