参考:

Lander-Waterman Model

这个模型是鸟枪法测序和基因组装的最基本的理论模型,它揭示了测序深度与覆盖度之间的关系。

该模型回答了一个最基本的问题:How many reads to we need to be sure we cover the whole genome?

Genome Sequencing - PPT

Chapter 5.1. Lander-Waterman Statistics for Shotgun Sequencing

这个模型是用来做基因组装的。
鸟枪法做了shotgun后,每个碱基被检测的概率是很小的,碱基长度长,
即 p小,n长,二次分布就近似为泊松分布。
在这个理论下,碱基期望深度,(就是每个碱基被检测的次数)为泊松分布的期望值u,基因组覆盖率为1-exp(-u)。

Lander-Waterman model的更多相关文章

  1. Evaluate|GC content|Phred|BAC|heterozygous single nucleotide polymorphisms|estimate genome size|

    (Evaluate):检查reads,可使用比对软件:使用SOAPaligner重新排列:采用massively parallel next-generation sequencing technol ...

  2. Spring Boot笔记一

    Spring Boot 入门 Spring Boot 简介 > 简化Spring应用开发的一个框架:> 整个Spring技术栈的一个大整合:> J2EE开发的一站式解决方案: 微服务 ...

  3. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之二

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之二 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 上一篇<[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一> ...

  4. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之一

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 之前一直看别人的源码,虽然对自己提升比较大,但毕竟不是自己写的,很容易遗 ...

  5. 详解树莓派Model B+控制蜂鸣器演奏乐曲

    步进电机以及无源蜂鸣器这些都需要脉冲信号才能够驱动,这里将用GPIO的PWM接口驱动无源蜂鸣器弹奏乐曲,本文基于树莓派Mode B+,其他版本树莓派实现时需参照相关资料进行修改! 1 预备知识 1.1 ...

  6. 【AutoMapper官方文档】DTO与Domin Model相互转换(上)

    写在前面 AutoMapper目录: [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(上) [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(中) [Au ...

  7. 拨开迷雾,找回自我:DDD 应对具体业务场景,Domain Model 到底如何设计?

    写在前面 除了博文内容之外,和 netfocus 兄的讨论,也可以让你学到很多(至少我是这样),不要错过哦. 阅读目录: 迷雾森林 找回自我 开源地址 后记 毫无疑问,领域驱动设计的核心是领域模型,领 ...

  8. 使用mybatis-generator在自动生成Model类和Mapper文件

    使用mybatis-generator插件可以很轻松的实现mybatis的逆向工程,即,能通过表结构自动生成对应的java类及mapper文件,可以大大提高工作效率,并且它提供了很多自定义的设置可以应 ...

  9. “RazorEngine.Templating.TemplateParsingException”类型的异常在 RazorEngine.NET4.0.dll 中发生,但未在用户代码中进行处理 其他信息: Expected model identifier.

    这个问题是由于在cshtml中 引用了model这个单词  它可能和Model在解析时有冲突. 解决方法:把model换成别的单词就可以了.

  10. QT内省机制、自定义Model、数据库

    本文将介绍自定义Model过程中数据库数据源的获取方法,我使用过以下三种方式获取数据库数据源: 创建 存储对应数据库所有字段的 结构体,将结构体置于容器中返回,然后根据索引值(QModelIndex) ...

随机推荐

  1. WebAPI使用多个xml文件生成帮助文档

    一.前言 上篇有提到在WebAPI项目内,通过在Nuget里安装(Microsoft.AspNet.WebApi.HelpPage)可以根据注释生成帮助文档,查看代码实现会发现是基于解析项目生成的xm ...

  2. Web 播放声音(AMR 、WAVE)

    最近甚是苦闷,属于边学边做,跳进了很多坑,别提有多惨了,不过结果还是不错滴,纵观前后,一句话足以概括 “痛并快乐着” ~~~ ok,我少说废话,下面来总结下 Web 播放声音一些注意事项. 说到 We ...

  3. linux 使用/proc文件系统 实现用户空间与内核模块之间通信

    项目中可能会用到用户态和内核模块之间进行通信的功能.想到linux系统本身很多通信都是通过/proc文件系统来的,比如修改网络中连接跟踪表连接数限制/proc/sys/net/netfilter/nf ...

  4. XE5 修复 安卓 输入法隐藏 后 无法退出的问题 3.2

    欢迎到  ① FireMonkey[DELPHI XE5]  165232328 交流开发技术. (************************************************** ...

  5. 踢爆IT劣书出版黑幕——由清华大学出版社之《C语言入门很简单》想到的(1)

    1.前言与作者 首先声明,我是由于非常偶然的机会获得<C语言入门很简单>这本书的,绝对不是买的.买这种书实在丢不起那人. 去年这书刚出版时,在CU论坛举行试读推广,我当时随口说了几句(没说 ...

  6. SSO

  7. 在64位SQL Server中创建Oracle的链接服务器

    当我们同时使用SQL Server和Oracle来存储数据时,经常会用到跨库查询.为了方便使用跨库查询,一个最好的办法就是通过创建链接服务器来实现.既可以在SQL Server中创建Oracle的链接 ...

  8. python学习笔记之基础一(第一天)

    1. python字符介绍 在C语言中没有字符串,只有字符 在python中的字符串hello,在C语言中是以字符数组在内存存放['h','e','l','l','o'],如果对字符串修改,则是在内存 ...

  9. IIS Express 配置外部访问

    IIS Express是Visual Stuido自带的微型Web服务器,简单易用. IIS Express默认只允许本机访问,通过Visual Studio调试Web程序时,我们有时需要通过外部访问 ...

  10. 在XP上安装WinPython最新版本

    2015年3月30日星期一 16:01:47     晴 WinPython 新版本不再支持Windows XP平台,会出现错误提示WindowsError 127. 按照官网论坛上的解决方案(htt ...