安装R的h5包
系统 redhat7
安装H5的包, 依赖系统hdf5包,如下安装完, 发现版本不一致,
sudo yum install hdf5-devel
解决办法: 移花接木
sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5_cpp.so.11 /usr/lib64/
sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5.so.10 /usr/lib64/
sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5_cpp.so.12 /usr/lib64/
批量处理
for f in `cat machines`; do ssh -t $f " sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5_cpp.so.11 /usr/lib64/; sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5.so.10 /usr/lib64/ ; sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5_cpp.so.12 /usr/lib64/"; done for f in `cat machines`; do ssh -t $f " sudo yum install hdf5-devel;echo \"install.packages('h5', repos='http://mirrors.aliyun.com/CRAN')\" | sudo R --no-save "; done
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