Problem

An RNA string is a string formed from the alphabet containing 'A', 'C', 'G', and 'U'.

Given a DNA string tt corresponding to a coding strand, its transcribed RNA string uu is formed by replacing all occurrences of 'T' in tt with 'U' in uu.

Given: A DNA string tt having length at most 1000 nt.

Return: The transcribed RNA string of tt.

Sample Dataset

GATGGAACTTGACTACGTAAATT

Sample Output

GAUGGAACUUGACUACGUAAAUU

# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Thu Dec 08 20:33:16 2016

@author: hyl
"""
### 2. Transcribing DNA into RNA ###
import re
d = {'A':0,'T':0,'G':0,'C':0}
f=  open('C:\\Users\\hyl\\Desktop\\rosalind_rna.txt')
#print f.readlines()
dna = ''
for line in f.readlines():
    #line = line.rstrip()
    dna += line
rnaseq = re.sub("T","U",dna,count =0)
print rnaseq

2. Transcribing DNA into RNA的更多相关文章

  1. 02 Transcribing DNA into RNA

    Problem An RNA string is a string formed from the alphabet containing 'A', 'C', 'G', and 'U'. Given ...

  2. 1.Counting DNA Nucleotides

    Problem A string is simply an ordered collection of symbols selected from some alphabet and formed i ...

  3. DNA sequence open reading frames (ORFs) | DNA序列的开放阅读框ORF预测

    常见的ORF预测工具 Open Reading Frame Finder- NCBI ORF Finder - SMS OrfPredictor  - YSU 基本概念 开放阅读框(英语:Open r ...

  4. 单细胞RNA测序技术之入门指南

    单细胞RNA测序技术之入门指南 [字体: 大 中 小 ] 时间:2018年09月12日 来源:生物通   编辑推荐: 在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”.若要 ...

  5. 解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生

    解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生 任鲁风  于军 (中国科学院基因组科学及信息重点实验室,北京基因组研究所) DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)是生命体的两种最基本组成物质 ...

  6. RNA sequence单分子直测技术

    生命组学 按照功能分类遗传物质,可能的分类有系统流.操作流.平衡流等等.下面是使用该理论解释DNA与RNA的关系: DNA和RNA有很大不同,DNA存储遗传信息,作为生命活动的最内核物质,如同操作系统 ...

  7. SAGE|DNA微阵列|RNA-seq|lncRNA|scripture|tophat|cufflinks|NONCODE|MA|LOWESS|qualitile归一化|permutation test|SAM|FDR|The Bonferroni|Tukey's|BH|FWER|Holm's step-down|q-value|

    生物信息学-基因表达分析 为了丰富中心法则,研究人员使用不断更新的技术研究lncRNA的方方面面,其中技术主要是生物学上的微阵列芯片技术和表达数据分析方法,方方面面是指lncRNA的位置特征. Bac ...

  8. 样本、文库、重复、lane、run - 二代测序原理及名词解释

    参考: 独占鳌头的Illumina仪器(二代测序篇) HiSeq2000测序原理.流程与仪器 NGS文库制备的方法比较[心得点评] 各种测序文库构建方式 样本:就是待测的DNA.RNA或蛋白序列,样本 ...

  9. stanford NLP学习笔记3:最小编辑距离(Minimum Edit Distance)

    I. 最小编辑距离的定义 最小编辑距离旨在定义两个字符串之间的相似度(word similarity).定义相似度可以用于拼写纠错,计算生物学上的序列比对,机器翻译,信息提取,语音识别等. 编辑距离就 ...

随机推荐

  1. 初始化git远程仓库步骤

    Git global setup git config --global user.name "bingo" git config --global user.email &quo ...

  2. 如何解决前端传来的时间格式与mysql表中时间格式不匹配的查询问题

    前端传过来的时间格式为“2016-07-11 11:13:10”,而数据表中对应字段`add_time`的格式为“2016-7-11”,此时sql不能直接用 "where `add_time ...

  3. Java接口中的方法

    接口中可以含有变量和方法.但是,接口中的变量会被隐式地指定为public static final变量(并且只能是public static final变量,用private修饰会报编译错误),而方法 ...

  4. BOOL和bool的区别

    一. 1.类型不同 BOOL为int型 bool为布尔型 2.长度不同 bool只有一个字节 BOOL长度视实际环境来定,一般可认为是4个字节 3.取值不同 bool取值false和true,是0和1 ...

  5. linux命令每日一练习 创建新文件 列出文件的时候带着行号

    touch ××× nl ****

  6. Python笔记-built-in函数,文件操作,lambda函数

    Built-In: i = abs(123) print(i) j = abs(-123) print(j)#123#123 #all,需要传一个可迭代的东西,里面所有的值是真,返回真 r1 = al ...

  7. Add Two Numbers (c#)

    You are given two linked lists representing two non-negative numbers. The digits are stored in rever ...

  8. js实现当前导航菜单高亮显示

    为了增加用户体验度,增加网页的易用性和美观度,往往需要把当前导航菜单以特殊方式显示,通常是高亮显示或有不同于其它菜单的背景,有两种方法可以实现,第一种是用纯css来实现,二是用js辅助css来实现,两 ...

  9. linux输出 /dev/null

    在学习Linux的过程中,常会看到一些终端命令或者程序中有">/dev/null 2>&1 "出现,由于已经遇到了好几次了,为了理解清楚,不妨花点时间百度或者g ...

  10. HTML <label> 标签

    定义:<label> 标签为 input 元素定义标注(标记). 用法: label 元素不会向用户呈现任何特殊效果.不过,它为鼠标用户改进了可用性.如果您在 label 元素内点击文本, ...