Lander-Waterman model
参考:
这个模型是鸟枪法测序和基因组装的最基本的理论模型,它揭示了测序深度与覆盖度之间的关系。
该模型回答了一个最基本的问题:How many reads to we need to be sure we cover the whole genome?
Genome Sequencing - PPT
Chapter 5.1. Lander-Waterman Statistics for Shotgun Sequencing
这个模型是用来做基因组装的。
鸟枪法做了shotgun后,每个碱基被检测的概率是很小的,碱基长度长,
即 p小,n长,二次分布就近似为泊松分布。
在这个理论下,碱基期望深度,(就是每个碱基被检测的次数)为泊松分布的期望值u,基因组覆盖率为1-exp(-u)。
Lander-Waterman model的更多相关文章
- Evaluate|GC content|Phred|BAC|heterozygous single nucleotide polymorphisms|estimate genome size|
(Evaluate):检查reads,可使用比对软件:使用SOAPaligner重新排列:采用massively parallel next-generation sequencing technol ...
- Spring Boot笔记一
Spring Boot 入门 Spring Boot 简介 > 简化Spring应用开发的一个框架:> 整个Spring技术栈的一个大整合:> J2EE开发的一站式解决方案: 微服务 ...
- 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之二
[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之二 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 上一篇<[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一> ...
- 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之一
[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 之前一直看别人的源码,虽然对自己提升比较大,但毕竟不是自己写的,很容易遗 ...
- 详解树莓派Model B+控制蜂鸣器演奏乐曲
步进电机以及无源蜂鸣器这些都需要脉冲信号才能够驱动,这里将用GPIO的PWM接口驱动无源蜂鸣器弹奏乐曲,本文基于树莓派Mode B+,其他版本树莓派实现时需参照相关资料进行修改! 1 预备知识 1.1 ...
- 【AutoMapper官方文档】DTO与Domin Model相互转换(上)
写在前面 AutoMapper目录: [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(上) [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(中) [Au ...
- 拨开迷雾,找回自我:DDD 应对具体业务场景,Domain Model 到底如何设计?
写在前面 除了博文内容之外,和 netfocus 兄的讨论,也可以让你学到很多(至少我是这样),不要错过哦. 阅读目录: 迷雾森林 找回自我 开源地址 后记 毫无疑问,领域驱动设计的核心是领域模型,领 ...
- 使用mybatis-generator在自动生成Model类和Mapper文件
使用mybatis-generator插件可以很轻松的实现mybatis的逆向工程,即,能通过表结构自动生成对应的java类及mapper文件,可以大大提高工作效率,并且它提供了很多自定义的设置可以应 ...
- “RazorEngine.Templating.TemplateParsingException”类型的异常在 RazorEngine.NET4.0.dll 中发生,但未在用户代码中进行处理 其他信息: Expected model identifier.
这个问题是由于在cshtml中 引用了model这个单词 它可能和Model在解析时有冲突. 解决方法:把model换成别的单词就可以了.
- QT内省机制、自定义Model、数据库
本文将介绍自定义Model过程中数据库数据源的获取方法,我使用过以下三种方式获取数据库数据源: 创建 存储对应数据库所有字段的 结构体,将结构体置于容器中返回,然后根据索引值(QModelIndex) ...
随机推荐
- 9款一键快速搭建PHP运行环境的好工具
9款一键快速搭建PHP运行环境的好工具 胡倡萌 2011/02/19 网络资源 77,063 1 内容提要: 建立一个PHP网站,首先需要搭建PHP的开发和运行环境,对于PHP初学者也是一个难 ...
- Microsoft SQL Server 数据库服务器管理维护角色
固定服务器角色: 按照从最低级别的角色(bulkadmin)到最高级别的角色(sysadmin)的顺序进行描述: Bulkadmin:这个服务器角色的成员可以运行BULK INSERT语句.这条语句允 ...
- ecplise常用快捷键
常用 Ctrl+1 快速修复(最经典的快捷键,就不用多说了)Ctrl+D: 删除当前行 Ctrl+Alt+↓ 复制当前行到下一行(复制增加)Ctrl+Alt+↑ 复制当前行到上一行(复制增加)Alt+ ...
- ADB server didn't ACK
当我们通过eclipse开发Android应用时,会连接真机会使用模拟器进行仿真,有时候启动失败,会提示这样的错误. 工具/原料 Eclipse CMD命令窗口 方法/步骤 首先通过CMD启动adb服 ...
- 使用jquery-qrcode生成二维码
一.使用jquery-qrcode生成二维码 先简单说一下jquery-qrcode,这个开源的三方库(可以从https://github.com/jeromeetienne/jquery-qrcod ...
- Windows下的Objective-C集成开发环境(IDE)(转)
Objective-C是苹果软件的编程语言,想要上机学习.调试,有一个集成开发环境(IDE)方便很多.有三类方法搭建Objective-C的集成开发环境: 1) 使用苹果的平台,集成开发环境使用X ...
- JS事件
JS事件: 声明:为了事件对象event跨浏览器兼容: var oEvent==ev||event; 所以在下面用到 event 的地方都用 oEvent 代替 1)doucument的 ...
- Thinkphp学习回顾(二)之config.php的配置
常见配置项 <? return array( //'配置项'=>'配置值' 'TMPL_L_DELIM'=>'<{', //修改左定界符,防止其与js中的代码重合,发生造成问题 ...
- 我人生中的jQuery选择器
Jquery选择器 一.Jquery选择器简介 JavaScript只是一种运行于客户端,可以被客户端浏览器解析的一段代码.它和java没有任何关系.JavaScript简称JS.jQuery是对JS ...
- 自适应css 框架 PURE
Bootstrap 好用 但是太大啦 有时候只需要用到媒体查询这一块的样式 Pure.css可以很好地替代 直接上地址咯: http://purecss.io/ https://unpkg.com/p ...