这类报错在我使用bcftools index file.vcf.gz进行index出现的。

解决办法是换用tabix进行index,命令为tabix -p vcf file.vcf.gz

用tabix就可以成功解决。

Failed to open .vcf.gz: could not load index的更多相关文章

  1. react-native 运行提示红屏 error: bundling failed: ambiguous resolution: module `/User/xxx/Project/ico/index.js` tries to require `react-native`, but there are several files providing this module. You can de

    运行 react-native start 报错 执行这2个进行清除缓存问题 yarn start -- --reset-cache  npm start -- --reset-cache  

  2. react中报错Failed to set an indexed property on 'CSSStyleDeclaration': Index property setter is not supported

    产生这个报错的原因是我当时将样式写到了less文件,我在div中使用的使用应该是使用className = ,而我误写了一个style = .style里面当然没有自定义的className,所以产生 ...

  3. jbrowse 的配置与使用gff, vcf, fa, bed, bam

    1,jbrowse 是什么东西 ? JBrowse is a genome browser with a fully dynamic AJAX interface, being developed a ...

  4. bcftools或vcftools提取指定区段的vcf文件(extract specified position )

    下载安装bcftools 见如下命令: bcftools filter 1000Genomes.vcf.gz --regions 9:4700000-4800000 > 4700000-4800 ...

  5. Jbrowse安装和序列、bam、vcf配置

    最近做了一个关于基因开发的项目,要求最终输出的文件可以在专门的基因浏览器上边显示,类似统计图的东西.废话不说上图(表示表达不出来0.0)! 先说下Jbrowse这个东西吧,一句话:一个简单的,便携式依 ...

  6. pysam - 多种格式基因组数据(sam/bam/vcf/bcf/cram/…)读写与处理模块(python)

    在开发基因组相关流程或工具时,经常需要读取.处理和创建bam.vcf.bcf文件.目前已经有一些主流的处理此类格式文件的工具,如samtools.picard.vcftools.bcftools,但此 ...

  7. Fielddata is disabled on text fields by default. Set fielddata=true on [gender] in order to load fielddata in memory by uninverting the inverted index. Note that this can however use significant memor

    ES进行如下聚合操作时,会报如题所示错误: ➜ Downloads curl -XPOST 'localhost:9200/bank/_search?pretty' -d ' { "size ...

  8. 使用bedtools提取vcf多个位置的变异(extract multi-region of genotypes by bedtools)

    1.下载安装bedtools: 2.生成bed文件:标准的bed文件格式如下: chr7 127471196 127472363 Pos1 0 + 127471196 127472363 255,0, ...

  9. bcftools合并vcf文件

    见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...

随机推荐

  1. 理解cookie,session,token

    彻底理解cookie,session,token 发展史 1.很久很久以前,Web 基本上就是文档的浏览而已, 既然是浏览,作为服务器, 不需要记录谁在某一段时间里都浏览了什么文档,每次请求都是一个新 ...

  2. 2018牛客网暑期ACM多校训练营(第二场):discount(基环树DP)

    题意:有N个不同的商品,每个商品原价是Pi元,如果选择打折,可以减少Di元.  现在加一种规则,每个商品有一个友好商品Fai,如果i用原价买,则可以免费买Fai. 现在问买到所有物品的最小价格. 思路 ...

  3. query_posts函数使用方法小结|wordpress技巧

    query_posts是wordpress非常好用的调用文章函数,可以调用某个分类.标签.日期及作者等不同范围的文章列表.下面随ytkah一起来看看query_posts函数使用方法小结 首先是que ...

  4. 将Eclipse设置为黑色主题

    将Eclipse设置为黑色主题 觉得黑色的主题&配色很高大上,于是花了点时间实践出下面一种方法. 修改代码编辑区配色 修改整个软件主题 先上成果图: 但是进度条依旧是白色的,不知道怎么弄了╮( ...

  5. MapReduce内存调优

    内存调优 Hadoop处理数据时,出现内存溢出的处理方法?(内存调优) 1.Mapper/Reducer阶段JVM内存溢出(一般都是堆) 1)JVM堆(Heap)内存溢出:堆内存不足时,一般会抛出如下 ...

  6. Mobius

    Mobius 形式一 \[ f\left(n\right) = \sum_{d|n}g\left(d\right) \\ g\left(n\right) = \sum_{d|n}\mu\left(d\ ...

  7. ESA2GJK1DH1K微信小程序篇: 测试微信小程序扫描Air202上面的二维码绑定设备,并通过MQTT控制设备

    前言 一,微信小程序篇小程序下载(该功能为小程序篇基础功能源码) 实现功能概要 微信小程序通过扫描GPRS上的二维码,绑定GPRS设备.然后使用小程序通过GPRS远程控制开发板上的继电器, 远程显示单 ...

  8. url的组成部分

    /news/index.asp?boardID=5&ID=24618&page=1#name 协议:http: //为分隔符 域名:www.aspxfans.com :为域名和端口之间 ...

  9. CSPS_114

    考前自闭赛 综合我100场血的教训,我的考试策略应该是: 1.不要期望能AC某道题,想都不要想,否则很容易直接崩 2.哪怕想到正解,先打暴力,把暴力码出来!没用也码! 稳扎稳打地得到代码难度最小的下一 ...

  10. SDOI 二轮垫底鸡

    SDOI 二轮垫底鸡 day0 准备爆零 没啥好准备考试的,12.00出发,试机敲抄个ntt,在宾馆不知道颓啥. day1 爆零爬山 T1noip的题目也放到省选上. 第一档线段树?肯定不写,直接上1 ...