//使用appdomain获取当前应用程序集的执行目录
string dir = AppDomain.CurrentDomain.BaseDirectory;
//使用path获取当前应用程序集的执行的上级目录
dir = Path.GetFullPath("..");
//使用path获取当前应用程序集的执行目录的上级的上级目录
dir = Path.GetFullPath("../..");

其他的获取根目录路径方法可以参考博文 http://www.cnblogs.com/ching2009/p/4293597.html

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